Intact protein profiling of Chlorobium tepidum by capillary isoelectric focusing, reversed-phase liquid chromatography, and mass spectrometry

Analytical Chemistry

Volumn 79, Issue 18, 2007, Pages 7145-7153

  Zhou, Feng ^a   Hanson, Thomas E ^a   Johnston, Murray V ^a  

^a UNIVERSITY OF DELAWARE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROSPRAY IONIZATION; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; POLYPEPTIDES; SENSITIVITY ANALYSIS; SULFUR COMPOUNDS;

CAPILLARY ISOELECTRIC FOCUSING (CIEF); CHLOROBIUM TEPIDUM; GREEN SULFUR BACTERIUM; INTACT PROTEIN PROFILING;

PROTEINS;

PROTEIN;

ARTICLE; BACTERIAL GENOME; CALIBRATION; CHLOROBI; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; ION EXCHANGE CHROMATOGRAPHY; ISOELECTRIC FOCUSING; MICRODIALYSIS; NONHUMAN; POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; PROTEIN PROCESSING; REVERSED PHASE LIQUID CHROMATOGRAPHY;

CHLOROBIUM; CHROMATOGRAPHY, LIQUID; ELECTROPHORESIS, GEL, TWO-DIMENSIONAL; ISOELECTRIC FOCUSING; MASS SPECTROMETRY; NANOTECHNOLOGY; PROTEINS; SENSITIVITY AND SPECIFICITY;

EID: 34548728000     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac071147c     Document Type: Article

References (35)

1. Hille, J. M.; Freed, A. L.; Watzig, H. Electrophoresis 2001, 22, 4035-4052.
2. Pandey, A.; Mann, M. Nature 2000, 405, 837-846.
3. Wang, H.; Hanash, S. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24 (3), 413-426.
4. Chait, B. T. Science 2006, 314, 65-66.
5. Meng, F. Y.; Cargile, B. J.; Miller, L. M.; Forbes, A. J.; Johnson, J. R.; Kelleher, N. L. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 952-957.
6. Kelleher, N. L.; Zubarev, R. A.; Bush, K.; Furie, B.; Furie, B. C.; McLafferty, F. W.; Walsh, C. T. Anal. Chem. 1999, 71, 4250-4253.
7. Han, X. M.; Jin, M.; Breuker, K.; McLafferty, F. W. Science 2006, 314, 109-112.
8. O'Farrell, P. H. J. Biol. Chem. 1975, 250, 4007-4021.
9. Gorg, A.; Obermaier, C.; Boguth, G.; Harder, A.; Scheibe, B.; Wildgruber, R.; Weiss, W. Electrophoresis 2000, 21, 1037-1053.
10. Corthals, G. L.; Wasinger, V. C.; Hochstrasser, D. F.; Sanchez, J. C. Electrophoresis 2000, 21, 1104-1115.
11. Shang, T. Q.; Ginter, J. M.; Johnston, M. V.; Larsen, B. S.; McEwen, C. N. Electrophoresis 2003, 24, 2359-2368.
12. Liu, H. J.; Berger, S. J.; Chakraborty, A. B.; Plumb, R. S.; Cohen, S. A. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2002, 782, 267-289.
13. Millea, K. M.; Krull, I. S.; Cohen, S. A.; Gebier, J. C.; Berger, S. J. J. Proteome Res. 2006, 5, 135-146.
14. Jensen, P. K.; Paa-Toli, L.; Anderson, G. A.; Horner, J. A.; Lipton, M. S.; Bruce, J. E.; Smith, R. D. Anal. Chem. 1999, 71, 2076-2084.
15. Wang, Y. J.; Balgley, B. M.; Rudnick, P. A.; Evans, E. L.; DeVoe, D. L.; Lee, C. S. J. Proteome Res. 2005, 4, 36-42.
16. Zhou, F.; Johnston, M. V. Anal. Chem. 2004, 76, 2734-2740.
17. Zhou, F.; Johnston, M. V. Electrophoresis 2005, 26, 1383-1388.
18. Zheng, S. P.; Schneider, K. A.; Barder, T. J.; Lubman, D. M. BioTechniques 2003, 35, 1202-1209.
19. Zhu, K.; Miller, F. R.; Barder, T. J.; Lubman, D. M. J. Mass Spectrom. 2004, 39, 770-780.
20. Zhu, K.; Kachman, M. T.; Miller, F. R.; Lubman, D. M.; Zand, R. J. Chromatogr., A 2004, 1053, 133-142.
21. Zhu, K.; Zhao, J.; Lubman, D. M.; Miller, F. R.; Barder, T. J. Anal. Chem. 2005, 77, 2745-2755.
22. Zhao, J.; Zhu, K.; Lubman, D. M.; Miller, F. R.; Shekhar, M. P. V.; Gerard, B.; Barder, T. J. Proteomics 2006, 6, 3847-3861.
23. Righetti, P. G. J. Chromatogr., A 2004, 1037, 491-499.
24. Shimura, K.; Zhi, W.; Matsumoto, H.; Kasai, K. Anal. Chem. 2000, 72, 4747-4757.
25. Liu, T. S.; Xiaoxia; Zeng, R.; Xia, Q. Shengwu Huaxue Yu Shengwu Wuli Xuebao 2002, 34, 423-432.
26. Hanson, T. E.; Tabita, F. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 4397-4402.
27. Hanson, T. E.; Tabita, F. R. Photosynth. Res. 2003, 78, 231-248.
28. Markwell, M. A. K.; Haas, S. M.; Bieber, L. L.; Tolbert, N. E. Anal. Biochem. 1978, 87, 206-210.
29. Huang, M. X.; Vorkink, W. P.; Lee, M. L. J. Microcolumn Sep. 1992, 4, 233-238.
30. Busnel, J. M.; Varenne, A.; Descroix, S.; Peltre, G.; Gohon, Y.; Gareil, P. Electrophoresis 2005, 26, 3369-3379.
31. Horka, M.; Willimann, Th.; Blum, M.; Nording, P.; Friedl, Z.; Slais, K. J. Chromatogr., A 2001, 916, 65-73.
32. Garcia, M. C. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2005, 825, 111-123.
33. Wang, Y. J.; Balgley, B. M.; Rudnick, P. A.; Lee, C. S. J. Chromatogr., A 2005, 1073, 35-41.
34. Eisen, J. A.; Nelson, K. E.; Paulsen, I. T.; Heidelberg, J. F.; Wu, M.; Dodson, R. J.; Deboy, M. L.; Gwinn, W. C.; Nelson, D. H.; Haft, E. K.; Hickey, J. D.; Peterson, A. S.; Durkin, R.; Kolonay, J. L.; Yang, F.; Holt, I.; Umayam, L. A.; Mason, T.; Brenner, M.; Shea, T. P.; Parksey, D.; Nierman, W. C.; Feldblyum, T. V.; Hansen, C. L.; Craven, M. B.; Radune, D.; Vamathevan, J.; Khouri, H.; White, O.; Gruber, T. M.; Ketchum, K. A.; Venter, J. C.; Tettelin, H.; Bryant, D. A.; Fraser, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9509-9514.
35. Yoon, K. S.; Hille, R.; Hemann, C.; Tabita, F. R. J. Biol. Chem. 1999, 274, 29772-29778.