Determinations of15N chemical shift anisotropy magnitudes in a uniformly15N,13C-labeled microcrystalline protein by three-dimensional magic-angle spinning nuclear magnetic resonance spectroscopy

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 22, 2006, Pages 10926-10936

  Wylie, Benjamin J ^a   Franks, W Trent ^a   Rienstra, Chad M ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANISOTROPY; BENCHMARKING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PROTEINS; SINGLE CRYSTALS;

AMIDE; CHEMICAL SHIFT ANISOTROPY (CSA); IMMUNOGLOBULIN; MAGIC-ANGLE SPINNING;

NITROGEN COMPOUNDS;

NITROGEN; PROTEIN;

ARTICLE; CHEMISTRY; METHODOLOGY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

NITROGEN ISOTOPES; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PROTEINS;

EID: 33745465576     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp060507h     Document Type: Article

References (95)

1. Gutowsky, H. S. Annu. Rev. Phys. Chem. 1954, 5, 333.
2. Oldfield, E. Annu. Rev. Phys. Chem. 2002, 53, 349-378.
3. Oldfield, E. J. Biomol. NMR 1995, 5, 217-225.
4. Paul, E. G.; Grant, D. M. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 1701-1702.
5. Saito, H.; Tabeta, R.; Sjohi, A.; Ozaki, T.; Ando, I. Macromolecules 1983, 16, 1050-1057.
6. Saito, H.; Tabeta, R. Chem. Lett. 1985, 1, 83-86.
7. Saito, H. Magn. Reson. Chem. 1986, 24, 835-852.
8. Ando, I.; Saito, H.; Tabeta, R.; Shoji, A.; Ozaki, T. Macromolecules 1984, 17, 457-461.
9. Spera, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 5490-5492.
10. Wishart, D. S.; Sykes, B. D.; Richards, F. M. Biochemistry 1992, 31, 1647-1651.
11. Wishart, D. S.; Sykes, B. D. J. Biomol. NMR 1994, 4, 171-180.
12. Cornilescu, G.; Delaglio, F.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1999, 13, 289-302.
13. Luca, S.; Filippov, D. V.; van Boom, J. H.; Oschkinat, H.; de Groot, H. J. M.; Baldus, M. J. Biomol. NMR 2001, 20, 325-331.
14. Laws, D. D.; de Dios, A. C.; Oldfield, E. J. Biomol. NMR 1993, 3, 607-612.
15. Wishart, D. S.; Watson, M. S.; Boyko, R. F.; Sykes, B. D. J. Biomol. NMR 1997, 10, 329-336.
16. Wishart, D. S.; Nip, A. M. Biochem. Cell Biol. 1998, 76, 153-163.
17. Witter, R.; Priess, W.; Sternberg, U. J. Comput. Chem. 2002, 23, 298-305.
18. Sternberg, U.; Witter, R.; Ulrich, A. S. Annu. Rep. NMR Spectrosc. 2004, 52, 53-104.
19. Neal, S.; Nip, A. M.; Zhang, H. Y.; Wishart, D. S. J. Biomol. NMR 2003, 26, 215-240.
20. Zhang, H. Y.; Neal, S.; Wishart, D. S. J. Biomol. NMR 2003, 25, 173-195.
21. Wishart, D. Curr. Pharm. Biotechnol. 2005, 6, 105-120.
22. Xu, X. P.; Case, D. A. J. Biomol. NMR 2001, 21, 321-333.
23. Wang, Y. J.; Wishart, D. S. J. Biomol. NMR 2005, 31, 143-148.
24. Case, D. A. Curr. Opin. Struct. Biol. 1998, 8, 624-630.
25. Sitkoff, D.; Case, D. A. Prog. Nucl. Magn. Reson. Spectrosc. 1998, 32, 165-190.
26. Poon, A.; Birn, J.; Ramamoorthy, A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 16577-16585.
27. Le, H. B.; Oldfield, E. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16423-16428.
28. de Dios, A. C.; Oldfield, E. Solid State Nucl. Magn. Reson. 1996, 6, 101-125.
29. Brender, J. R.; Taylor, D. M.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 914-922.
30. Bodenhausen, G.; Ruben, J. Chem. Phys. Lett. 1980, 69, 185-189.
