Charge model 4 and intramolecular charge polarization

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 3, Issue 6, 2007, Pages 2046-2054

  Olson, Ryan M ^a   Marenich, Aleksandr V ^a   Cramer, Christopher J ^a   Truhlar, Donald G ^a  

^a University of Minnesota   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 36649020262     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct7001607     Document Type: Article

References (68)

1. MacKerell, A. D. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1584.
2. Jorgensen, W. L.; Tirado-Rives, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 6665.
3. Vizcarra, C. L.; Mayo, S. L. Curr. Opin. Chem. Biol. 2005, 9, 622.
4. Tucker, S. C.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 164.
5. Still, W. C.; Tempczyk, A.; Hawley, R. C.; Hendrickson, T. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 6127.
6. Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8305.
7. Kelly, C. P.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 1133.
8. Storer, J. W.; Giesen, D. J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Comput.-Aided Mol Des. 1995, 9, 87.
9. Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833.
10. Baker, J. Theor. Chim. Acta 1985, 68, 221.
11. Reed, A. E.; Weinstock, R. B.; Weinhold, F. J. Chem. Phys. 1985, 83, 735.
12. Hirshfeld, F. Theor. Chim. Acta 1977, 44, 129.
13. Cioslowski, J. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 8333.
14. Bader, R. F. W.; Matta, C. F. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 8385.
15. Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894.
16. Breneman, C. M.; Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361.
17. Arroyo, S. T.; Martin, J. A. S.; Garcia, A. H. Chem. Phys. Lett. 2002, 357, 279.
18. Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A., Jr. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431.
19. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1984, 5, 129.
20. Zhang, W.; Hou, T.; Qiao, X.; Xu, X. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9071.
21. Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157.
22. Laio, A.; Gervasio, F. L.; Vande Vondele, J.; Sulpizi, M.; Rothlosberger, U. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 7963.
23. Francl, M. M.; Carey, C.; Chirlian, L. E.; Gange, D. M. J. Comput. Chem. 1996, 17, 367.
24. Green, D. F.; Tidor, B. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 10261.
25. Li, J.; Zhu, T.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 1820.
26. Li, J.; Xing, J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1999, 111, 885.
27. Li, J.; Williams, B.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1999, 110, 724.
28. Winget, P.; Thompson, J. D.; Xidos, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 10707.
29. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. Ab Initia Molecular Orbital Theory; Wiley: New York, 1986.
30. Ditchfield, R.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724.
31. Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257.
32. Hariharan, P. C.; Pople, J. A. Theor. Chim. Acta 1973, 28, 213.
33. Binning, R. C.; Curtiss, L. A., Jr. J. Comput. Chem. 1990, 11, 1206.
34. Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; Schleyer, P. v. R. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294.
35. Frisch, M. J.: Pople, J. A.; Binkley, J. S. J. Chem. Phys. 1984, 80, 3265.
36. Easton, R. E.; Giesen, D. J.; Welch, A.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chim. Acta 1996, 93, 281.
37. Li, J.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 1998, 99, 192.
38. Thompson, J. D.; Winget, P.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Comm. 2001, 4, 4116.
39. Godbout, N.; Salahub, D. R.; Andzelm, J.; Wimmer, E. Can. J. Chem. 1992, 70, 560.
40. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.
41. Francl, M. M.; Pietro, W. J.; Hehre, W. J.; Binkley, J. S.; Gordon, M. S.; DeFrees, D. J.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1982, 77, 3654.
42. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1643.
43. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2006, 125, 194101/1.
44. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 13126.
45. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. Published online; DOI: 10.1007/s00214-007-0310-x (accessed July 21, 2007).
46. Mayer, I. Int. J. Quantum Chem. 1986, 29, 73.
47. Mayer, I. Int. J. Quantum Chem. 1986, 29, 477.
48. Mayer, I. Chem. Phys. Lett. 1983, 97, 270.
49. Thompson, J. D.; Xidos, J. D.; Sonbuchner, T. M.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Comm. 2002, 5, 117.
50. Mayer, I. Chem. Phys. Lett. 2004, 393, 209.
51. Bruhn, G.; Davidson, E. R.; Mayer, I.; Clark, A. E. Int. J. Quantum Chem. 2006, 106, 2065.
52. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1998, 108, 664.
53. Perdew, J. P. In Electronic Structrure of Solids '91; Ziesche, P., Eschrig, H., Eds.; Akademie Verlag: Berlin, 1991; p 11.
54. Lynch, B. J.; Fast, P. L.; Harris, M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 4811.
55. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.
56. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1384.
57. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Munnucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatusjui, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gromperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Lui, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, L; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, A.; Peng, C. Y.; Nanyakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision C.02; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
58. Chamberlin, A. C.; Kelly, C. P.; Xidos, J. D.; Li, J.; Thompson, J. D.; Hawkins, G. D.; Winget, P. D.; Zhu, T.; Rinaldi, D.; Liotard, D. A.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G.; Frisch, M. J. MN-GSM, version 6.2; University of Minnesota: Minneapolis, MN, 2007.
59. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098. Perdew, J. P. In Electronic Structrure of Solids '91; Ziesche, P., Eschrig, H., Eds.; Akademie Verlag: Berlin, 1991; p 11
60. Møller, C.; Plesset, M. S. Phys. Rev. 1934, 46, 618.
61. Dunning, T. H., Jr. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007.
62. Radom, L.; Hehre, W. J.; Pople, J. A. J. Am. Chem. Soc. 1971, 93, 289.
63. Wolfe, S.; Rauk, A.; Tel, L. M.; Czismadia, I. G. J. Chem. Soc. B 1971, 136.
64. Kirby, A. J. The Anomeric Effect and Related Stereoelectronic Effects at Oxygen; Springer-Verlag: Berlin, 1983.
65. Cramer, C. J. Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, 2nd ed.; John Wiley & Sons: Chichester, 2004; p 23.
66. Cramer, C. J. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1996, 370, 135.
67. Hine, J. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 3239.
68. Cramer, C. J. J. Org. Chem. 1992, 57, 7034.