Fluorescence detection of protein/Z-DNA interactions

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 25, Issue 9, 2004, Pages 1430-1432

  Kim, Doing Jin ^b   Oh, Doo Byoung ^c   Lee, Seon Min ^a   Choi, Insung S ^b   Kim, Yang Gyun ^a  

^a Chung Ang University   (South Korea)

^b Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST)   (South Korea)

^c ISU Chemical Co Ltd   (South Korea)

Author keywords

Fluorescence detection; Glutathione S transferase (GST); Polyvalency; Z DNA; Z DNA binding protein

Indexed keywords

DNA BINDING PROTEIN; DNA Z;

ARTICLE; FLUORESCENCE; GEL MOBILITY SHIFT ASSAY; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN DNA BINDING; PROTEIN DNA INTERACTION; SURFACE PLASMON RESONANCE;

EID: 4644360325     PISSN: 02532964     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2004.25.9.1430     Document Type: Article

References (25)

1. Wang, A. H.-J.; Quigley, G. J.; Kolpak, F. J.; Crawford, J. I.; van Boom, J. H.; van der Marel, G.; Rich, A. Nature 1979, 282, 680.
2. Pohl, F. M.; Jovin, T. M. J. Mol. Biol. 1972, 67, 375.
3. (a) Behe, M.; Felsenfeld, G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1981, 78, 1619.
4. (b) Möller, A.; Nordheim, A.; Kozlpwski, S. A.; Patel, D. J.; Rich, A. Biochemistry 1984, 23, 54.
5. Peck, L. J.; Nordheim, S.; Rich, A.; Wang, J. C. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1982, 79, 4560.
6. Herbert, A.; Alfken, J.; Kim, Y.-G.; Mian, I. S.; Nishikura, K.; Rich, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 8421.
7. Kim, Y.-G.; Muralinath, M.; Brandt, T.; Pearcy, M.; Hauns, K.; Lowenhaupt, K.; Jacobs, B. L.; Rich, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2003, 100, 6974.
8. (a) Rich, A.; Zhang, S. Nature Rev. 2003, 4, 566.
9. (b) Xu, Y.; Zhang, Y. X.; Sugiyama, H.; Umano, T.; Osuga, H.; Tanaka, K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6566.
10. (a) Schwartz, T.; Rould, M.; Lowenhaupt, K.; Herbert, A.; Rich, A. Science 1999, 284, 1841.
11. (b) Scwartz, T.; Loewenhaupt, K.; Kim, Y.-G.; Li, L.; Brown, B. A., II; Herbert, A.; Rich, A. J. Biol. Chem. 1999, 274, 2899.
12. Mammen, M.; Choi, S.-K.; Whitesides, G. M. Angew. Chem. Int. Ed. 1998, 37, 2757.
13. (a) Cowburn, D.; Zheng, J.; Xu, Q.; Barany, G. J. Biol. Chem. 1995, 270, 26738.
14. (b) Shuker, S. B.; Hajduk, P. J.; Meadows, R. P.; Fesik, S. W. Science 1996, 274, 1531.
15. (c) Maly, D. J.; Choong, I. C.; Ellman, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2000, 97, 2419.
16. (d) Profit, A. A.; Lee, T. R.; Niu, J.; Lawrence, D. S. J. Biol. Chem. 2001, 276, 9446.
17. (e) Jahnke, W.; Florsheimer, A.; Blommers, M. J.; Paris, C. G.; Heim, J.; Nalin, C. M.; Perez, L. B. Curr. Top. Med. Chem. 2003, 3, 69.
18. (f) Erlanson, D. A.; Lam, J. W.; Wiesmann, C.; Luong, T. N.; Simmons, R. L.; DeLano, W. L.; Choong, I. C.; Burdett, M. T.; Flanagan, W. M.; Lee, D.; Gordon, E. M.; O'Brien, T. Nat. Biotechnol. 2003, 3, 308.
19. (g) Braisted, A. C.; Oslob, J. D.; Delano, W. L.; Hyde, J.; McDowell, R. S.; Waal, N.; Yu, C.; Arkin, M. R.; Raimundo, B. C. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 3714.
20. (h) Bachhawat-Sikder, K.; Kodadek, T. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9550.
21. (a) Park, T. J.; Lee, K.-B.; Lee, S. J.; Park, J. P.; Lee, Z.-W.; Lee, S. Y.; Choi, I. S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10512.
22. (b) Lee, K.-B.; Kim, D. J.; Lee, Z.-W.; Woo, S. I.; Choi, I. S. Langmuir 2004, 20, 2531.
23. (c) Park, J. P.; Lee, S. J.; Park, T. J.; Lee, K.-B.; Choi, I. S.; Lee, S. Y.; Kim, M.-G.; Chung, B. H. Biotechnol. Bioprocess Eng. 2004, 9, 137.
24. (d) Lee, K.-B.; Yoon, K. R.; Woo, S. I.; Choi, I. S. J. Pharm. Sci. 2003, 92, 933.
25. Lee, K.-B.; Lee, Y-W.; Kim, D. J.; Lee, S.; Woo, S. I.; Kim, Y.; Kim, Y-G.; Choi, I. S. Bull. Korean Chem. Soc. 2003, 24, 1702.