Excited-state properties and transitions of fluorescent 8-vinyl adenosine in DNA

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 51, 2006, Pages 26327-26336

  Kenfack, Cyril A ^a,b   Burger, Alain ^c   Mély, Yves ^a  

^a CNRS   (France)

^b UNIVERSITY OF DOUALA   (Cameroon)

^c UNIVERSITÉ CÔTE D'AZUR   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CRYSTALLINE MATERIALS; ELECTRONIC PROPERTIES; FLUORESCENCE; OSCILLATORS (ELECTRONIC); QUENCHING; SPECTROSCOPIC ANALYSIS;

EXCITED STATE ENERGY GAPS; FLUORESCENCE QUANTUM YIELDS; OSCILLATOR STRENGTH; PHOTOPHYSICS;

DNA;

EID: 33846387808     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp064388h     Document Type: Article

References (36)

1. Gaied, B. N.; Glasser, N.; Ramalanjaona, N.; Beltz, H.; Wolff, P.; Marquet, R.; Burger, A.; Mély, Y. Nucleic Acids Res. 2005, 33, 1031.
2. Nordlund, T. M.; Anderson, S.; Nilsson, L.; Rigler, R.; Gräslund, A.; Mclaughlin, L. W. Biochemistry 1989, 32, 9095.
3. Norlund, T. M.; Xu, D.; Evans, K. O. Biochemistry 1993, 32, 12090.
4. Stivers, J. T. Nucleic Acids Res. 1998, 26, 3837.
5. Rachofsky, E. L.; Seibert, E.; Stivers, J. T.; Osman, R.; Ross, J. B. A. Biochemistry 2001, 40, 957.
6. Guest, C. R.; Hochstrasser, R. A.; Sowers, L. C.; Millar, D. P. Biochemistry 1991, 30, 3271.
7. Menger, M.; Tuschl, T.; Eckstein, F.; Porschke, D. Biochemistry 1996, 35, 14710.
8. Seela, F.; Zulauf, M. Chem. - Eur. J. 1998, 4, 1781.
9. Booth, J.; Cummins, W. J; Brown, T. Chem. Commun. 2004, 2208.
10. Jean, J. M.; Hall, K. B. Biochemistry 2002, 41, 13152.
11. Jean, J. M.; Hall, K. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 37.
12. Foresman, J. B.; Head-Gordon, M.; Pople, J. A.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 135.
13. Foresman, J. B.; Frisch, M. J. In Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, 2nd ed.; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1996.
14. Rogers, D. M.; Besley, N. A.; O'Shead, P.; Hirst, J. D.; Casida, M. E.; Jamorsky, C.; Casida, K. C.; Salahub, D. R. J. Chem. Phys 1998, 108, 4439.
15. Jamorsky, C.; Casida, M. E.; Salahub, D. R. J. Chem. Phys. 1996, 104, 5134.
16. Tretiak, S.; Chernyak, V. J. Chem. Phys. 2003, 119, 8809.
17. Varsano, D.; Di Felice, R.; Marques, M. A. L.; Rubio, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 7129.
18. Ciofini, I.; Daul, C. A.; Adamo, C. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 11182.
19. Aquilante, F.; Barone, V.; Roos, B. O. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12323.
20. Marques, M. A. L.; Lopez, X.; Varsano, D.; Castro, A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 128101.
21. Lopez, X.; Marques, M. A. L.; Castro, A.; Rubio, A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12329.
22. Sundholm, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 2275.
23. Broo, A.; Holmén, A. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3589.
24. Neiss, C.; Saalfrank, P.; Parac, M.; Grimme, S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 140.
25. Tsolaidis, A.; Kaxiras, E. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2373.
26. Sundholm, D. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 4265.
27. Jean, J. M.; Hall, K. B. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 1930.
28. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Vreven, T., Jr.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Kiene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
29. Krishnan, R.; Binkley, J. S.; Seeger, R.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1980, 72, 650.
30. Mclean, A. D.; Chandler, G. S. J. Chem. Phys. 1980, 72, 5639.
31. Shaftenaar, G.; Noordik, J. H. J. Comput.-Aided Mol. Des. 2000, 14, 123.
32. Molecular Simulations. INSIGHT; Molecular Simulations: San Diego, 1997.
33. Ricciardi, G.; Rosa, A.; Van Gisbergen, S. J. A.; Baerends, E. J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 635.
34. Wilson, R. W.; Callis, P. R. J. Chem. Phys. 1976, 80, 2280.
35. Cantor, C. R.; Schimmel, P. R. In Biophysical Chemistry Part II: Techniques for the study of Biological Structure and Function; Freeman: New York, 1980.
36. Dreuw, A.; Head-Gordon, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 4007.