Dynamics of DNA in the flow-gradient plane of steady shear flow: Observations and simulations

Macromolecules

Volumn 38, Issue 5, 2005, Pages 1967-1978

  Schroeder, Charles M ^a   Teixeira, Rodrigo E ^a   Shaqfeh, Eric S G ^a   Chu, Steven ^b  

^a Stanford University   (United States)

^b STANFORD UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BROWNIAN DYNAMICS (BD); FLUORESCENCE MICROSCOPY; HYDRODYNAMIC INTERACTIONS (HI); SHEAR VISCOSITY;

ANGLE MEASUREMENT; BROWNIAN MOVEMENT; COMPUTER SIMULATION; FLUORESCENCE; HYDRODYNAMICS; MICROSCOPIC EXAMINATION; MOLECULAR DYNAMICS; POLYMERS; RHEOLOGY; SHEAR FLOW; STRESS ANALYSIS; VISCOSITY OF LIQUIDS;

DNA;

EID: 15244340199     PISSN: 00249297     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ma0480796     Document Type: Article

References (50)

1. Larson, R. G. The Structure and Rheology of Complex Fluids; Oxford University Press: New York, 1999.
2. Öttinger, H. C. Stochastic Processes in Polymeric Fluids; Springer: Berlin, 1996.
3. De Gennes, P. G. J. Chem. Phys. 1974, 60, 5030.
4. Batchelor, G. K. An Introduction to Fluid Dynamics; Cambridge University Press: Cambridge, 2000.
5. Fuller, G. G.; Leal, L. G. Rheol. Acta 1980, 19, 580.
6. Babcock, H. P.; Teixeira, R. E.; Hur, J. S.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Macromolecules 2003, 36, 4544.
7. Perkins, T. T.; Smith, D. E.; Chu, S. Science 1997, 276, 2016.
8. Smith, D. E.; Babcock, H. P.; Chu, S. Science 1999, 283, 1724.
9. Teixeira, R. E.; Babcock, H. B.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Macromolecules, submitted for publication.
10. Liu, T. W J. Chem. Phys. 1989, 90, 5826.
11. Doyle, P. S.; Shaqfeh, E. S. G.; Gast, A. P. J. Fluid Mech. 1997, 334, 251.
12. Cottrell, F. R.; Merrill, E. W.; Smith, K. A. J. Polym. Sci., Polym. Phys. 1969, 7, 1415.
13. Link, A.; Springer, J. Macromolecules 1993, 26, 464.
14. Zisenis, M.; Springer, J. Polymer 1994, 35, 3156.
15. Lee, E. C.; Solomon, M. J.; Muller, S. J. Macromolecules 1997, 30, 7313.
16. Lee, E. C.; Muller, S. J. Macromolecules 1999, 32, 3295.
17. Li, L.; Larson, R. G. Macromolecules 2000, 33, 1411.
18. Perkins, T. T.; Smith, D. E.; Larson, R. G.; Chu, S. Science 1995, 268, 83.
19. Smith, D. E.; Chu, S. Science 1998, 281, 1335.
20. Schroeder, C. M.; Babcock, H. P.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Science 2003, 301, 1515.
21. Babcock, H. P.; Smith, D. E.; Hur, J. S.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 2018.
22. Zylka, W.; Öttinger, H. C. J. Chem. Phys. 1988, 90, 474.
23. Bird, R. B.; Curtiss, C. F.; Armstrong, R. C.; Hassager, O. Dynamics of Polymeric Liquids, 2nd ed.; Wiley: New York, 1987; Vol. 2.
24. Wedgewood, L. E. J. Non-Newtonian Fluid Mech. 1989, 31, 127.
25. Hur, J. S.; Shaqfeh, E. S. G.; Larson, R. G. J. Rheol. 2000, 44, 713.
26. Marko, J. F.; Siggia, E. D. Macromolecules 1995, 28, 8759.
27. Hur, J. S.; Shaqfeh, E. S. G.; Babcock, H. P.; Smith, D. E.; Chu, S. J. Rheol. 2001, 45, 421.
28. Lyulin, A. V.; Adolf, D. B.; Davies, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 111, 758.
29. Kröger, M.; Alba-Perez, A.; Laso, M.; Öttinger, H. C. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4767.
30. Jendrejack, R. M.; Graham, M. D.; de Pablo, J. J. J. Chem. Phys. 2000, 113, 2894.
31. Jendrejack, R. M.; de Pablo, J. J.; Graham, M. D. J. Chem. Phys. 2002, 116, 7752.
32. Cascales, J. J. L.; de la Torre, J. G. Polymer 1991, 32, 3359.
33. Cascales, J. J. L.; Díaz, F. G.; de la Torre, J. G. Polymer 1995, 36, 345.
34. Cascales, J. J. L.; Navarro, S.; de la Torre, J. G. Macromolecules 1992, 25, 3574.
35. Cifre, J. G. H.; de la Torre, J. G. Macromol. Theory Simul. 2004, 13, 273.
36. Hsieh, C. C.; Li, L.; Larson, R. G. J. Non-Newtonian Fluid Mech. 2003, 113, 147.
37. Schroeder, C. M.; Shaqfeh, E. S. G.; Chu, S. Macromolecules 2004, 37, 9242.
38. Press, W. H.; et al. Numerical Recipes in Fortran 77; Cambridge University Press: Cambridge, 1997.
39. Ermak, D. L.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1352.
40. Russel, W. B.; Saville, D. A.; Schowalter, W. R. Colloidal Dispersions; Cambridge University Press: New York, 1989.
41. Rotne, J.; Prager, S. J. Chem. Phys. 1989, 50, 4831.
42. Somasi, M.; Khomami, B.; Woo, N. J.; Hur, J. S.; Shaqfeh, E. S. G. J. Non-Newtonian Fluid Mech. 2002, 108, 227.
43. Doi, M.; Edwards, S. F. The Theory of Polymer Dynamics; Clarendon: Oxford, 1986.
44. Smith, D. E.; Perkins, T. T.; Chu, S. Macromolecules 1996, 29, 1372.
45. Bossart, J.; Öttinger, H. C. Macromolecules 1997, 30, 5527.
46. Liu, S.; Ashok, M.; Muthukumar, M. Polymer 2004, 45, 1383.
47. Aust, C.; Kröger, M.; Hess, S. Macromolecules 1999, 32, 5660.
48. Woo, N. J.; Shaqfeh, E. S. G. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2908.
49. Chopra, M.; Larson, R. G. J. Rheol. 2002, 46, 831.
50. Woo, N. J.; Shaqfeh, E. S. G.; Khomami, B. J. Rheol. 2004, 48, 299.