Study of the interaction of human defensins with cell membrane models: Relationships between structure and biological activity

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 38, 2007, Pages 11318-11329

  Lourenzoni, Marcos R ^a   Namba, Adriana M ^a   Caseli, Luciano ^a   Degrève, Léo ^a   Zaniquelli, Maria E D ^a  

^a UNIVERSITY OF SÃO PAULO   (Brazil)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOACTIVITY; CELL MEMBRANES; MOLECULAR INTERACTIONS; PHYSIOLOGICAL MODELS;

ANTIMICROBIAL PEPTIDES; MEMBRANE MODEL; MICROBIAL ACTIONS;

PEPTIDES;

EID: 35148876147     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp067127g     Document Type: Article

References (61)

1. Ganz, T.; Selsted, M. E.; Szklarek, D.; Harwig, S. S. L.; Daher, K.; Bainton, D. F.; Lehrer, R. I. J. Clin. Invest. 1985, 76, 1427.
2. Yang, D.; Biragyn, A.; Kwak, L. W.; Oppenheim, J. J. Trends Immunol. 2002, 23, 291.
3. Wiesenfeld, H. C.; Heine, R. P.; Krohn, M. A.; Hillier, S. L.; Amortegui, A. A.; Nicolazzo, M.; Sweet, R. L. J. Infect. Dis. 2002, 186, 792.
4. Lupetti, A.; Danesi, R.; van't Wout, J. W.; van Dissell, J. T.; Senesi, S.; Nibbering, P. H. Expert Opin. Invest. Drugs 2002, 11, 309.
5. Daher, K. A.; Selsted, M. E.; Uhrer, R. I. J. Viral. 1986, 60, 1068.
6. Mizukawa, N.; Sawaki, K.; Nagatsuka, H.; Kamio, M.; Yamachika, E.; Fukunaga, J.; Ueno, T.; Takagi, S.; Sugahara, T. Anticancer Res. 2001, 21, 2171.
7. Mackewicz, C E.; Yuan, J.; Tran, P.; Diaz, L.; Mack, E.; Selsted, M. E.; Levy, J. A. AIDS 2003, 17, 23.
8. Ganz, T.; Lehrer, R. I. Curr. Opin. Immunol. 1998, 10, 41.
9. Lehrer, R. I.; Ganz, T. Curr. Opin. Immunol. 1999, 11, 23.
10. Kagan, B. L.; Selsted, M. E.; Ganz, T.; Lehrer, R. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 210.
11. Rice, W. G.; Ganz, T.; Kinkade, J. M., Jr.; Selsted, M. E.; Parmley, R. T. Blood 1987, 70, 757.
12. Hill, C P.; Yee, J.; Selsted, M. E.; Eisenberg, D. Science 1991, 251, 1481.
13. Pardi, A.; Hare, D. R.; Selsted, M. E.; Morrison, R. D.; Bassolino, D. A.; Bach, A. C. J. Mol. Biol. 1988, 201, 625.
14. Pardi, A.; Zhang, X. L.; Selsted, M. E.; Skalicky, J. J.; Yip, P. F. Biochemistry 1992, 31, 11357.
15. Selsted, M. E.; Harwig, S. S. L. Infect. Immun. 1987, 55, 2281.
16. Patterson-Delafield, J.; Szklarek, D.; Martinez, R. J.; Lehrer, R. I. Infect. Immun. 1981, 31, 723.
17. Lehrer, R. I.; Barton, A.; Daher, K. A.; Harwig, S. S. L.; Ganz, T.; Selsted, M. E. J. Clin. Invest. 1989, 84, 553.
18. Wimley, W. C.; Selsted, M. E.; White, S. H. Protein Sci. 1994, 3, 1362.
19. Fujii, G.; Selsted, M. E.; Eisenberg, D. Protein Sci. 1993, 2, 1301.
20. Selsted, M. E.; Ouellette, A. J. Trends Cell Biol. 1995, 5, 114.
21. Gorfe, A. A.; Hanzal-Bayer, M.; Abankwa, D.; Hancock, J. F.; McCammon, A. J. Med Chem. 2007, 50, 674.
22. Chipot, C.; Pohorille, A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 281.
23. Ambroggio, E. E.; Villarreal, M. A.; Montich, G. G.; Rijjkers, D. T. S.; De Planque, M. R. R.; Separovic, F.; Fidelio, G. D. Biophys. Chem. 2006, 121, 171.
24. Nakahara, H.; Nakamura, S.; Lee, S.; Sugihara, G.; Shibata, O. Colloids Surf., A 2005, 134, 30.
25. Blois, A.; Holmsen, H.; Martino, G.; Corti, A.; Metz-Boutique, M. H.; Helle, K. B. Regul. Pept. 2006, 134, 30.
