Intramolecular electron transfer in the dihaem cytochrome c peroxidase of Pseudomonas aeruginosa

ChemBioChem

Volumn 8, Issue 12, 2007, Pages 1440-1446

  Lee, Yong ^a   Boycheva, Svetlana ^a   Brittain, Thomas ^a   Boyd, Peter D W ^b  

^a UNIVERSITY OF AUCKLAND   (New Zealand)

^b UNIVERSITY OF AUCKLAND   (New Zealand)

Author keywords

Cytochrome c peroxidase; Cytochromes; Electron transfer; Enzyme catalysis; Haem proteins

Indexed keywords

CYTOCHROME C PEROXIDASE; HEME; HYDROGEN PEROXIDE; PORPHYRIN; TRYPTOPHAN;

ARTICLE; CATALYSIS; CHEMICAL STRUCTURE; CIRCULAR DICHROISM; ELECTRON TRANSPORT; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN EXPRESSION; PROTEIN SECONDARY STRUCTURE; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; CHEMISTRY; ELECTRON; ELECTRON SPIN RESONANCE; ESCHERICHIA COLI; METABOLISM;

PSEUDOMONAS AERUGINOSA;

CIRCULAR DICHROISM; CYTOCHROME-C PEROXIDASE; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSPORT; ELECTRONS; ESCHERICHIA COLI; HEME; PSEUDOMONAS AERUGINOSA;

EID: 34548127741     PISSN: 14394227     EISSN: 14397633     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbic.200700159     Document Type: Article

References (55)

