Vibrational analyses of di-μ-oxo-bridged manganese dimers based on density functional theory calculations. Theoretical evaluation of Mn-O vibrations of the Mn-cluster core for photosynthetic oxygen-evolving complex

Bulletin of the Chemical Society of Japan

Volumn 79, Issue 7, 2006, Pages 1025-1031

  Hasegawa, Koji ^a   Ono, Taka Aki ^a,b  

^a RIKEN   (Japan)

^b IBARAKI UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COORDINATE ANALYSES; ELECTRONIC STATES; OXYGEN EVOLVING COMPLEX (OEC);

COMPLEXATION; MOLECULAR VIBRATIONS; PHOTOSYNTHESIS; PROBABILITY DENSITY FUNCTION;

DIMERS;

BRIDGED COMPOUND; DI MU OXO BRIDGED MANGANESE; DIMER; MANGANESE; MANGANESE OXYGEN MANGANESE; OXYGEN DERIVATIVE; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; INFRARED RADIATION; PHOTOSYNTHESIS; THEORETICAL STUDY; VIBRATION;

EID: 33750581075     PISSN: 00092673     EISSN: 13480634     Source Type: Journal    
DOI: 10.1246/bcsj.79.1025     Document Type: Article

References (57)

1. R. J. Debus, Biochim. Biophys. Acta 1992, 1102, 269.
2. G. Renger, Biochim. Biophys. Acta 2001, 1503, 210.
3. C. Goussias, A. Boussac, A. Rutherford, Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 2002, 357, 1369.
4. J. P. McEvoy, G. W. Brudvig, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4754.
5. K. N. Ferreira, T. M. Iverson, K. Maghlaoui, J. Barber, S. Iwata, Science 2004, 303, 1831.
6. B. Loll, J. Kern, W. Saenger, A. Zouni, J. Biesiadka, Nature 2005, 438, 1040.
7. W. Ruttinger, G. C. Dismukes, Chem. Rev. 1997, 97, 1.
8. V. K. Yachandra, Philos. Trans. R. Soc. London 2002, 357, 1347.
9. J. Messinger, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4764.
10. G. C. Dismukes, Y. Siderer, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1981, 78, 274.
11. S. Mukhopadhyay, S. K. Mandal, S. Bhaduri, W. H. Armstrong, Chem. Rev. 2004, 104, 3981.
12. J. H. Robblee, R. M. Cinco, V. K. Yachandra, Biochim. Biophys. Acta 2001, 1503, 7.
13. H. Haumann, C. Müller, P. Liebisch, L. Iuzzolino, J. Dittmer, M. Grabolle, T. Neisius, W. Meyer-Klaucke, H. Dau, Biochemistry 2005, 44, 1894.
14. G. Socrates, Infrared and Raman Characteristic Group Frequencies, John Wiley & Sons Ltd., Chichester, 2001, pp. 323-327.
15. H.-A. Chu, M. T. Gardner, J. P. O'Brien, G. T. Babcock, Biochemistry 1999, 38, 4533.
16. H.-A. Chu, H. Sackett, G. T. Babcock, Biochemistry 2000, 39, 14371.
17. H.-A. Chu, M. T. Gardner, W. Hillier, G. T. Babcock, Photosynth. Res. 2000, 66, 57.
18. H.-A. Chu, W. Hillier, N. A. Law, G. T. Babcock, Biochim. Biophys. Acta 2001, 1503, 69.
19. H.-A. Chu, R. J. Debus, G. T. Babcock, Biochemistry 2001, 40, 2312.
20. Y. Kimura, N. Mizusawa, A. Ishii, T. Yamanari, T.-a. Ono, Biochemistry 2003, 42, 13170.
21. N. Mizusawa, Y. Kimura, A. Ishii, T. Yamanari, S. Nakazawa, H. Teramoto, T.-a. Ono, J. Biol. Chem. 2004, 279, 29622.
22. Y. Kimura, N. Mizusawa, T. Yamanari, A. Ishii, T.-a. Ono, J. Biol. Chem. 2005, 280, 2078.
23. Y. Kimura, A. Ishii, T. Yamanari, T.-a. Ono, Biochemistry 2005, 44, 7613.
24. L. J. Boucher, C. G. Coe, Inorg. Chem. 1975, 14, 1289.
