Quantum study of the structure of the active site of methylamine dehydrogenase

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 105, Issue 6, 2005, Pages 937-945

  Pierdominici Sottile, Gustavo ^a   Echave, Julian ^a   Palma, Juliana ^a  

^a UNIVERSIDAD NACIONAL DE QUILMES   (Argentina)

Author keywords

H+ transfer; Methylamine dehydrogenase; TTQ cofactor

Indexed keywords

AMINES; AMMONIA; ENZYMES; ESTIMATION; FORMALDEHYDE; IONIZATION; OPTIMIZATION; PROTONS;

H+ TRANSFER; METHYLAMINE DEHYDROGENASE; PUTATIVE ACCEPTORS; TTQ COFACTOR;

QUANTUM THEORY;

EID: 30544435929     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.20726     Document Type: Conference Paper

References (23)

1. Debeer, R.; Duine, J. A.; Frank, J.; Large, P. J. Biochim Biophys Acta 1980, 622, 370.
2. Davidson, V. L. Marcel Dekker: New York, 1993; p 73.
3. Anthony, C. The Biochemistry of Methyloprophs; Academic Press: San Diego, CA, 1982.
4. Labesse, I.; Ferrari, D.; Chen, Z. W.; Rossi, G. L.; Kuusk, V.; McIntire, W. S.; Mathews, F. S. J Biol Chem 1998, 273, 25703.
5. Chistoserdov, A. Y.; Chistoserdova, L. V.; McIntire, W. S.; Lidstrom, M. E. J Bacteriol 1994, 176, 4052.
6. Ubbink, M.; Vankleef, M. A. G.; Kleinjan, D. J.; Hoitink, C. W. G.; Huitema, F.; Beintema, J. J.; Duine, J. A.; Canters, G. W. Eur J Biochem 1991, 202, 1003.
7. Chistoserdov, A. Y.; Boyd, J.; Mathews, F. S.; Lidstrom, M. E. Biochem Biophys Res Commun 1992, 184, 1181.
8. Chistoserdov, A. Y.; McIntire, W. S.; Mathews, F. S.; Lidstrom, M. E. J Bacteriol 1994, 176, 4073.
9. Kiriukhin, M. Y.; Chistoserdov, A. Y.; Tsygankov, Y. D. Methods Enzymol 1990, 188, 247.
10. Chen, L. Y.; Doi, N.; Durley, R. C. E.; Chistoserdov, A. Y.; Lidstrom, M. E.; Davidson, V. L.; Mathews, F. S. J Mol Biol 1998, 276, 131.
11. Brooks, H. B.; Jones, L. H.; Davidson, V. L. Biochemistry 1993, 32, 2725.
12. Basran, J.; Sutcliffe, M. J.; Scrutton, N. S. Biochemistry 1999, 38, 3218.
13. Davidson, V. L.; Jones, L. H.; Graichen, M. E. Biochemistry 1992, 31, 3385.
14. Huizinga, E. G.; Vanzanten, B. A. M.; Duine, J. A.; Jongejan, J. A.; Huitema, P.; Wilson, K. S.; Hol, W. G. J. Biochemistry 1992, 31, 9789.
15. Sun, D. P.; Jones, L. H.; Mathews, F. S.; Davidson, V. L. Protein Eng 2001, 14, 675.
16. Tresadern, G.; Wang, H.; Faulder, P. F.; Burton, N. A.; Hillier, I. H. Mol Phys 2003, 101, 2775.
17. Tresadern, G.; Mcnamara, J. P.; Mohr, M.; Wang, H.; Burton, N. A.; Millier, I. H. Chem Phys Lett 2002, 358, 489.
18. Alhambra, C.; Sanchez, M. L.; Corchado, J. C.; Gao, J.; Truhlar, D. G. Chem Phys Lett 2002, 355, 388.
19. Faulder, P. F.; Tresadern, G.; Chohan, K. K.; Scrutton, N. S.; Sutcliffe, M. J.; Hillier, I. H.; Burton, N. A. J Am Chem Soc 2001, 123, 8604.
20. Mincer, J. S.; Schwartz, S. D. J Chem Phys 2004, 120, 7755.
21. Siebrand, W.; Smedarchina, Z. J Phys Chem B 2004, 108, 4185.
22. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuceria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Klifford, C.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghabachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. B.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Kamaromi, I.; Gompertz, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keithz, T.; Al-laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gil, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andrés, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Popple, J. A. Gaussian 98; Revision A.7; Gaissian: Pittsburgh, PA, 1998.
23. Itoh, S.; Ogino, M.; Haranou, S.; Terasaka, T.; Ando, T.; Komatsu, M.; Ohshiro, Y.; Fukuzumi, S.; Kano, K.; Takagi, K.; Ikeda, T. J Am Chem Soc 1995, 117, 1485.