Nuclear magnetic shielding of the113Cd(II) ion in aqua solution: A combined molecular dynamics/density functional theory study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 36, 2008, Pages 11347-11352

  Li, Xin ^a,b   Rinkevicius, Zilvinas ^a   Tu, Yaoquan ^c   Tian, He ^b   Ågren, Hans ^a  

^a ROYAL INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (Sweden)

^b EAST CHINA UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY   (China)

^c ÖREBRO UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYNAMICS; MAGNETIC SHIELDING; MOLECULAR DYNAMICS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION; QUANTUM CHEMISTRY; SHIELDING;

MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION; NUCLEAR MAGNETIC SHIELDING;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 52349102051     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp802238f     Document Type: Article

References (68)

1. (a) Öz, G.; Pountney, D. L.; Armitage, I. M. Biochem. Cell Biol. 1998, 76, 223.
2. (b) Srikanth, K.; Schurko, R. W.; Hung, I.; Ramamoorthy, A. Mater. Sci. Technol. 2003, 19, 1191.
3. (a) Cardin, A. D.; Ellis, P. D.; Odom, J. D.; Howard, J. W., Jr. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 1672.
4. (b) Armitage, I. M.; Pajer, R. T.; Uiterkamp, A. J. M. S.; Chelebowski, J. F.; Coleman, J. E. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 5710.
5. (c) Ellis, P. D. Science 1983, 227, 1141.
6. (d) Marchetti, P. S.; Ellis, P. D.; Bryant, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 8191.
7. (e) Ellis, P. D. J. Biol. Chem. 1989, 264, 3108.
8. Summers, M. F. Coord. Chem. Rev. 1988, 86, 43.
9. (a) Cheung, T. T. P.; Worthington, L. E.; Murphy, P. D.; Gerstein, B. C. J. Magn. Reson. 1980, 41, 158.
10. (b) Murphy, P. D.; Gerstein, B. C. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 3282.
11. (c) Miner, V. W.; Prestegard, J. H. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 2177.
12. (d) Ackerman, M. J. B.; Ackerman, J. J. H. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 6413.
13. (e) Marchetti, P. S.; Bank, S.; Bell, T. W.; Kennedy, M. A.; Ellis, P. D. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 2063.
14. (f) Kennedy, M. A.; Sessler, J. L.; Murai, T.; Ellis, P. Di Inorg. Chem. 1990, 29, 1050.
15. (g) Larive, C. K.; Rogers, A.; Morton, M.; Carper, W. R. Environ. Sci. Technol. 1996, 30, 2828.
16. (a) Honkonen, R. S.; Doty, F. D.; Ellis, P. D. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 4163.
17. (b) Honkonen, R. S.; Ellis, P. D. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 5488.
18. (c) Ganapathy, S.; Chacko, V. P.; Bryant, R. G. J. Chem. Phys. 1984, 81, 661.
19. (d) Honkonen, R. S.; Marchetti, P. S.; Ellis, P. D. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 912.
20. (e) Marchetti, P. S.; Honkonen, R. S.; Ellis, P. D. J. Magn. Reson. 1987, 71, 294.
21. (f) Griffith, E. A. H.; Charles, N. G.; Lewinski, K.; Amma, E. L.; Rodesiler, P. F. Inorg. Chem. 1987, 26, 3983.
22. (g) Kennedy, M. A.; Ellis, P. D.; Jakobsen, H. J. Inorg. Chem. 1990, 29, 550.
23. (h) Rivera, E.; Kennedy, M. A.; Adams, R. D.; Ellis, P. D. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 1400.
24. (i) Subramanian, R.; Govindaswamy, N.; Santos, R. A.; Koch, S. A.; Harbison, G. S. Inorg. Chem. 1998, 37, 4929.
25. Helgaker, T.; Jaszuński, M.; Ruud, K. Chem. Rev. 1999, 99, 293.
26. de Dios, A. C.; Oldfield, E. Solid State NMR 1996, 6, 101.
27. (a) Brender, J. R.; Taylor, D. M.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 914.
28. (b) Birn, J.; Poon, A.; Mao, Y.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8529.
29. (c) Poon, A.; Birn, J.; Ramamoorthy, A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 16577.
