Circadian rhythms in gene transcription imparted by chromosome compaction in the cyanobacterium Synechococcus elongatus

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 103, Issue 22, 2006, Pages 8564-8569

  Smith, Rachelle M ^a   Williams, Stanly B ^a  

^a UNIVERSITY OF UTAH   (United States)

Author keywords

Cyanobacteria; Regulation

Indexed keywords

BACTERIAL PROTEIN; PROTEIN KAIA; PROTEIN KAIB; PROTEIN KAIC; PROTEIN KINASE; PROTEIN SASA; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; AUTOPHOSPHORYLATION; BACTERIAL GENE; CHROMOSOME CONDENSATION; CIRCADIAN RHYTHM; CYANOBACTERIUM; GENE EXPRESSION REGULATION; GENETIC TRANSCRIPTION; KAIA GENE; KAIB GENE; KAIC GENE; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROMOTER REGION; PROTEIN FUNCTION; SYNECHOCOCCUS ELONGATUS;

BACTERIAL PROTEINS; CHROMOSOMES, BACTERIAL; CIRCADIAN RHYTHM; GENE EXPRESSION REGULATION, BACTERIAL; MODELS, BIOLOGICAL; PHOSPHORYLATION; PHOSPHOTRANSFERASES; SYNECHOCOCCUS; TRANSCRIPTION, GENETIC;

SASA; SYNECHOCOCCUS ELONGATUS; SYNECHOCOCCUS ELONGATUS PCC 6301;

EID: 33744779947     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.0508696103     Document Type: Article

References (43)

