Implementation of electron-transfer dissociation on a hybrid linear ion trap-orbitrap mass spectrometer

Analytical Chemistry

Volumn 79, Issue 10, 2007, Pages 3525-3534

  McAlister, Graeme C ^a   Phanstiel, Doug ^a   Good, David M ^a   Berggren, W Travis ^b   Coon, Joshua J ^a  

^a UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

^b WiCell Research Institute   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTRON TRAPS; ELECTROSPRAY IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; PARTICLE BEAM INJECTION; SPECTRAL RESOLUTION;

DUAL ELECTROSPRAY ION SOURCES; ELECTRON-TRANSFER DISSOCIATION; PROTEOMICS; TRAP-ORBITRAP MASS SPECTROMETER;

ELECTRON TRANSITIONS;

ANION; CATION; PEPTIDE; PROTEIN; REAGENT; SYNTHETIC PEPTIDE;

ACCURACY; ARTICLE; CELL LYSATE; ELECTRON TRANSFER DISSOCIATION; ELECTRON TRANSPORT; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETER; MASS SPECTROMETRY; NONHUMAN; ONLINE SYSTEM; PEPTIDE ANALYSIS; PROTEIN ANALYSIS; PROTEOMICS; YEAST CELL;

AUTOMATIC DATA PROCESSING; CHROMATOGRAPHY, HIGH PRESSURE LIQUID; ELECTRONS; FUNGAL PROTEINS; IONS; PEPTIDES; PROTEINS; PROTEOME; PROTEOMICS; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION;

EID: 34249022000     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac070020k     Document Type: Article

References (32)

1. Good, D. M.; Coon, J. J. Biotechniques 2006, 40, 783-789.
2. Coon, J. J.; Syka, J. E. P.; Schwartz, J. C.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Int. J. Mass Spectrom. 2004, 236, 33-42.
3. Syka, J. E. P.; Coon, J. J.; Schroeder, M. J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 9528-9533.
4. Gunawardena, H. P.; Emory, J. F.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2006, 78, 3788-3793.
5. Hogan, J. M.; Pitteri, S. J.; Chrisman, P. A.; McLuckey, S. A. J. Proteome Res. 2005, 4, 628-632.
6. Pitteri, S. J.; Chrisman, P. A.; Hogan, J. M.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2005, 77, 1831-1839.
7. Coon, J. J.; Ueberheide, B.; Syka, J. E. P.; Dryhurst, D. D.; Ausio, J.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9463-9468.
8. Swaney, D. L.; McAlister, G. C.; Wirtala, M.; Schwartz, J. C.; Syka, J. E. P.; Coon, J. J. Anal. Chem. 2007, 79, 477-485.
9. Herron, W. J.; Goeringer, D. E.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 1996, 68, 257-262.
10. Stephenson, J. L.; McLuckey, S. A. Int. J. Mass Spectrom. 1997, 165, 419-431.
11. Stephenson, J. L.; McLuckey, S. A. Int. J. Mass Spectrom. Ion Processes 1997, 162, 89-106.
12. McLuckey, S. A.; Stephenson, J. L. Mass Spectrom. Rev. 1998, 17, 369-407.
13. Syka, J. E. P.; Marto, J. A.; Bai, D. L.; Horning, S.; Senko, M. W.; Schwartz, J. C.; Ueberheide, B.; Garcia, B.; Busby, S.; Muratore, T.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F. J. Proteome Res. 2004, 3, 621-626.
14. Thevis, M.; Makarov, A. A.; Horning, S.; Schanzer, W. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2005, 19, 3369-3378.
15. Michael, S. M.; Chien, B. M.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 1993, 65, 2614-2620.
16. Verentchikov, A. N.; Ens, W.; Standing, K. G. Anal. Chem. 1994, 66, 126-133.
17. Shevchenko, A.; Loboda, A.; Shevchenko, A.; Ens, W.; Standing, K. G. Anal. Chem. 2000, 72, 2132-2141.
18. Liang, X.; Xia, Y.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2006, 78, 3208-3212.
19. Xia, Y.; Chrisman, P. A.; Erickson, D. E.; Liu, J.; Liang, X.; Londry, F. A.; Yang, M. J.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2006, 78, 4146-4154.
20. Huang, T. Y.; Emory, J. F.; O'Hair, R. A.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2006, 78, 7387-7391.
21. Martin, S. E.; Shabanowitz, J.; Hunt, D. F.; Marto, J. A. Anal. Chem. 2000, 72, 4266-4274.
22. Stephenson, J. L.; VanBerkel, G. J.; McLuckey, S. A. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1997, 8, 637-644.
23. Stephenson, J. L.; McLuckey, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 7390-7397.
24. Pitteri, S. J.; Chrisman, P. A.; Hogan, J. M.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2005, 77, 1831-1839.
25. Meng, F. Y.; Cargile, B. J.; Miller, L. M.; Forbes, A. J.; Johnson, J. R.; Kelleher, N. L. Nat. Biotechnol. 2001, 19, 952-957.
26. Taylor, G. K.; Kim, Y. B.; Forbes, A. J.; Meng, F. Y.; McCarthy, R.; Kelleher, N. L. Anal. Chem. 2003, 75, 4081-4086.
27. LeDuc, R. D.; Taylor, G. K.; Em, Y. B.; Januszyk, T. E.; Bynum, L. H.; Sola, J. V.; Garavelli, J. S.; Kelleher, N. L. Nucleic Acids Res. 2004, 32, W340-345.
28. Pesavento, J. J.; Kim, Y. B.; Taylor, G. K.; Kelleher, N. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3386-3387.
29. Roth, M. J.; Forbes, A, J.; Boyne, M. T.; Kim, Y. B.; Robinson, D. E.; Kelleher, N. L. Mol. Cell. Proteomics 2005, 4, 1002-1008.
30. Badman, E. R.; Chrisman, P. A.; McLuckey, S. A. Anal. Chem. 2002, 74, 6237-6243.
31. Savitski, M. M.; Nielsen, M. L.; Kjeldsen, F.; Zubarev, R. A. J. Proteome Res. 2005, 4, 2348-2354.
32. Nepomuceno, A. I.; Muddiman, D. C.; Bergen, H. R.; Craighead, J. R.; Burke, M. J.; Caskey, P. E.; Allan, J. A. Anal. Chem. 2003, 75, 3411-3418.