Intersite structural rearrangement of the blue copper site induced by substrate binding: Spectroscopic studies of a copper-containing nitrite reductase from Alcaligenes xylosoxidans NCIMB 11015

Inorganic Chemistry

Volumn 45, Issue 21, 2006, Pages 8474-8476

  Kohzuma, Takamitsu ^a   Kikuchi, Makiko ^a   Horikoshi, Naoko ^a   Nagatomo, Shigenori ^b,d   Kitagawa, Teizo ^b   Czernuszewicz, Roman S ^c  

^a IBARAKI UNIVERSITY   (Japan)

^b OKAZAKI INSTITUTE FOR INTEGRATIVE BIOSCIENCE   (Japan)

^c University of Houston   (United States)

^d UNIVERSITY OF TSUKUBA   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; COPPER; NITRITE; NITRITE REDUCTASE;

ALCALIGENES; ARTICLE; CHEMISTRY; ENZYMOLOGY; ISOLATION AND PURIFICATION; RAMAN SPECTROMETRY;

ALCALIGENES; BACTERIAL PROTEINS; COPPER; NITRITE REDUCTASES; NITRITES; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 33750378948     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic0609195     Document Type: Article

References (34)

1. Averill, B. A. Chem. Rev. 1996, 96, 2951.
2. (a) Abraham, Z. H. L.; Lowe, D. J.; Smith, B. E. Biochem. J. 1993, 295, 587.
3. (b) Kohzuma, T.; Shidara, S.; Yamaguchi, K.; Nakamura, N.; Deligeer; Suzuki, S. Chem. Lett. 1993, 2029.
4. (a) Dodd, F. E.; Hasnain, S.; Abraham, Z. H. L.; Eady, R. R.; Smith, B. E. Acta Crystallogr. 1997, D53, 406.
5. (b) Strange, R. W.; Murphy, L. M.; Dodd, F. E.; Abraham, Z. H. L.; Eady, R. R.; Smith, B. E.; Hasnain, S. S. J. Mol. Biol. 1999, 287, 1001.
6. (c) Dodd, F. E.; Van Beeumen, J.; Eady, R. R.; Hasnain, S. S. J. Mol. Biol. 1998, 282, 369.
7. (d) Ellis, M. J.; Dodd, F. E.; Sawers, G.; Eady, R. R.; Hasnain, S. S. J. Mol. Biol. 2003, 328, 429.
8. (e) Hough, M. A.; Ellis, M. J.; Antonyuk, S.; Strange, R. W.; Sawers, G.; Eady, R. R.; Hasnain, S. S. J. Mol. Biol. 2005, 350, 300.
9. Grossmann, J. G.; Abraham, Z. H. L.; Adman, E. T.; Neu, M.; Eady, R. R.; Smith, B. E.; Hasnain, S. S. Biochemistry 1993, 32, 7360.
10. Antonyuk, S. V.; Strange, R. W.; Sawers, G.; Eady, R. R.; Hasnain, S. S. Proc. Natl. Acad. Sci. 2005, 102, 12041.
11. Kukimoto, M.; Nishiyama, M.; Murphy, M. E.; Turly, S.; Adman, E. T.; Horinouchi, S.; Beppu, T. Biochemistry 1994, 33, 5246.
12. (a) Messershmidt, A.; Ladenstein, R.; Huber, R.; Bolognesi, M.; Avigliano, L.; Petruzzeli, R.; Rossi, A.; Finazzi-Agro, A. J. Mol. Biol. 1992, 224, 179.
13. (b) Garavaglia, S.; Cambria, M. T.; Miglio, M.; Ragusa, S.; Iacobazzi, V.; Palmieri, F.; D'Ambrosio, C.; Scaloni, A.; Rizzi, M. J. Mol. Biol. 2004, 342, 1519.
14. Tocheva, E.; Rosell, F. I.; Mauk, A. G.; Murphy, M. E. P. Science 2004, 304, 867.
15. Kohzuma, T.; Shidara, S.; Suzuki, S. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1994, 67, 138.
16. (a) Czernuszewicz, R. S.; Maes, E. M. In Education in Advanced Chemistry; Ziolkowski, J. J., Sobota, P., Eds.; University Publishing House: Wroclaw, Poland, 2000; Vol. 7, p 1.
17. (b) Czernuszewicz, R. S.; Dave, B. C.; Germanas, J. P. In Spectroscopic Methods in Bioinorganic Chemistry; Solomon, I., Hodgson, K. O., Eds.; American Chemical Society: Washington, DC, 1997; Vol. 692, p 220.
18. (c) Dave, B. C.; Germanas, J. P.; Czernuszewicz, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12175.
19. (d) Qiu, D.; Dong, S.; Ybe, J. A.; Hecht, M. H.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6443.
20. (e) Loppnow, G. R.; Fraga, E. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 896.
21. (f) Andrew, C. R.; Sanders-Loehr, J. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 365.
22. Dooley, D. M.; Moog, R. S.; Liu, M.-Y.; Payne, W. J.; LeGall, J. J. Biol. Chem. 1988, 263, 14625.
23. LuBien, C. D.; Winkler, M. E.; Thamann, T. J.; Scott, R. A.; Co, M. S.; Hodgson, K. O.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 7014.
24. Howes, B. D.; Abraham, Z. H. L.; Lowe, D.; Brüser, T.; Eady, R. R.; Smith, B. E. Biochemistry 1994, 33, 3171.
25. Fittipaldi, M.; Wijma, H. J.; Verbeet, M. P.; Canters, G. W.; Groenen, E. J. J.; Huber, M. Biochemistry 2005, 44, 15193.
26. Strange, R. W.; Dodd, F. E.; Abraham, Z. H. L.; Grossmann, J. G.; Brüser, T.; Eady, R. R.; Smith, B. E.; Hasnain, S. S. Struct. Biol. 1995, 2, 287.
27. (a) Abraham, Z. H. L.; Simth, B. E.; Howes, B. D.; Lowe, D. J.; Eady, R. R. Biochem. J. 1997, 324, 511.
28. (b) Prudêncio, M.; Eady, R. R.; Sawers, G. Biochem. J. 2001, 353, 259.
29. (c) Fittipaldi, M.; Wijma, H. J.; Verbeet, M. P.; Canters, G. W.; Groenen, E. J. J.; Huber, M. Biochemistry 2005, 44, 15193.
30. (a) Solomon, E. I.; Lowery, M. D. Science 1993, 259, 1575.
31. (b) Lowery, M. D.; Guckert, J. A.; Gehard, M. S.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 3012.
32. (c) Holm, R. H.; Kennepohl, P.; Solomon, E. I. Chem. Rev. 1996, 96, 2239.
33. Solomon, E. I.; Sundaram, U. M.; Machonkin, T. E. Chem. Rev. 1996, 96, 2563.
34. Beratan, D. N.; Betts, J. N.; Onuchic, J. N. J. Phys. Chem. 1992, 96, 2852.