31. Morris, G. A.; Freeman, R. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 760-762.
32. Muller, L. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 4481-4484.
33. Pervushin, K.; Riek, R.; Wider, G.; Wuthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 12366-12371.
34. Pervushin, K.; Riek, R.; Wider, G.; Wuthrich, K. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 6394-6400.
35. Rance, M.; Loria, J. P.; Palmer, A. G. J. Magn. Reson. 1999, 750, 92-101.
36. Shuker, S. B.; Hajduk, P. J.; Meadows, R. P.; Fesik, S. W. Science 1996, 274, 1531-1534.
37. Olejniczak, E. T.; Meadows, R. P.; Wang, H.; Cai, M. L.; Nettesheim, D. G.; Fesik, S. W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9249-9250.
38. Kroenke, C. D.; Loria, J. P.; Lee, L. K.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 7905-7915.
39. Vugmeyster, L.; Kroenke, C. D.; Picart, F.; Palmer, A. G.; Raleigh, D. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5387-5388.
40. Palmer, A. G. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2001, 30, 129-155.
41. Palmer, A. G.; Kroenke, C. D.; Loria, J. P. Nuclear magnetic resonance methods for quantifying microsecond-to-millisecond motions in biological macromolecules. Methods Enzymol. 2001, 339, 204-238.
42. Palmer, A. G. Chem. Rev. 2004, 104, 3623-3640.
43. Massi, F.; Grey, M. J.; Palmer, A. G. Protein Sci. 2005, 14, 735-742.
44. Ramamoorthy, A.; Opella, S. J. Solid State Nucl. Magn. Reson. 1995, 4, 387-392.
45. Ramamoorthy, A.; Wu, C. H.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. 1999, 140, 131-140.
46. Ramamoorthy, A.; Wu, C. H.; Opella, S. J. J. Magn. Reson. B 1995, 107, 88-90.
47. Nevzorov, A. A.; Mesleh, M. F.; Opella, S. J. Magn. Reson. Chem. 2004, 42, 162-171.
48. Park, S. H.; Mrse, A. A.; Nevzorov, A. A.; Mesleh, M. F.; Oblatt-Montal, M.; Montal, M.; Opella, S. J. J. Mol. Biol. 2003, 333, 409-424.
49. Thiriot, D. S.; Nevzorov, A. A.; Zagyanskiy, L.; Wu, C. H.; Opella, S. J. J. Mol. Biol. 2004, 341, 869-879.
50. Opella, S. J.; Marassi, F. M. Chem. Rev. 2004, 104, 3587-3606.
51. Tjandra, N.; Szabo, A.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 6986-6991.
52. Boyd, J.; Redfield, C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 9692-9693.
53. Boyd, J.; Redfield, C. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7441-7442.
54. Damberg, P.; Jarvet, J.; Allard, P.; Graslund, A. J. Biomol. NMR 1999, 15, 27-37.
55. Kroenke, C. D.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10119-10125.
56. Cornilescu, G.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10143-10154.
57. Kurita, J.; Shimahara, H.; Utsunomiya-Tate, N.; Tate, S. J. Magn. Reson. 2003, 163, 163-173.
58. Damberg, P.; Jarvet, J.; Graslund, A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 1995-2005.
59. Loth, K.; Pelupessy, P.; Bodenhausen, G. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 6062-6068.
60. Harbison, G.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 4752-4754.
61. Harbison, G. S.; Jelinski, L. W.; Stark, R. E.; Torchia, D. A.; Herzfeld, J.; Griffin, R. G. J. Magn. Reson. 1984, 60, 79-82.
62. Oas, T. G.; Hartzell, C. J.; Dahlquist, F. W.; Drobny, G. Biophys. J. 1986, 49, A328.
