NMR identification of transient complexes critical to adenylate kinase catalysis

Journal of the American Chemical Society

Volumn 129, Issue 45, 2007, Pages 14003-14012

  Ådén, Jörgen ^a   Wolf Watz, Magnus ^a  

^a UMEÅ UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINETRIPHOSPHATE; CATALYSIS; CONFORMATIONS; MONOMERS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PHASE EQUILIBRIA;

BINDING MOTIFS; MONOMERIC ENZYMES; NATURAL SUBSTRATES; TRANSIENT COMPLEXES;

ENZYMES;

ADENOSINE DIPHOSPHATE; ADENOSINE PHOSPHATE; ADENOSINE TRIPHOSPHATE; ADENYLATE KINASE;

ARTICLE; CARBON NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; CATALYSIS; CATALYST; CHEMICAL REACTION; COMPLEX FORMATION; DIPOLE; DISSOCIATION CONSTANT; ENZYME ACTIVITY; ENZYME SUBSTRATE; NITROGEN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; SITE DIRECTED MUTAGENESIS; STRUCTURE ANALYSIS;

ADENOSINE DIPHOSPHATE; ADENOSINE MONOPHOSPHATE; ADENOSINE TRIPHOSPHATE; ADENYLATE KINASE; CATALYSIS; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; MUTAGENESIS, SITE-DIRECTED; PROTEIN CONFORMATION; PROTEIN STRUCTURE, TERTIARY; REFERENCE STANDARDS;

EID: 36148979311     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja075055g     Document Type: Article

References (34)

1. Beach, H.; Cole, R.; Gill, M. L.; Loria, J. P. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 9167-9176.
2. Eisenmesser, E. Z.; Millet, O.; Labeikovsky, W.; Korzhnev, D. M.; Wolf-Watz, M.; Bosco, D. A.; Skalicky, J. J.; Kay, L. E.; Kern, D. Nature 2005, 438, 117-121.
3. Müller, C. W.; Schlauderer, G. J.; Reinstein, J.; Schulz, G. E. Structure 1996, 4, 147-156.
4. Müller, C. W.; Schulz, G. E. J. Mol. Biol. 1992, 224, 159-177.
5. Wolf-Watz, M.; Thai, V.; Henzler-Wildman, K.; Hadjipavlou, G.; Eisenmesser, E. Z.; Kern, D. Nat. Struct. Mol. Biol. 2004, 11, 945-949.
6. Tollinger, M.; Skrynnikov, N. R.; Mulder, F. A.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11341-11352.
7. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332.
8. Boehr, D. D.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Chem. Rev. 2006, 106, 3055-3079.
9. Bax, A.; Kontaxis, G.; Tjandra, N. Methods Enzymol. 2001, 339, 127-174.
10. Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523.
11. Tolman, J. R.; Ruan, K. Chem. Rev. 2006, 106, 1720-1736.
12. Fischer, M. W.; Losonczi, J. A.; Weaver, J. L.; Prestegard, J. H. Biochemistry 1999, 38, 9013-9022.
13. Skrynnikov, N. R.; Goto, N. K.; Yang, D.; Choy, W. Y.; Tolman, J. R.; Mueller, G. A.; Kay, L. E. J. Mol. Biol. 2000, 295, 1265-1273.
14. Tsui, V.; Zhu, L. M.; Huang, T. H.; Wright, P. E.; Case, D. A. J. Biomol. NMR 2000, 16, 9-21.
15. Hofmann, G.; Schweimer, K.; Kiessling, A.; Hofinger, E.; Bauer, F.; Hoffmann, S.; Rösch, P.; Campbell, I. D.; Werner, J. M.; Sticht, H. Biochemistry 2005, 44, 13043-13050.
16. Sass, H. J.; Musco, G.; Stahl, S. J.; Wingfield, P. T.; Grzesiek, S. J. Biomol. NMR 2000, 18, 303-309.
17. Tycko, R.; Blanco, F. J.; Ishii, Y. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9340-9341.
18. Lienhard, G. E.; Secemski, I. I. J. Biol. Chem. 1973, 248, 1121-1123.
19. Cornilescu, G.; Marquardt, J. L.; Ottiger, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6836-6837.
20. Zweckstetter, M.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3791-3792.
21. Koradi, R.; Billeter, M.; Wuthrich, K. J. Mol. Graph. 1996, 14, 51-55, 29-32.
22. Schlauderer, G. J.; Proba, K.; Schulz, G. E. J. Mol. Biol. 1996, 256, 223-227.
23. Sinev, M. A.; Sineva, E. V.; Utah, V.; Haas, E. FEBS Lett. 1996, 397, 273-276.
24. Rhoads, D. G.; Lowenstein, J. M. J. Biol. Chem. 1968, 243, 3963-3972.
25. Reinstein, J.; Gilles, A. M.; Rose, T.; Wittinghofer, A.; Saint Girons, I.; Bârzu, O.; Surewicz, W. K.; Mantsch, H. H. J. Biol. Chem. 1989, 264, 8107-8112.
26. Sinev, M. A.; Sineva, E. V.; Utah, V.; Haas, E. Biochemistry 1996, 35, 6425-6437.
27. Lou, H. F.; Cukier, R. I. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 24121-24137.
28. Boehr, D. D.; McElheny, D.; Dyson, H. J.; Wright, P. E. Science 2006, 313, 1638-1642.
29. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277-293.
30. Helgstrand, M.; Kraulis, P.; Allard, P.; Härd, T. J. Biomol. NMR 2000, 18, 329-336.
31. Wittekind, M.; Mueller, L. J. Magn. Res. Series B 1993, 101, 201-205.
32. Grzesiek, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 6291-6293.
33. Chou, J. J.; Gaemers, S.; Howder, B.; Louis, J. M.; Bax, A. J. Biomol. NMR 2001, 21, 377-382.
34. Ottiger, M.; Delaglio, F.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1998, 131, 373-378.