Simulation of actuation by polymeric polyelectrolyte helicenes

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 2, Issue 4, 2006, Pages 1112-1118

  Rempala, Pawel ^a   King, Benjamin T ^a  

^a UNIVERSITY OF NEVADA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33846192350     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct600102r     Document Type: Article

References (20)

1. Kottas, G. S.; Clarke, L. I.; Horinek, D.; Michl, J. Chem. Rev. 2005, 105, 1281-1376.
2. Jang, S. S.; Jang, Y. H.; Kim, Y.-H.; Goddard, W. A., III; Choi, J. W.; Heath, J. R.; Laursen, B. W.; Flood, A. H.; Stoddart, J. F.; Nørgaard, K.; Bjørnholm, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 14804-14816.
3. Lin, K.-J.; Fu, S.-J.; Cheng, C.-Y.; Chen, W.-H.; Kao, H.-M. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 4186-4189.
4. Howse, J. R.; Topham, P.; Crook, C. J.; Gleeson, A. J.; Bras, W.; Jones, R. A. L.; Ryan, A. J. Nano Lett. 2006, 6, 73-77.
5. Piazzesi, G.; Reconditi, M.; Linari, M.; Lucii, L.; Sun, Y.-B.; Narayanan, T.; Boesecke, P.; Lombardi, V.; Irving, M. Nature 2002, 415, 659-662.
6. Balaban, A. T. Polycyclic Aromat. Compd. 2003, 23, 277-296.
7. Jalaie, M.; Weatherhead, S.; Lipkowitz, K. B.; Robertson, D. Electron. J. Theor. Chem. 1997, 2, 268-272.
8. Salvetat, J.-P.; Briggs, G. A. D.; Bonard, J.-M.; Bacsa, R. R.; Kulik, A. J.; Stöckli, T.; Burnham, N. A.; Forro, L. Phys. Rev. Lett. 1999, 82, 944-947.
9. Idiris, A.; Alam, M. T.; Ikai, A. Protein Eng., Des. Sci. 2000, 13, 763-770.
10. Singer, A.; Schuss, Z.; Eisenberg, R. S. J. Stat. Phys. 2005, 119, 1397-1418.
11. Case, D. A.; Pearlman, D. A.; Caldwell, J. W.; Cheatham, T. E., III; Wang, J.; Ross, W. S.; Simmerling, C.; Darden, T.; Merz, K. M.; Stanton, R. V.; Cheng, A.; Vincent, J. J.; Crowley, M.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Radmer, R.; Duan, Y.; Pitera, J.; Massova, I.; Seibel, G. L.; Singh, U. C.; Weiner, P.; Kollman, P. A. Amber 7; University of California: San Francisco, CA, 2002.
12. Wang, J.; Wang, W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Mol. Graphics Modell. 2006, in press, http://amber.scripps.edu/antechamber/ antechamber.html (accessed September 8, 2004).
13. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
14. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
15. Wang, J.; Wolf, R. M.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A.; Case, D. A. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1157-1174.
16. Hawkins, G. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1995, 246, 122-129
17. Hawkins, G. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 19824-19839.
18. Horton, H. R.; Moran, L. A.; Ochs, R. S.; Rawn, J. D.; Scrimgeour, K. G. Principles of Biochemistry, 2nd ed.; Prentice Hall: Upper Saddle River, NJ, 1996.
19. Hubbard, S. R.; Till, J. H. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 373-398.
20. Dlugosz, M.; Antosiewicz, J. M. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 13777-13784.