63. Hartzell, C. J.; Whitfield, M.; Oas, T. G.; Drobny, G. P. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 5966-5969.
64. Oas, T. G.; Hartzell, C. J.; Dahlquist, F. W.; Drobny, G. P. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 5962-5966.
65. Lee, D. K.; Wittebort, R. J.; Ramamoorthy, A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 8868-8874.
66. Shoji, A.; Ozaki, T.; Fujito, T.; Deguchi, K.; Ando, I.; Magoshi, J. J. Mol. Struct. 1998, 441, 251-266.
67. Lee, D. K.; Santos, J. S.; Ramamoorthy, A. Chem. Phys. Lett. 1999, 309, 209-214.
68. Shekar, S. C.; Ramamoorthy, A.; Wittebort, R. J. J. Magn. Reson. 2002, 155, 257-262.
69. Chekmenev, E. Y.; Zhang, Q. W.; Waddell, K. W.; Mashuta, M. S.; Wittebort, R. J. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 379-384.
70. Waddell, K. W.; Chekmenev, E. Y.; Wittebort, R. J. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 9030-9035.
71. Herzfeld, J.; Berger, A. E. J. Chem. Phys. 1980, 73, 6021.
72. Hong, M.; Gross, J. D.; Hu, W.; Griffin, R. G. J. Magn. Reson. 1998, 135, 169-177.
73. Franks, W. T.; Zhou, D. H.; Wylie, B. J.; Money, B. G.; Graesser, D. T.; Frericks, H. L.; Sahota, G.; Rienstra, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 12291-12305.
74. Wylie, B. J.; Franks, T.; Graesser, D. T.; Rienstra, C. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11946-11947.
75. Chan, J. C. C.; Tycko, R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 11828-11829.
76. Chan, J. C. C.; Tycko, R. J. Chem. Phys. 2003, 118, 8378-8389.
77. Baldus, M.; Petkova, A. T.; Herzfeld, J. H.; Griffin, R. G. Mol. Phys. 1998, 95, 1197-1207.
78. Rienstra, C. M.; Hohwy, M.; Hong, M.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 10979-10990.
79. Bennett, A. E.; Rienstra, C. M.; Auger, M.; Lakshmi, K. V.; Griffin, R. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 6951-6958.
80. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277-293.
81. Haeberlen, U. High-Resolution NMR in Solids: Selective Averaging; Academic Press: New York, 1976.
82. Bak, M.; Rasmussen, J. T.; Nielsen, N. C. J. Magn. Reson. 2000, 147, 296-330.
83. Waugh, J. S. Average Hamiltonian Theory. In Encyclopedia of Magnetic Resonance; Wiley: New York, 1996; pp 849-854.
84. Ghose, R.; Eykyn, T. R.; Bodenhausen, G. Mol. Phys. 1999, 96, 1281-1288.
85. Eden, M. Concepts Magn. Reson. A 2003, 17, 117-154.
86. Eden, M. Concepts Magn. Reson. A 2003, 18, 1-23.
87. Eden, M. Concepts Magn. Reson. A 2003, 18, 24-55.
88. Eden, M.; Levitt, M. H. J. Magn. Reson. 1998, 132, 220-239.
89. Press: W. H.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T.; Flannery, B. P. Numerical Recipes, 2nd ed.; Cambridge University Press: Cambridge, U. K., 1992; p 963.
90. Dixon, W. T. J. Chem. Phys. 1982, 77, 1800-1809.
91. Kolbert, A. C.; Griffin, R. G. Chem. Phys. Lett. 1990, 166, 87-91.
92. Rienstra, C. M.; Hohwy, M.; Mueller, L. J.; Jaroniec, C. P.; Reif, B.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11908-11922.
93. Hohwy, M.; Jaroniec, C. P.; Reif, B.; Rienstra, C. M.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3218-3219.
94. Zhao, X.; Eden, M.; Levitt, M. H. Chem. Phys. Lett. 2001, 342, 353-361.
95. Gallagher, T.; Alexander, P.; Bryan, P.; Gilliland, G. L. Biochemistry 1994, 33, 4721-4729.