Configurational temperature in membrane simulations using dissipative particle dynamics

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 110, Issue 8, 2006, Pages 3823-3830

  Allen, Michael P ^a  

^a UNIVERSITY OF WARWICK   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; HIGH ENERGY PHYSICS; LIPIDS; WATER;

CONFIGURATIONAL TEMPERATURE; MEMBRANE SIMULATIONS; PARTICLE DYNAMICS SIMULATIONS;

LIQUID MEMBRANES;

EID: 33644886600     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp055119e     Document Type: Article

References (37)

1. Hoogerbrugge, P. J.; Koelman, J. M. V. A. Europhys. Lett. 1992, 19, 155-160.
2. Koelman, J. M. V. A.; Hoogerbrugge, P. J. Europhys. Lett. 1993, 21, 363-368.
3. Groot, R. D.; Warren, P. B. J. Chem, Phys. 1997, 107, 4423-4435.
4. Groot, R. D.; Rabone, K. L. Biophys. J. 2001, 81, 725-736.
5. Kranenburg, M.; Venturoli, M.; Smit, B. Phys. Rev. E 2003, 67, 060901.
6. Shillcock, J. C.; Lipowsky, R. J. Chem. Phys. 2002, 117, 5048-5061.
7. Kranenburg, M.; Smit, B. FEBS Lett. 2004, 568, 15-18.
8. Venturoli, M.; Smit, B.; Sperotto, M. M. Biophys. J. 2005, 88, 1778-1798.
9. Pagonabarraga, I.; Hagen, M. H. J.; Frenkel, D. Europhys. Lett. 1998, 42, 377-382.
10. Lowe, C. P. Europhys. Lett. 1999, 47, 145-151.
11. Gibson, J. B.; Chen, K. Int. J. Mod. Phys. C 1999, 10, 241-261.
12. Besold, G.; Vattulainen, I.; Karttunen, M.; Poison, J. M. Phys. Rev. E 2000, 62, R7611-R7614.
13. Den Otter, W. K.; Clarke, J. H. R. Europhys. Lett. 2001, 53, 426-431.
14. Vattulainen, I.; Karttunen, M.; Besold, G.; Poison, J. M. J. Chem. Phys. 2002, 116, 3967-3979.
15. Nikunen, P.; Karttunen, M.; Vattulainen, I. Comput. Phys. Commun. 2003, 153, 407-423.
16. Shardlow, T. SIAM J. Sci. Comput. 2003, 24, 1267-1282.
17. Peters, E. A. J. F. Europhys. Lett. 2004, 66, 311-317.
18. Stoyanov, S. D.; Groot, R. D. J. Chem. Phys. 2005, 122, 114112.
19. Espanol, P.; Warren, P. Europhys. Lett. 1995, 30, 191-196.
20. Marsh, C. A.; Yeomans, J. M. Europhys. Lett. 1997, 37, 511-516.
21. Den Otter, W. K.; Clarke, J. H. R. Int. J. Mod. Phys. C 2000, 11, 1179-1193.
22. Hirschfelder, J. O. J. Chem. Phys. 1960, 33, 1462-1466.
23. Powles, J. G.; Rickayzen, G.; Heyes, D. M. Mol. Phys. 2005, 103, 1361-1373.
24. Rugh, H. H. Phys. Rev. Lett. 1997, 78, 772-774.
25. Butler, B. D.; Ayton, G.; Jepps, O. G.; Evans, D. J. J. Chem. Phys. 1998, 109, 6519-6522.
26. Jakobsen, A. F.; Mouritsen, O. G.; Besold, G. J. Chem. Phys. 2005, 122, 204901.
27. Hafskjold, B.; Liew, C. C.; Shinoda, W. Mol Simul. 2004, 30, 879-885.
28. Nosé, S. Mol. Phys. 1984, 52, 255-268.
29. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697.
30. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690.
31. Schofield, P.; Henderson, J. R. Proc. R. Soc. London, Ser. A 1982, 379, 231-246.
32. Goetz, R.; Lipowsky, R. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7397-7409.
33. Toxvaerd, S. Phys. Rev. E 1994, 50, 2271-2274.
34. Gans, J.; Shalloway, D. Phys. Rev. E 2000, 61, 4587-4592.
35. Skeel, R. D.; Hardy, D. J. SIAM J. Sci. Comput. 2001, 23, 1172-1188.
36. Engle, R. D.; Skeel, R. D.; Drees, M. J. Comput. Phys. 2005, 206, 432-452.
37. Izaguirre, J. A.; Hampton, S. S. J. Comput. Phys. 2004, 200, 581-604.