Dynamics of nitric oxide rebinding and escape in horseradish peroxidase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 128, Issue 5, 2006, Pages 1444-1445

  Ye, Xiong ^a   Yu, Anchi ^a   Champion, Paul M ^a  

^a NORTHEASTERN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HORSERADISH PEROXIDASE; NITRIC OXIDE;

ARTICLE; CRYSTAL STRUCTURE; DYNAMICS; ENTROPY; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME KINETICS; LIGAND BINDING;

BINDING, COMPETITIVE; FERRIC COMPOUNDS; FERROUS COMPOUNDS; HORSERADISH PEROXIDASE; HYDROXAMIC ACIDS; KINETICS; MYOGLOBIN; NITRIC OXIDE; PHOTOLYSIS;

EID: 32244442436     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja057172m     Document Type: Article

References (27)

1. Tian, W. D.; Sage, J. T.; Champion, P. M.; Chien, E.; Sligar, S. G. Biochemistry 1996, 35, 3487-3502.
2. (a) Scott, E. E.; Gibson, Q. H.; Olson, J. S. J. Biol. Chem. 2001, 276, 5177-5188.
3. (b) Tetreau, C.; Blouquit, Y.; Novikov, E.; Quiniou, E.; Lavalettc, D. Biophys. J. 2004, 86, 435-447.
4. (c) Schmidt, M.; Nienhaus, K.; Pahl, R.; Krasselt, A.; Anderson, S.; Parak, F.; Nienhaus, G. U.; Srajer, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11704-11709.
5. (a) Olson, J. S.; Phillips, G. N., Jr. J. Biol. Chem. 1996, 271, 17593-17596.
6. (b) Wang, Y.; Baskin, J. S.; Xia, T.; Zewail, A. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 18000-18005.
7. (c) Dantsker, D.; Samuni, U.; Friedman, J. M.; Agmon, N. Biochim. Biophys. Acta 2005, 1749, 234-251.
8. Cao, W.; Christian, J. F.; Champion, P. M.; Rosca, F.; Sage, J. T. Biochemistry 2001, 40, 5728-5737.
9. Veitch, N. C. Phytochemistry 2004, 65, 249-259.
10. Doster, W.; Bowne, S. F.; Frauenfelder, H.; Reinisch, L.; Shyamsunder, E. J. Mol. Biol. 1987, 194, 299-312.
11. Coletta, M.; Ascoli, F.; Brunori, M.; Traylor, T. G. J. Biol. Chem. 1986, 261, 9811-9814.
12. Berinstain, A. B.; English, A. M.; Hill, B. C.; Sharma, D. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 9649-9651.
13. (a) Petrich, J. W.; Lambry, J. C.; Kuczera, K.; Karplus, M.; Poyart, C.; Martin, J. L. Biochemistry 1991, 30, 3975-3987.
14. (b) Kim, S.; Jin, G.; Lim, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 20366-20375.
15. (c) Shreve, A. P.; Franzen, S.; Simpson, M. C.; Dyer, R. B. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 7969-7975.
16. Chowdhury, P. K.; Kundu, S.; Halder, M.; Das, K.; Hargrove, M. S.; Petrich, J. W. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 9122-9127.
17. Negrerie, M.; Berka, V.; Vos, M. H.; Liebl, U.; Lambry, J. C.; Tsai, A. L.; Martin, J. L. J. Biol. Chem. 1999, 274, 24694-24702.
18. Ionascu, D.; Gruia, F.; Ye, X.; Yu, A.; Rosca, F.; Beck, C.; Demidov, A.; Olson, J.; Champion, P. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 16921-16934.
19. Henriksen, A.; Schuller, D. J.; Meno, K.; Welinder, K. G.; Smith, A. T.; Gajhede, M. Biochemistry 1998, 37, 8054-8060.
20. See Supporting Information for details.
21. Khajehpour, M.; Rietveld, I.; Vinogradov, S.; Prabhu, N. V.; Sharp, K. A.; Vanderkooi, J. M. Proteins 2003, 53, 656-666.
22. Dantsker, D.; Roche, C.; Samuni, U.; Blouin, G.; Olson, J. S.; Friedman, J. M. J. Biol. Chem. 2005, 280, 38740-38755.
23. Ye, X.; Yu, A.; Georgiev, G. Y.; Gruia, F.; Ionascu, D.; Cao, W.; Sage, J. T.; Champion, P. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 5854-5861.
24. Alben, J. O.; Beece, D.; Bowne, S. F.; Doster, W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Good, D.; McDonald, J. D.; Marden, M. C.; Moh, P. P.; Reinisch, L.; Reynolds, A. H.; Shyamsunder, E.; Yue, K. T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 3744-3748.
25. Morikis, D.; Champion, P. M.; Springer, B. A.; Sligar, S. G. Biochemistry 1989, 28, 4791-4800.
26. Zhu, L.; Sage, J. T.; Rigos, A. A.; Morikis, D.; Champion, P. M. J. Mol. Biol. 1992, 224, 207-215.
27. Zelent, B.; Kaposi, A. D.; Nucci, N. V.; Sharp, K. A.; Dalosto, S. D.; Wright, W. W.; Vanderkooi, J. M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10317-10324.