26. Maget-Dana, R. Biochim. Byophys. Acta 1999, 1462, 109.
27. Freitas, M. S.; Gaspar, L. P.; Lourenzoni, M. R.; Almeida, F. C. L.; Tinoco, L. W.; Almeida, M. S.; Maia, L. F.; Dégrève, L.; Valente, A. P., Silva, J. L. J. Biol. Chem., in press.
28. Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
29. Schuler, L. D.; Daura, X.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2001, 22, 1205.
30. Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089.
31. Hockney, R. W.; Goel, S. P. J. Comput. Phys. 1974, 14, 148.
32. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Claredon Press: Oxford, 1987.
33. Cicotti, G.; Frenkel, D.; McDonald, I. R. Simulation of Liquids and Solids. Molecular Dynamics and Monte Carlo Methods in Statistical Mechanics; North-Holland: Amsterdam, 1990.
34. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
35. Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem 1997, 18, 1463.
36. Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952.
37. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; Hermans, J. In Intermolecular Forces; Pullman, B., Ed.; D. Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981.
38. Yaws, C. L. Chemical Properties Handbook; McGraw-Hill: New York, 1999.
39. http://www.rcsb.org/pdb/Welcome.do (accessed December 2005).
40. DeLano, W. L.; Bromberg, S. PyMOL User's Guide; DeLano Scientific LLC: San Francisco, CA, 2004.
41. Baker, N. A.; Sept, D.; Joseph, S.; Holst, M. J.; McCammon, J. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 10037.
42. Rotenberg, Y.; Boruvka, L.; Neumann, A. W. J. Colloid Interface Sci. 1983, 93, 169.
43. Cheng, P.; Li, D.; Boruvka, L.; Rotenberg, Y.; Neumann, A. W. Colloids Surf. 1990, 43, 151.
44. Kwok, D. Y.; Tadros, B.; Deol, H.; Vollhardt, D.; Miller, R.; Cabrerizo-Vflchez, M. A.; Neumann, A. W. Langmuir 1996, 12, 1851.
45. Namba, A. M.; Degrève, L. Quim. Nova 2004, 27, 27.
46. Namba, A. M.; Lourenzoni, M. R.; Degrève, L. J. Braz. Chem. Soc. 2007, 18, 611.
47. Suresh, A.; Verma, C. BMC Bioinf. 2006, 5, 1.
48. Zou, G.; Leeuw, E.; Li, C.; Pazgier, M.; Li, C.; Zeng, P.; Lu, W.; Lubkowski, J.; Lu, W. J. Biol. Chem., in press.
49. Graham, D. E.; Philips, M. C. J. Colloid Interface Sci. 1979, 70, 403.
50. Maget-Dana, R.; Ptak, M. Colloids Surf., B 1996, 7, 135.
51. Suttiprasit, P.; Krisdhasima, V.; McGuire, J. J. Colloid Interface Sci. 1992, 154, 316.
52. Marsh, D. Biochim. Biophys. Acta 1996, 1286, 183.
53. Maget-Dana, R.; Hetru, Ch.; Ptak, M. Thin Solid Films 1996, 284, 841.
54. Brockman, H. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 438.
55. Erbrich, U.; Septinus, M.; Zimmermann, H. W. Phys. Chem. Chem Phys. 1982, 86, 724.
56. Lehrer, R. I.; Ganz, T. Curr. Opin. Immunol. 1999, 11, 23.
57. Hoover, D. M.; Rajashankar, K. R.; Blumenthal, R.; Puri, A.; Oppenheim, J. J.; Chertov, O.; Lubkowski, J. J. Biol. Chem. 2000, 275, 32911.
58. Sawai, M. V.; Jia, H. P.; Liu, L.; Aseyev, V.; Wiencek, J. M.; McCray, P. B., Jr.; Ganz, T.; Kearney, W. R.; Tack, B. F. Biochemistry 2001, 40, 3810.
59. Bauer, F.; Schweimer, K.; Klüver, E.; Conejo-Garcia, J.; Forssmann, W.; Rösch, P.; Adermann, K.; Sticht, H. Protein Sci. 2001, 10, 2470.
60. Schröder, J. M. Cell. Mol. Life Sci. 1999, 56, 32.
61. Hristova, K.; Selsted, M. E.; White, S. H. J. Biol. Chem. 1997, 272, 24224.