1. Ditty, J. L., Williams, S. B. & Golden, S. S. (2003) Annu. Rev. Genet. 37, 513-543.
2. Dunlap, J. C. & Lores, J. J. (2004) J. Biol. Rhythms 19, 414-424.
3. Young, M. W. & Kay, S. A. (2001) Nat. Rev. Genet. 2, 702-715.
4. Nakajima, M., Imai, K., Ito, H., Nishiwaki, T., Murayama, Y., Iwasaki, H., Oyama, T. & Kondo, T. (2005) Science 308, 414-415.
5. Tomita, J., Nakajima, M., Kondo, T. & Iwasaki, H. (2005) Science 307, 251-254.
6. Imai, K., Nishiwaki, T., Kondo, T. & Iwasaki, H. (2004) J. Biol. Chem. 279, 36534-36539.
7. Iwasaki, H., Williams, S. B., Kitayama, Y., Ishiura, M., Golden, S. S. & Kondo, T. (2000) Cell 101, 223-233.
8. Mori, T., Saveliev, S. V., Xu, Y., Stafford, W. F., Cox, M. M., Inman, R. B. & Johnson, C. H. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 17203-17208.
9. Nakahira, Y., Katayama, M., Miyashita, H., Kutsuna, S., Iwasaki, H., Oyama, T. & Kondo, T. (2004) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 881-885.
10. Liu, Y., Tsinoremas, N. F., Johnson, C. H., Lebedeva, N. V., Golden, S. S., Ishiura, M. & Kondo, T. (1995) Genes Dev. 9, 1469-1478.
11. Min, H. & Golden, S. S. (2000) J. Bacteriol. 182, 6214-6221.
12. Min, H., Liu, Y., Johnson, C. H. & Golden, S. S. (2004) J. Biol. Rhythms 19, 103-112.
13. Liu, Y., Tsinoremas, N. F., Golden, S. S., Kondo, T. & Johnson, C. H. (1996) Mol. Microbiol. 20, 1071-1081.
14. Oldenburg, D. J. & Bendich, A. J. (2004) J. Mol. Biol. 344, 1311-1330.
15. Gitai, Z., Thanbichler, M. & Shapiro, L. (2005) Trends Microbiol. 13, 221-228.
16. Mori, T., Binder, B. & Johnson, C. H. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93, 10183-10188.
17. Roenneberg, T. & Merrow, M. (2002) J. Biol. Rhythms 17, 495-505.
18. Kondo, T. & Ishiura, M. (1994) J. Bacteriol. 176, 1881-1885.
19. Kondo, T., Tsinoremas, N. F., Golden, S. S., Johnson, C. H., Kutsuna, S. & Ishiura, M. (1994) Science 266, 1233-1236.
20. Mori, T. & Johnson, C. H. (2001) J. Bacteriol. 183, 2439-2444.
21. Ishiura, M., Kutsuna, S., Aoki, S., Iwasaki, H., Andersson, C. R., Tanabe, A., Golden, S. S., Johnson, C. H. & Kondo, T. (1998) Science 281, 1519-1523.
22. Kageyama, H., Kondo, T. & Iwasaki, H. (2003) J. Biol. Chem. 278, 2388-2395.
23. Williams, S. B. & Stewart, V. (1997) Mol. Microbiol. 26, 911-925.
24. Williams, S. B., Vakonakis, I., Golden, S. S. & LiWang, A. C. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 15357-15362.
25. Wolanin, P. M., Thomason, P. A. & Stock, J. B. (2002) Genome Biol. 3, REVIEWS3013.
26. Vakonakis, I., Klewer, D. A., Williams, S. B., Golden, S. S. & LiWang, A. C. (2004) J. Mol. Biol. 342, 9-17.
27. Hatfield, G. W. & Benham, C J. (2002) Annu. Rev. Genet. 36, 175-203.
28. Salvador, M. L., Klein, U. & Bogorad, L. (1998) Mol. Cell. Biol. 18, 7235-7242.
29. Andersson, J. O. & Roger, A. J. (2002) Curr. Biol. 12, 115-119.
30. Cavalier-Smith, T. (2002) Curr. Biol. 12, R62-R64.
31. Driessche, T. V. & Bonotto, S. (1968) Arch. Int. Physiol. Biochim. 76, 205-206.
32. Durnford, D. G., Deane, J. A., Tan, S., McFadden, G. I., Gantt, E. & Green, B. R. (1999) J. Mol. Evol. 48, 59-68.
33. Martin, W., Rujan, T., Richly, E., Hansen, A., Cornelsen, S., Lins, T., Leister, D., Stoebe, B., Hasegawa, M. & Penny, D. (2002) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99, 12246-12251.
34. Brown, S. A., Ripperger, J., Kadener, S., Fleury-Olela, F., Vilbois, F., Rosbash, M. & Schibler, U. (2005) Science 308, 693-696.
35. Curtis, A. M., Seo, S. B., Westgate, E. J., Rudic, R. D., Smyth, E. M., Chakravarti, D., FitzGerald, G. A. & McNamara, P. (2004) J. Biol. Chem. 279, 7091-7097.
36. Naruse, Y., Oh-hashi, K., Iijima, N., Naruse, M., Yoshioka, H. & Tanaka, M. (2004) Mol. Cell. Biol. 24, 6278-6287.
37. Ripperger, J. A. & Schibler, U. (2006) Nat. Genet. 38, 369-374.
38. Smolen, P., Hardin, P. E., Lo, B. S., Baxter, D. A. & Byrne, J. H. (2004) Biophys. J. 86, 2786-2802.
39. Andersson, C. R., Tsinoremas, N. F., Shelton, J., Lebedeva, N. V., Yarrow, J., Min, H. & Golden, S. S. (2000) Methods Enzymol. 305, 527-542.
40. Bustos, S. A. & Golden, S. S. (1991) J. Bacteriol. 173, 7525-7533.
41. Maloy, S. R., Stewart, V. J. & Taytor, R. K. (1996) Genetic Analysis of Pathogenic Bacteria: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Lab. Press, Cold Spring Harbor, NY).
42. Kiyohara, Y. B., Katayama, M. & Kondo, T. (2005) J. Bacteriol. 187, 2559-2564.
43. Mutsuda, M., Michel, K. P., Zhang, X., Montgomery, B. L. & Golden, S. S. (2003) J. Biol. Chem. 278, 19102-19110.