Molecular modeling by using the PC gamess program: From diatomic molecules to enzymes

Vestnik Moskovskogo Universiteta Seriya 2 Khimiya

Volumn 45, Issue 2, 2004, Pages 75-102

  Nemukhin, A V ^a   Grigorenko, B L ^a   Granovsky, A A ^a  

^a Division of Physical Chemistry

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 33444456362     PISSN: 05799384     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Review

References (106)

1. Schmidt M.W., Baldridge K.K., Boatz J.A., Elbert S.T., Gordon M.S., Jensen J.H., Koseki S., Matsunaga N., Nguyen K.A., Su S.J., Windus T.L., Dupuis M., Montgomery J.A. // J. Comput. Chem. 1993. 14. P. 1347.
2. http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html
3. http://www.dl.ac.uk/TCSC/QuantumChem/Codes/GAMESS-UK/
4. http.//classic.chem.msu.su/gran/gamess/index.html
5. Tully J. // Modern Theoretical Chemistry, Semiempirical Methods of Electronic Structure Calculations / Ed. G.A. Segal (Plenum, N.Y., 1977), V.7A, Chap. 6.
6. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L. // Chem. Phys. Lett. 1997. 276. P. 171.
7. Grigorenko B.L. Nemukhin A.V., Apkarian V.A. // Chem. Phys. 1998. 232. P. 321.
8. Roos B.O., Taylor P.R., Siegbahn P.E.M. // Chem. Phys. 1980. 48. P. 157.
9. Siegbahn P.E.M., Almhuf J., Heiberg A., Roos B.O. // J. Chem. Phys. 1981. 74. P. 2384.
10. Almlof J., Nemukhin A.V., Heiberg A. // Int. J. Quantum Chem. 1981. 20. P. 655.
11. Partridge H., Schwenke D.W. // J. Chem.Phys. 1997. 106. P. 4618.
12. Grigorenko B.L., Nemukhin A.V., Topol I.A., Burt S.K. //J. Chem. Phys. 2000. 113. P. 2638.
13. Nakano H. // J. Chem. Phys. 1993. 99. P. 7983.
14. Grigorenko B.L., Nemukhin A.V., Apkarian V.A. // Chem. Phys. 1998. 108. P. 4413.
15. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L., Granovsky A.A. //Chem.Phys. Lett. 1999. 301. P. 287.
16. Grigorenko B.L., Khriachtchev L., Nemukhin A.V., Pettersson M., Isoniemi E., Rosonen M. // J. Chem. Phys. 1999. 110. P. 5836.
17. Firsov D.A., Grigorenko B.L., Nemukhin A.V., Khriachtchev L., Räsänen M. // Chem. Phys. Lett. 2001. 338. P. 317.
18. Pierloot K., Dumez B., Widmark P.-O., Roos B.O. //Theoret. Chim. Acta. 1995. 90. P. 87.
19. Bruna P.J., Hirsch G. // Molec. Phys. 1987. 61. P. 1359.
20. Hirst D.M., Guest M.F. // Mol. Phys. 1982. 46. P. 427.
21. Vivie R., Marian C.M., Peyerimhoff S.D. // Molec. Phys. 1988. 63. P. 3.
22. Yamanishi M., Hirao K., Yamashita K. // J. Chem. Phys. 1998. 108. P. 1514.
23. Hurley M.M., Pacios L.K., Christiansen P.A., Ross R.B., Ermler W.C. // J. Chem. Phys. 1986. 84. P. 6840.
24. Nemukhin A.V., Ermilov A.Yu., Petrukhina M.A., Klocucher W.E., Smets J. // Spectrochimica Acta PartA. 1997. 53. P. 1803.
25. Klotzbächer W.E., Petrukhina M.A., Nemukhin A.V., Ermilov A.Yu., Grigorenko B.L. // Spectrochimica Acta Part A. 2001. 57. P. 1093.
26. Dolg M., Stoll H., Savin A., Preuss H. // Theor. Chim. Acta. 1989. 75. P. 173.
27. Stevens W.L., Basch H., Krauss M. //J.Chem.Phys. 1984. 81. P. 6026.
28. Schleyer P.v.R., Wurthwein E.-U., Pople J.A. // J. Am. Chem. Soc. 1982. 104. P. 5839.
29. Reed A.E., Curtiss L.A., Weinhold F. // Chem. Rev. 1988. 88. P. 89.
30. Nemukhin A.V. // J. Molec. Struct. (Theochem). 1994. 315. P. 225.
31. Nemukhin A.V., Weinhold F. // J. Chem. Phys. 1992. 97. P. 3420.
32. Nemukhin A. V., Almlöf J. // J. Molec. Struct. (Theochem). 1992. 253. P. 101.
33. Imuzu Y., Klabunde K.J. // Inorg. Chem. 1984. 23. P. 3602.
34. Klabunde K.J., Whetten A. // J. Am. Chem. Soc. 1986. 108. P. 6529.
35. Nemukhin A.V., Topol I.A., Weinhold F. // Inorg. Chem. 1995. 34. P. 2980.
36. Nemukhin A.V., Solov'ev V.N., Sergeev G.B., Topol I.A. // Mendeleev Comm. 1996. No1. C. 5.