1. B. M. Babior, Trends Biochem. Sci. 1987, 12, 241-243.
2. K. L. Seib, H. J. Tseng, A. G. McEwan, M. A. Apicella, M. P. Jennings, J. Infect. Dis. 2004, 190, 136-147.
3. A. Echalier, C. F. Goodhew, G. W. Pettigrew, V. Fulop, Structure 2006, 14, 107-117.
4. H. Grassmé, V. Jendrossek, A. Riehle, G. von Kürthy, J. Berger, H. Schwarz, M. Weller, R. Kolesnick, E. Gulbins, Nat. Med. 2003, 9, 322-330.
5. J. Van Eldere, J. Antimicrob. Chemother. 2003, 51, 347-352.
6. V. Fulop, C. J. Ridout, C. Greenwood, J. Hajdu, Structure 1995, 3, 1225-1233.
7. N. Foote, R. Turner, T. Brittain, C. Greenwood, Biochem. J. 1992, 283, 839-843.
8. V. Fulop, N. J. Watmough, S. J. Ferguson, Adv. Inorg. Chem. 2001, 51, 163-204.
9. C. Greenwood, N. Foote, P. M. A. Gadsby, A. J. Thomson, Chemica Scripta 1988, 28, 79-84.
10. G. W. Pettigrew, A. Echalier, S. R. Pauleta, J. Inorg. Biochem. 2006, 100, 551-567.
11. H. B. Gray, J. R. Winkler, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2005, 102, 3534-3539.
12. H. B. Gray, J. R. Winkler, Electron Transfer in Chemistry. (Ed.: V. Balzani), Wiley-VCH, Weinheim, 2001, Section 3.1.1.
13. J. L. Wright, K. Wang, L. Geren, A. J. Saunders, G. J. Pielak, B. Durham, F. Millet, Advances in Chemistry, Vol. 254: Photochemistry and Radiation Chemistry (Eds.: J. F. Wishart, D. G. Nocera), American Chemical Society, Washington, 1998.
14. J. R. Winkler, H. B. Gray, Annu. Rev. Biochem. 1996, 65, 537-561.
15. J. R. Winkler, H. B. Gray, Chem. Rev. 1992, 92, 369-379.
16. D. N. Beratan, J. N. Onuchic, J. R. Winkler, H. B. Gray, Science 1992, 258, 1740-1742.
17. J. N. Betts, D. Beratan, J. N. Onuchic, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4043-4046.
18. J. Stubbe, D. G. Nocera, C. S. Yee, M. C. Y. Chang, Chem. Rev. 2003, 103, 2167-2201.
19. H. B. Gray, J. R. Winkler, Q. Rev. Biophys. 2003, 36, 3141-372.
20. C. Balny, F. Travers, T. Barman, P. Douzou, Eur. Biophys. J. 1987, 14, 375-383.
21. S. Loo, J. E. Erman, Biochemistry 1975, 14, 3467-3470.
22. H. K. Baek, H. E. Van Wart, Biochemistry 1989, 28, 5714-5719.
23. G. Smulevich, Biospectroscopy 1998, 4, S3-S17.
24. G. Smulevich, F. Neri, M. P. Marzocchi, K. G. Welinder, Biochemistry 1996, 35, 10576-10585.
25. A. L. Bradley, S. E. Chobot, D. M. Arciero, A. B. Hooper, S. J. Elliot, J. Biol. Chem. 2004, 279, 13297-13300.
26. L. De Smet, S. N. Savvides, E. Van Horen, G. Pettigrew, J. J. van Beeumen, J. Biol. Chem. 2006, 281, 4371-4379.
27. D. Dolphin, A. Forman, D. C. Borg, J. Fajer, R. H. Felton, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1971, 68, 614-618.
28. D. Dolphin, R. H. Felton, Acc. Chem. Res. 1974, 7, 26-32.
29. H. B. Dunford, J. S. Stillman, Coord. Chem. Rev. 1976, 19, 187-251.
30. J. E. Erman, L. B. Vitello, M. Mauro, J. Kraut, Biochemistry 1989, 28, 7992-7995.
31. A. Khindaria, S. D. Aust, Biochemistry 1996, 35, 13107-13111.
32. Z. Pan, R. Zhang, M. Newcomb, J. Inorg. Biochem. 2006, 100, 524-532.
33. J. E. Erman, T. Yonetani, Biochim. Biophys. Acta Protein Struct. 1975, 393, 350-357.
34. A. Morimoto, M. Tanaka, S. Takahashi, K. Ishimori, H. Hori, I. Morishima, J. Biol. Chem. 1998, 273, 14753-14760.
35. A. Hiner, J. I. Martinez, M. B. Arnao, M. Acosta, D. D. Turner, E. C. Raven, J. N. Rodriguez-Lopez, Eur. J. Biochem. 2001, 268 , 3091-3098.
36. C. A. Bonagura, B. Bhaskar, H. Shimizu, H. Li, M. Sundaramoorthy, D. E. McRee, D. B. Goodin, T. L. Poulos, Biochemistry 2003, 42, 5600-5608.
37. R. A. Marcus, N. Sutin, Biochim. Biophys. Acta Rev. Bioenerg. 1985, 811, 265-322.
38. J. R. Winkler, D. G. Nocera, K. M. Yocom, E. Bordignon, H. B. Gray, J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 5798-5800.
39. C. C. Page, C. C. Moser, X. Chen, P. L. Dutton, Nature 1999, 402, 47-52.
40. S. S. Isied, M. Y. Ogawa, J. F. Wishart, Chem. Rev. 1992, 92, 381-394.
41. J. N. Onuchic, D. N. Beratan, J. R. Winkler, H. B. Gray, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992, 21, 349-377.
42. D. M. A. Smith, K. M. Rosso, M. Dupuis, M. Valiev, T. P. Straatsma, J. Phys. Chem. B 2006, 110, 15582-15588.
43. T. Shiga, K. Imaizumi, Arch. Biochem. Biophys. 1975, 167, 469-479.
44. A. I. Alayash, Nat. Biotechnol. 1999, 17, 545-549.
45. M. S. Mondal, H. A. Fuller, F. A. Armstrong, J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 263-264.
46. M. S. Mondal, D. B. Goodin, F. A. Armstrong, J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6270-6276.
47. A. Harriman , J. Phys. Chem. 1987, 91, 6102-6104.
48. M. R. DeFelippis, C. P. Murthy, F. Broitman, D. Weinraub, M. Faraggi, M. H. Klapper, J. Phys. Chem. 1991, 95, 3416-3419.
49. L. Thony-Meyer, F. Fischer, P. Kunzler, D. Ritz, H. Hennecke, J. Bacteriol. 1995, 177, 4321-4326.
50. N. Foote, A. C. Thompson, D. Barber, C. Greenwood, Biochem. J. 1983, 209, 701-707.
51. Gaussian 03, Revision C.02, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
52. L. A. Fishel, M. F. Farnum, J. M. Mauro, M. A. Miller, J. Kraut, Biochemistry 1991, 30, 1986-1996.
53. G. M. Jensen, S. W. Bunte, A. Warshel, D. B. Goodin, J. Phys. Chem. B 1998, 102, 8221-8228.
54. A. L. P. Houseman, P. E. Doan, D. B. Goodin, B. M. Hoffman, Biochemistry 1993, 32, 4430-4443.
55. J. E. Huyett, P. E. Doan, R. Gurbiel, A. L. P. Houseman, M. Sivaraja, D. B. Goodin, B. M. Hoffman, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9033-9041.