25. S. R. Cooper, M. Calvin, J. Am. Chem. Soc. 1977, 99, 6623.
26. K. S. Hagen, W. H. Armstrong, H. Hope, Inorg. Chem. 1988, 27, 967.
27. K. J. Brewer, M. Calvin, R. S. Lumpkin, J. W. Otvos, L. O. Spreer, Inorg. Chem. 1989, 28, 4446.
28. H. J. Mok, J. A. Davis, S. Pal, S. K. Mandal, W. H. Armstrong, Inorg. Chem. Acta 1997, 263, 385.
29. H. Torayama, T. Nishide, H. Asada, M. Fujiwara, T. Matsushita, Polyhedron 1998, 17, 105.
30. B. C. Dave, R. S. Czernuscewicz, Inorg. Chem. Acta 1994, 227, 33.
31. J. M. North, R. M. Achey, N. S. Dalal, Phys. Rev. B 2002, 66, 174437.
32. J. M. North, L. J. van de Burgt, N. S. Dalal, Solid State Commun. 2002, 123, 75.
33. A. Cua, J. S. Vrettos, J. C. de Paula, G. W. Brudvig, D. F. Bocian, J. Biol. Inorg. Chem. 2003, 8, 439.
34. J. E. McGrady, R. Stranger, J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 8512.
35. T. Soda, Y. Kitagawa, T. Onishi, Y. Takano, Y. Shigeta, H. Nagao, Y. Yoshioka, K. Yamaguchi, Chem. Phys. Lett. 2000, 319, 223.
36. C. D. Delfs, R. Stranger, Inorg. Chem. 2001, 40, 3061.
37. G. Alluón, E. Ruiz, S. Alvarez, Chem. Eur. J. 2002, 8, 2508.
38. V. Barone, A. Bencini, D. Gatteschi, F. Totti, Chem. Eur. J. 2002, 8, 5019.
39. C. D. Delfs, R. Stranger, Inorg. Chem. 2003, 42, 2495.
40. S. Petrie, S. Mukhopadhyay, W. H. Armstrong, R. Stranger, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4871.
41. S. Petrie, R. Stranger, Inorg. Chem. 2004, 43, 5237.
42. S. Sinnecker, F. Neese, L. Noodleman, W. Lubitz, J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 2613.
43. M. Lundberg, M. R. A. Blomberg, P. E. M. Siegbahn, J. Phys. Chem. B 2004, 43, 264.
44. M. Lundberg, P. E. M. Siegbahn, J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10513.
45. P. E. M. Siegbahn, R. H. Crabtree, J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 117.
46. P. E. M. Siegbahn, M. R. A. Blomberg, Annu. Rev. Phys. Chem. 1999, 50, 221.
47. M. Lundberg, P. E. M. Siegbahn, Phys. Chem. Chem. Phys. 2004, 6, 4772.
48. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez, J. A. Pople, Gaussian 03, Revision C.02, Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2004.
49. Jaguar 5.5, Schrödinger, L.L.C., Portland, OR, 1991-2003.
50. A. D. Becke, J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
51. J. P. Perdew, J. A. Chevary, S. H. Vosko, K. A. Jackson, M. R. Pederson, D. J. Singh, C. Fiolhais, Phys. Rev. B 1992, 46, 6671.
52. J. P. Perdew, K. Burke, Y. Wang, Phys. Rev. B 1996, 54, 16533.
53. P. J. Hay, W. R. Wadt, J. Chem. Phys. 1985, 82, 299.
54. T. Shimanouchi, Computer Program of Normal Coordinate Treatement of Polyatomic Molecules, The University of Tokyo, Tokyo, 1968.
55. H. Yoshida, M. Tasumi, J. Chem. Phys. 1988, 89, 2803.
56. H. Visser, C. E. Dubé, W. H. Armstrong, K. Sauer, V. K. Yachandra, J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11008.
57. J. E. Sheats, R. S. Czernuszewicz, G. C. Dismukes, A. L. Rheingold, V. Petrouleas, J. Stubbe, W. H. Armstrong, R. H. Beer, S. J. Lippard, J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 1435.