37. Solov'ev V.N., Sergeev G.B., Nemukhin A.V., Burt S.K., Topol I.A. // J. Phys. Chem. A. 1997. 101. P. 8625.
38. Solov'ev V.N., Polikarpov E.V., Nemukhin A.V., Sergeev G.B. // J. Phys. Chem. A. 1999. 103. P. 6721.
39. Bataev V.A., Dolgov E.K., Abramenkov A.V., Pupyshev V.I., Godunov I.A. // Intern. J. Quant. Chem. 2002. 88. P. 414.
40. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L. //Chem. Phys. Lett. 1995. 233. P. 627.
41. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L. // Intern. J. Quant. Chem. 1997. 62. P. 55.
42. Klabunde K.J. Free Atoms, Clusters and Nanoscale Particles. N.Y., 1994.
43. Ermilov A.Yu., Nemukhin A.V., Kovba V.M. // Mendeleev Comm. 1999. No3. P. 88.
44. Kazankov G.M., Dyachenko O.G., Nemukhin A.V., Ryabov A.D. // Mendeleev Comm. 1997. No12. P. 159.
45. Cundary T.R., Stevens W.J. // J. Chem. Phys. 1993. 98. P. 555.
46. Grigorenko B.L., Moskovsky A.A., Nemukhin A.V. // J. Chem. Phys. 1999. 111. P. 4442.
47. Grigorenko B.L., Moskovsky A.A., Nemukhin A.V. // J. Molec. Struct. (Theochem). 2000. 498. P. 47.
48. Moskovsky A.A., Grigorenko B.L., Granovsky A.A., Nemukhin A.V. // Russ. J. Phys. Chem. 2000. 74. P. 228.
49. Moskovsky A.A., Nemukhin A.V. // J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1999. 39. P. 370.
50. Nemukhin A.V., Granovsky A.A., Firsov D.A. // Mendeleev Comm. 1999. No6. P. 215.
51. Ozhegova N.V., Nemukhin A.V., Shabatina T.I., Sergeev C.B. // Mendeleev Comm. 1998. No6. P. 218.
52. Shabatina T.I., Vovk E.V., Ozhegova N.V., Morosov Y.N., Nemukhin A.V., Sergeev G.B. // Materials Science and Engineering C. 1999. 8-9. P. 53.
53. Sergeev G.B., Shabatina T.I., Solov'ev V.N., Nemukhin A.V. // Spectrochimica Acta, Part A. 2000. 56. P. 2527.
54. Nemukhin A.V., Weinhold F. // J. Chem. Phys. 1992. 97. P. 1095.
55. Nemukhin A.V., Weinhold F. // J. Chem. Phys. 1993. 98. P. 1329.
56. Nemukhin A.V., Kolesnikov I.M., Vinokurov V.A. // Mendeleev Comm. 1994. No4. P. 144.
57. Beregovaya I.V., Schchegoleva L.N. // Chem. Phys. Lett. 2001. 348. P. 501.
58. Beregovaya I.V., Schchegoleva L.N. // Intern. J. Quant. Chem. 2002. 88. P. 481.
59. Polikarpov E.V., Granovsky A.A., Nemukhin A.V. //Mendeleev Comm. 2001. No4. P. 150.
60. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L., Khriachtchev L., Tanskanen H., Pettersson M., Rosonen M. // J. Am. Chem. Soc. 2002. 124. P. 10706.
61. Khriachtchev L., Pettersson M., Runeberg N., Lundell J., Rosonen M. // Nature (London). 2000. 406. P. 874.
62. Pettersson M., Khriachtchev L., Lundell J., Rosonen M. //J. Am. Chem. Soc. 1999. 121. P. 11904.
63. Nagel J.F., Morowitz H. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1978. 75. P. 298.
64. Nemukhin A.V., Topol I.A., Grigorenko B.L., Burt S.K. //J. Phys. Chem. B. 2002. 106. P. 1734.
65. Gordon M.S., Freitag M.A., Bandyopadhyay P., Jensen J.H., Kairys V., Stevens W.J. // J. Phys. Chem. A. 2001. 105. P. 293.
66. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L., Skasyrskaya E.Ya., Topol I.A., Burt S.K. // J. Chem. Phys. 2000. 112. P. 513.
67. Topol I.A., Nemukhin A.V., Dobrogorskaya Ya.I., Burt S.K. //J. Phys. Chem. B. 2001. 105. P. 11341.
68. Nemukhin A.V., Topol I.A., Burt S.K. // Intern. J. Quant. Chem. 2002. 88. P. 34.
69. Warshel A., Levitt M. // J. Mol. Biol. 1976. 103. P. 227.
70. Nemukhin A.V. Grigorenko B.L., Bochenkova A.V., Topol I.A., Burt S.K. // J. Molec. Struct (Theochem). 2002. 581. P. 167.
71. Grigorenko B.L., Nemukhin A.V., Topol I.A., Burt S.K. // J. Phys. Chem. A. 2002. 106. P. 10663.
72. Nemukhin A.V. Grigorenko B.L., Topol I.A., Burt S.K. // J. Phys. Chem. B. 2003. 107. P. 2958.
73. Nemukhin A.V., Grigorenko B.L. Topol I.A., Burt S.K. //J. Comp. Chem. 2003. 24. P. 1410.