Worm model for electron tunneling in proteins: Consolidation of the pathway model and the Dutton plot

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 105, Issue 19, 2001, Pages 4424-4435

  Kawatsu, Tsutomu ^a   Kakitani, Toshiaki ^a   Yamato, Takahisa ^a  

^a NAGOYA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC DENSITY; DUTTON PLOT; WORM MODEL;

ATOMS; COMPUTER SIMULATION; ELECTRON TRANSPORT PROPERTIES; ELECTRON TUNNELING; MATHEMATICAL MODELS;

PROTEINS;

EID: 0035902349     PISSN: 10895647     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp003918l     Document Type: Article

References (36)

1. Beratan, D. N.; Onuchic, J. N.; Hopfield, J. J. J. Chem. Phys. 1987, 86, 4488.
2. Onuchic, J. N.; Beratan, D. N.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992, 21, 349.
3. Regan, J. J.; Bilio, A. J. D.; Langen, R.; Skov, L. K.; Winkler, J. R.; Gray, H. B.; Onuchic, J. N. Chem. Biol. 1995, 2, 489.
4. Regan, J. J.; Onuchic, J. N. Electron Transfer: From Isolated Molecules to Biomolecules, Part Two; Jortner, J., Bixon, M., Eds.; John Wiley & Sons: New York, 1999; p 467.
5. de Andrade, P. C. P.; Onuchic, J. N. J. Chem. Phys. 1998, 108, 4292.
6. Wuttke, D. S.; Bjerrum, M. J.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1992, 256, 1007.
7. Casimiro, D. R.; Richards J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13073.
8. Langen, R.; Chang, I.-J.; Richard, J. H.; Winker, J. R.; Gray, H. B. Science 1995, 268, 1733.
9. Gray, H. B.; Winkler, J. R. Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 537.
10. Moser, C. C.; Keske, J. M.; Warnucke, K.; Farid, R. S.; Dutton, P. L. Nature 1992, 335, 796.
11. Page, C. C.; Moser, C. C.; Chen, X.; Dutton, P. L. Nature 1999, 402, 47.
12. Siddarth, P.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1990, 94, 8430.
13. Siddarth, P.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 2440.
14. Siddarth, P.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 6111.
15. Siddarth, P.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13078.
16. Stucherbrukhov, A. A. Chem. Phys. Lett. 1994, 225, 55.
17. Stuchebrukhov, A. A.; Marcus, R. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 7581.
18. Gehlen, J. N.; Daizadeh, I.; Stuchebrukhov, A. A.; Marcus, R. A. Inorg. Chim. Acta 1996, 243, 271.
19. Okada, A.; Kakitani, T.; Inoue, J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 2946.
20. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 105, 10819.
21. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1997, 107, 6495.
22. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8424.
23. Cheung, M. S.; Daizedeh, I.; Stuchebrukhov, A. A.; Heelis, P. F. Biosphys. J. 1999, 76, 1241.
24. Kawatsu, T.; Kakitani, T.; Yamato, T. Inorg. Chim. Acta 2000, 300-302, 862.
25. Humphrey, W. F.; Dalke, A.; Schulter K. J. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33.
26. Bonander, N.; Väanngård, T.; Tsai, L.-C.; Langer, V.; Nar, H.; Sjölin, L. Proteins 1997, 27, 385.
27. Adam, E. T.; Jensen, L. H. Isr. J. Chem. 1981, 21, 8.
28. Adman, E. T.; Stenkamp, R. E.; Sieker, L. C.; Jensen, L. H. J. Mol. Biol. 1978, 124, 35.
29. Reddy, K. B.; Chom, M.-o. P.; Wishart, J. F.; Emge, T. J.; Isied, T. J. S. Inorg. Chem. 1996, 35, 7241.
30. Morikami, K.; Nakai, T.; Kidera, A.; Saito, M.; Nakamura, H. PRESTO (A vectorized molecular mechanics program for biopolymers). Comput. Chem. 1992, 16, 243.
31. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
32. Geremia, S.; Calligaris, M. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1997, 1541.
33. Ungar, L. W.; Scherer, N. F.; Voth, G. A. Biophys. J. 1997, 72, 5.
34. Howell J.; Rossi, A.; Wallace, D.; Haraki, K.; Hoffman, R. FORTICON8 (Extend Hükel method program). QCPE 1977, 11, 344.
35. Kincaid, D. R.; Respess, J. R.; Young, D. M.; Grimes, R. G. ITPACK, version 2C; a Fortran package for solving large space linear system by adaptive accelerated iterative methods; Center for Numerical Analysis: University of Texas, 1999.
36. Kawatsu, T.; Kakitani, T.; Yamato, T. unpublished results.