Average electron tunneling route of the electron transfer in protein media

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 32, 2008, Pages 9948-9958

  Nishioka, Hirotaka ^a   Kakitani, Toshiaki ^a  

^a MEIJO UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRON TRANSFER; ELECTRONIC FACTORS; INTERFERENCE EFFECTS; TUNNELING CURRENTS;

TUNNELING (EXCAVATION);

EID: 50549083141     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp710689s     Document Type: Article

References (56)

1. McConnell, H. M. J. Chem. Phys. 1961, 35, 508.
2. Moser, G. G.; Keske, J. M.; Warncke, K.; Farid, R. S.; Dutton, P. L. Nature 1992, 355, 796.
3. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
4. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1987, 86, 4488.
5. Newton, M. D. Chem. Rev. 1991, 91, 767.
6. Skourtis, S. S.; Beratan, D. N. Adv. Chem. Phys. 1999, 106, 311.
7. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 105, 10819.
8. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1997, 107, 6495.
9. Gehlen, J. N.; Daizadeh, I.; Stuchebrukhov, A. A.; Marcus, R. A. Inorg. Chim. Acta 1996, 243, 271.
10. Okada, A.; Kikitani, T.; Inoue, J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 2946.
11. Stuchebrukhov, A. A. Adv. Chem. Phys. 2001, 118, 1.
12. Stuchebrukhov, A. A. Theor. Chem. Ace. 2003, 110, 291.
13. Bixon, M; Jortner, J. Adv. Chem. Phys. 1999, 106, 35.
14. Winkler, J. R. Curr. Opin. Chem. Biol. 2000, 4, 192.
15. Beratan, D. N.; Betts. J. N.; Onuchic. J. N. Science 1991, 252, 1285.
16. Beratan, D. N.; Betts, J. N.; Onuchic. J. N. J. Phys. Chem. 1992, 96, 2852.
17. Regan, J. J.; Risser, S. M.; Beratan, D. N.; Onuchic, J. N. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13083.
18. Regan, J. J.; Di Bilio, A. J.; Langen, R.; Skov. L. K.; Winkler, J. R.; Gray, H. B.; Onuchic, J. N. Chem. Biol. 1995, 2, 489.
19. Regan, J. J.; Onuchic, J. N. Adv. Chem. Phys. 1999, 107, 497.
20. Kawatsu, T.; Kakitani. T.; Yamato, T. lnorg. Chim. Ada 2000, 300-302, 862.
21. Kawatsu, T.; Kakitani. T.; Yamato, T. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 4424.
22. Skourtis, S. S; Beratan, D. N. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1215.
23. Page, C. G.; Moser, C. G.; Chen, X.; Dutton, P. L. Nature 1999, 402, 47.
24. Jones, M. L.; Kurnikov, I. V.; Beratan, D. N. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 2002.
25. Daizadeh, I.; Medvedev, E. S.; Stuchebrukhov, A. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 3703.
26. Wolfgang, J.; Risser, S. M.; Priyadarshy, S.; Beratan, D. N. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 2986.
27. Balabin, I. A.; Onuchic, J. N. Science 2000, 290, 114.
28. Kawatsu, T.; Kakitani, T.; Yamato, T. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 11356.
29. Nishioka, H.; Kimura, A.; Yamato, T.; Kawatsu, T.; Kakitani, T. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 1078.
30. Prytkova, T. R.; Kurnikov, I. V.; Beratan, D. N. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 1618.
31. Prytkova, T. R.; Kurnikov, I. V.; Beratan, D. N. Science 2007, 315, 622.
32. Medvedev, E. S.; Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1997, 107, 3821.
33. Tang, J. J. Chem. Phys. 1993, 98, 6263.
34. Bixon, M.; Jortner, J. Russian Journal of Electronchemistry. 2003, 59, 3.
35. Troisi, A.; Nitzan, A.; Ratner, M. A. J. Chem. Phys. 2003, 119, 5782.
36. Skourtis, S. S.; Balabin, I. A.; Kawatsu, T.; Beratan, D. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 3552.
37. Nishioka, H.; Kimura, A.; Yamato, T.; Kawatsu, T.; Kakitani, T. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 15621.
38. Nishioka, H.; Yamato, T.; Kakitani, T. Mol. Simul. 2006, 32, 727.
39. Katz, D. J.; Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 4960.
40. Kawatsu, T.; Kakitani. T.; Yamato, T. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5068.
41. Stowell, M. H. B.; McPhillips, T. M.; Rees, D. C.; Soltis, S. M.; Abresch, E.; Feher, G. Science 1997, 276, 812.
42. Morikami, K.; Nakai, T.; Kidera, A.; Saito, M.; Nakamura, H. Comput. Chem. 1992, 16, 243 PRESTO(A vectorized molecular mechanics program for biopolymers)
43. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, G. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
44. Saito, M. Mol. Simul. 1992, 8, 321.
45. Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. G. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327.
46. Howell, J.; Rossi, A.; Wallace, D.; Haraki, K.; Hoffmann, R. QCPE 1977, 11, 344 FORTICON8 (Extended Hückel method program)
47. Kincaid, D. R.; Respess, J. R.; Young, D. M.; Grimes, R. G. ITPACK 2C; University of Texas: Austin, TX, 1999 (a fortran package for solving large sparse linear system by adaptive accelerated iterative memods).
48. Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 1989, 10, 209.
49. Frisch, J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman,J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A.; Jr. Stratmann, R. E.; Burant, J. G.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. G.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, G.; Adamo, G.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, G. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Gonzalez, G.; Head Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian98, revisionA.9; Gaussian, Inc.; Pittsburgh, PA, 1998.
50. Anderson, A. B.; Grantscharova, E. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9149.
51. Koepke, J.; Krammer, E.-M.; Klingen, A. R.; Sebban, P.; Ullmann, G. M.; Fritzsch, G. J. Mol. Biol. 2007, 371, 396.
52. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalus, I. G. Biochemistry 1975, 14, 5355.
53. Frauenfelder, H.; Parak, F.; Young, R. D. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1988, 17, 451.
54. Yang, H.; Luo, G.; Karnchanaphanurach, P.; Louie, T-M.; Rech, I.; Cova, S.; Xun, L.; Xie, X. S. Science 2003, 302, 262.
55. Gunner, M. R.; Dutton, L. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 3400.
56. Humphrey, W. F.; Dalke, A.; Schulten, K. J. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33.