Solvent reorganization contributions in solute transfer thermodynamics: Inferences from the solvent equation of state

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 111, Issue 27, 2007, Pages 7836-7842

  Peter, Christine ^a   Van Der Vegt, Nico F A ^a  

^a MAX PLANCK INSTITUTE FOR POLYMER RESEARCH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; EQUATIONS OF STATE; ORGANIC SOLVENTS; THERMAL EXPANSION; THERMODYNAMICS;

ISOTHERMAL COMPRESSIBILITY; SOLUTE TRANSFER THERMODYNAMICS; SOLUTE-INDUCED MODIFICATIONS; SOLVENT REORGANIZATION;

MOLECULAR INTERACTIONS;

EID: 34547475679     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0712708     Document Type: Article

References (34)

1. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia. A. E.; Pohorille, A.; Pratt, L. R. Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1996, 93, 8951-8955.
2. Garde, S.; Hummer, G.; Garcia, A. E.; Paulaitis, M.; Pratt, L. R. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 4966-4968.
3. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A. E.; Paulaitis, M. E.; Pratt, L. R. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 10469-10482.
4. Garde, S.; Garcia, A. E.; Pratt, L. R.; Hummer, G. Biophys. Chem. 1999, 78, 21-33.
5. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A. E.; Pratt, L. R. Chem. Phys. 2000, 255, 349-370.
6. Pratt, L. R. Ann. Rev. Phys. Chem. 2002, 53, 409-436.
7. Ben-Amotz, D.; Raineri, F. O.; Stell, G. J. Phys. Chem. B 2005, 109 (14), 6866-6878.
8. Ozal, T. A.; van der Vegt, N. F. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (24), 12104-12112.
9. Yu, H.-A.; Karplus, M. J. Chem. Phys. 1988, 59, 2366-2379.
10. ( 10) Guillot, B.; Guissani, Y.; Bratos, S. J. Chem. Phys. 1991, 95, 3643-3648.
11. Peter, C.; Oostenbrink, C.; van Dorp, A.; van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 2004, 120 (6), 2652-2661.
12. van der Vegt, N. F. A.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. B 2004, 108(3), 1056-1064.
13. van der Vegt, N. F. A.; Trzesniak, D.; Kasumaj, B.; van Gunsteren, W. F. ChemPhysChem. 2004, 5 (1), 144-147.
14. Guillot, B.; Guissani, Y. J. Chem. Phys. 1993, 99, 8075-8094.
15. Schravendijk, P.; Van der Vegt, N. F. A. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 643-652.
16. Lee, M.-E.; van der Vegt, N. F. A. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3 (1), 194-200.
17. van der Vegt, N. F. A.; Lee, M.-E.; Trzesniak, D.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (26), 12852-12855.
18. Roseman, M.; Jencks, W. J. Am. Chem. Soc. 1975, 75 (3), 631-640.
19. Matubayasi, N.; Gallicchio, E.; Levy, R. J. Chem. Phys. 1998, 109 (12), 4864-4872.
20. Levy, R. M.; Gallicchio, E. Annu. Rev. Phys. Chem. 1998, 49, 531-567.
21. Schuler, L. D.; Daura, X.; Van Gunsteren, W. F. J. Comp. Chem 2001, 22 (11), 1205-1218.
22. Geerke, D. P.; Oostenbrink, C.; van der Vegt, N. F. A.; Van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. B 2004, 108 (4), 1436-1445.
23. Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Groenhof, G.; Mark, A. E.; Berendsen, H. J. C. J. Comp. Chem. 2005, 26 (16), 1701-1718.
24. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
25. Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
26. Ben-Naim, A. Solvation Thermodynamics; Plenum Press: New York, 1987.
27. Hess, B.; van der Vegt, N. F. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (35), 17616-17626.
28. van Gunsteren, W. F.; Billeter, S. R.; Eising, A. A.; Hunenberger, P. H.; Krüger, P.; Mark, A. E.; Scott, W. R. P.; Tironi, I. G. Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide; Vdf Hochschulverlag AG an der ETH Zürich: Zürich, 1996.
29. Scott, W. R. P.; Hünenberger, P. H.; Tironi, I. G.; Mark, A. E.; Billeter, S. R.; Fennen, J.; Torda, A. E.; Huber, T.; Krüger, P.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. A 1999, 103 (19), 3596-3607.
30. Stone, M. T.; In't veld, P. J.; Lu, Y.; Sanchez, I. C. Mol. Phys. 2002, 100 (17), 2773-2792.
31. Lynden-Bell, R. M.; Head-Gordon, T. Mol. Phys. 2006, 104, 3593-3605.
32. Gallicchio, E.; Levy, R. J. Phys. Chem. B. 2000, 104, 6271-6285.
33. Ben-Amotz, D.; Widom, B. J. Phys. Chem. B 2006, 110 (40), 19839-19849.
34. van der Vegt, N. F. A. J. Membr. Sci. 2002, 205, 125-139.