30. Nakatsuji, H.; Kanda, K.; Endo, K.; Yonezawa, T. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 4653.
31. Nakatsuji, H.; Nakao, T.; Kanda, K. Chem. Phys. 1987, 118, 25.
32. Ellis, P. D.; Odom, J. D.; Lipton, A. S.; Gulick, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 755.
33. Higashioji, T.; Hada, M.; Sugimoto, M.; Nakatsuji, H. Chem. Phys. 1996, 203, 159.
34. (a) Kidambi, S. S.; Ramamoorthy, A. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10363.
35. (b) Kidambi, S. S.; Ramamoorthy, A. Inorg. Chem. 2003, 42, 2200.
36. (c) Kidambi, S. S.; Lee, D.-K.; Ramamoorthy, A. Inorg. Chem. 2003, 42, 3412.
37. Hemmingsen, L.; Olsen, L.; Antony, J.; Sauer, S. P. A. J. Biol. Inorg. Chem. 2004, 9, 591.
38. Krauss, M.; Olsen, L.; Antony, J.; Hemmingsen, L. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 9446.
39. Kello, V.; Sadlej, A. J. Theor. Chim. Acta 1995, 91, 353.
40. (a) Manninen, P.; Lantto, P.; Vaara, J.; Ruud, K. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2623.
41. (b) Manninen, P.; Ruud, K.; Lantto, P.; Vaara, J. J. Chem. Phys. 2005, 122, 114107; Erratum, 2006, 124, 149901.
42. (c) Vaara, J.; Manninen, P.; Lantto, P. In Calculation of NMR and EPR Parameters. Theory and Applications; Kaupp, M., Bühl, M., Malkin, V. G., Eds.; WILEY-VCH: Weinheim, 2004; Charpter 13, p 209.
43. (a) Eggenberger, R.; Gerber, S.; Huber, H.; Searles, D.; Welker, M. J. Chem. Phys. 1992, 97, 5898.
44. (b) Eggenberger, R.; Gerber, S.; Huber, H.; Searles, D.; Welker, M. Mol. Phys. 1993, 80, 1177.
45. (c) Eggenberger, R.; Gerber, S.; Huber, H.; Searles, D.; Welker, M. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1553.
46. (d) Malkin, V. G.; Malkina, O. L.; Steinebrunner, G.; Huber, H. Chem.-Eur. J. 1996, 2, 452.
47. (e) Hardy, E. H.; Müller,M. G.; Vogt, P. S.; Bratschi, C.; Kirchner, B.; Huber, H.; Searles, D. J. J. Chem. Phys. 2003, 119, 6184.
48. (a) Pennanen, T. S.; Vaara, J.; Lantto, P.; Sillanpää, A. J.; Laasonen, K.; Jokisaari, J. J. Am. Soc. Chem. 2004, 126, 11093.
49. (b) Pennanen, T. S.; Lantto, P.; Sillanpää, A. J.; Vaara, J. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 182.
50. (a) Bühl, M.; Parrinello, M. Chem.-Eur. J. 2001, 7, 4487.
51. (b) Bühl, M.; Mauschick, F. T. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 5508.
52. (c) Bühl, M. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10505.
53. (d) Bühl, M. Inorg. Chem. 2005, 44, 6277.
54. Vailikhit, V.; Treesuwan, W.; Hannongbua, S. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2007, 806, 99.
55. Yazyev, O. V.; Helm, L.; Malkin, V. G.; Malkina, O. L. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 10997.
56. Helgaker, T.; Wilson, P. J.; Amos, R. D.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2983.
57. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
58. van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; van Buuren, A. R.; Apol, E.; Meulenhoff, P. J.; Tieleman, D. P.; Sijbers, A. L. T. M.; Feenstra, K. A.; van Drunen, R.; Berendsen, H. J. C. Gromacs User Manual; version 3.2, 2004; www.gromacs.org.
59. Lamoureux, G.; Mackerell, A. D., Jr.; Roux, B. J. Chem. Phys. 2003, 119, 5185.
60. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian03; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
61. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
62. Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577.
63. DALTON; release 2.0, http://www.kjemi.uio.no/software/dalton/ dalton.html, 2005.
64. Fægri, K., Jr.http://folk.uio.no/knutf/bases/one. (accessed Nov. 12, 2007)
65. (a) Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
66. (b) Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Chem. Phys. 1994, 98, 11623.
67. Jorgensen, P.; Olsen, J. J. Chem. Phys. 1985, 82, 3235.
68. Ohtaki, H.; Radnai, T. Chem. Rev. 1993, 93, 1157.