Molecular polarization effects on the relative energies of the real and putative crystal structures of valine

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 4, Issue 10, 2008, Pages 1795-1805

  Cooper, Timothy G ^a   Hejczyk, Katarzyna E ^a   Jones, William ^a   Day, Graeme M ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 58149174053     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct800195g     Document Type: Article

References (47)

1. Chemburkar, S. R.; Bauer, J.; Deming, K.; Spiwek, H.; Patel, K.; Moms, J.; Henry, R.; Spanton, S.; Dziki, W.; Porter, W.; Quick, J.; Bauer, P.; Donaubauer, J.; Narayanan, B. A.; Soldani, M.; Riley, D.; McFarland, K, Org. Process Res. Dev. 2000, 4, 413-417.
2. Morissette, S. L.; Almarsson, Ö.; Peterson, M. L.; Remenar, J. F.; Read, M. J.; Lemmo, A. V.; Ellis, S.; Cima, M. J.; Gardner, C. R. Adv. Drug Delivery Rev. 2004, 56, 275-300.
3. Day, G. M.; Motherwell, W. D. S.; Amnion, H. L.; Boerrigter, S. X. M.; Delia Valle, R. G.; Venuti, E.; Dzyabchenko, A.; Dunitz, J. D.; Schweizer, B.; van Eijck, B. P.; Erk, P.; Facelli, J. C.; Bazterra, V. E.; Ferraro, M. B.; Hofmann, D. W. M.; Leusen, F. J. J.; Liang, C.; Pantelides, C. C.; Karamertzanis, P. G.; Price, S. L.; Lewis, T. C.; Nowell, H.; Torrisi, A.; Scheraga, H. A.; Arnautova, Y. A.; Schmidt, M. U.; Verwer, P. Acta Crystallogr. B 2005, 67, 511-527.
4. Day, G. M.; Chisholm, J.; Shan, N.; Motherwell, W. D. S.; Jones, W. Cryst. Growth Des. 2004, 4, 1327-1340.
5. Day, G. M.; Motherwell, W. D. S.; Jones, W. Cryst. Growth Des. 2005, 5, 1023-1033.
6. Görbitz, C. H. J. Mol. Struct.-THEOCHEM 2006, 775, 9-17.
7. Allen, F. H. Acta Crystallogr. B 2002, 58, 380-388.
8. Spackman, M. A.; Munshi, P.; Dittrich, B. ChemPhysChem 2007, 8, 2051-2063.
9. Banks, J. L.; Kaminski, G. A.; Zhou, R. H.; Mainz, D. T.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 741-754.
10. Patel, S.; Brooks, C. L., III J. Comput. Chem. 2004, 25, 1-15.
11. Applequist, J. J. Chem. Phys. 1985, 83, 809-826.
12. Stone, A. J. Chem. Phys. Lett. 1989, 155, 102-110.
13. Misquitta, A. J.; Stone, A. J.; Price, S. L. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 19-32.
14. Misquitta, A. J.; Stone, A. J. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 7-18.
15. Welch, G. W. A.; Karamertzanis, P. G.; Misquitta, A. J.; Stone, A. J.; Price, S. L. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 522-532.
16. Cossi, M; Barone, V.; Mennucci, B.; Tomasi, J. Chem. Phys. Lett. 1998, 286, 253.
17. Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Chem. Phys. 1997, 106, 5151.
18. Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Barone, V. J. Chem. Phys. 2002, 117, 43-45.
19. Cooper, T. G.; Jones, W.; Motherwell, W. D. S.; Day, G. M. CrystEngComm 2007, 9, 595-602.
20. Mallikarjunan, M.; Rao, S. T. Acta Crystallogr. B 1969, 25, 296.
21. Dalhus, B.; Görbitz, C. H. Acta Crystallogr. C 1996, 52, 1759.
22. Dalhus, B.; Görbitz, C. H. Acta Chem. Scand. 1996, 50, 544.
23. Day, G. M.; Motherwell, W. D. S.; Jones, W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 1693-1704.
24. Delley, B. J. Chem. Phys. 1990, 92, 508-517.
25. MS Modelling, release 3.0.1; Accelrys Inc.: San Diego, U.S.A., 2004.
26. Karamertzanis, P. G.; Pantelides, C. C. J. Comput. Chem. 2004, 26, 304-324.
27. Cambridge Structural. Database - Space Group Statistics Web page. http://www.ccdc.cam.ac.uk/products/csd/statistics/space-group-stats.php4 (accessed January 3, 2008).
28. Williams, D. E.; Cox, S. R. Acta Crystallogr. B 1984, 40, 404-417.
29. Cox, S. R.; Hsu, L.-Y.; Williams, D. E. Acta Crystallogr. A 1981, 37, 293-301.
30. Coombes, D. S.; Price, S. L.; Willock, D. J.; Leslie, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 7352-7360.
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitar, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.: Knox, J. W.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.: Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J.; Ayalla, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian03; Gaussian Inc.: Wallingford, CT, 2004.
32. Stone, A. J. GDMA: Distributed Multipole Analysis of Gaussian Wavefunctions, version 2.2.; University of Cambridge: 2005.
33. Stone, A. J. Chem. Phys. Lett. 1981, 83, 233-239.
34. Stone, A. J.; Alderton, M. Mol. Phys. 1985, 56, 1047-1064.
35. Price, S, L.; Willock, D. J.; Leslie, M.; Day, G. M. DMAREL, version 4.1.1; 2001.
36. Dauber-Osguthorpe, P.; Roberts, V. A.; Osguthrope, D. J.; Wolff, J.; Genest, M.; Hagler, A. T. Proteins 1988, 4, 31-47.
37. Sun, H. J. Phys. Chem. 1998, 102, 7338.
38. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8897-8909.
39. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024-10035.
40. Gasteiger, J.; Marsili, M. Tetrahedron 1980, 36, 3219.
41. Chisholm, J.; Motherwell, S. J. Appl. Crystallogr. 2005, 38, 228-231.
42. Kozhin, V. Kristallografiya 1978, 23, 1211-1215.
43. Flaig, R. Ph.D. Thesis, Freie Universität Berlin, Berlin, 2000.
44. Handbook of Chemistry and Physics, 72nd ed.; CRC Press: Boston, MA, 1992; pp 12-38.
45. Misoguti, L.; Varela, A. T.; Nunes, F. D.; Bagnato, V. S.; Melo, F. E. A.; Mendes Filho, J.; Zilio, S. C. Opt. Mater. 1996, 6, 147-152.
46. Rodrigues Jr., J. J.; Misoguti, L.; Nunes, F. D.; Mendonça, C. R.; Zilio, S. C. Opt. Mater 2003, 22, 235-240.
47. Tulip, P. R.; Clark, S. J. Phys. Rev. B 2006, 74, 064301.