On the calculation of vibrational energy relaxation rate constants from centroid molecular dynamics simulations

Journal of Chemical Physics

Volumn 119, Issue 17, 2003, Pages 9030-9046

  Shi, Qiang ^a   Geva, Eitan ^a  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; DEGREES OF FREEDOM (MECHANICS); EXTRAPOLATION; FOURIER TRANSFORMS; MOLECULAR DYNAMICS; QUANTUM THEORY; RATE CONSTANTS;

CENTROID MOLECULAR DYNAMICS (CMD); VIBRATIONAL ENERGY RELAXATION (VER) RATE CONSTANTS;

MOLECULAR VIBRATIONS;

EID: 0344898992     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.1613636     Document Type: Article

References (153)

1. D. W. Oxtoby, Adv. Chem. Phys. 47, (Part 2), 487 (1981).
2. D. W. Oxtoby, Annu. Rev. Phys. Chem. 32, 77 (1981).
3. D. W. Oxtoby, J. Phys. Chem. 87, 3028 (1983).
4. J. Chesnoy and G. M. Gale, Ann. Phys. (Paris) 9, 893 (1984).
5. J. Chesnoy and G. M. Gale, Adv. Chem. Phys. 70, (Part 2), 297 (1988).
6. C. B. Harris, D. E. Smith, and D. J. Russell, Chem. Rev. 90, 481 (1990).
7. D. W. Miller and S. A. Adelman, Int. Rev. Phys. Chem. 13, 359 (1994).
8. R. M. Stratt and M. Maroncelli, J. Phys. Chem. 100, 12981 (1996).
9. J. C. Owrutsky, D. Raftery, and R. M. Hochstrasser, Annu. Rev. Phys. Chem. 45, 519 (1994).
10. T. Elsaesser and W. Kaiser, Annu. Rev. Phys. Chem. 42, 83 (1991).
11. W. F. Calaway and G. E. Ewing, J. Chem. Phys. 63, 2842 (1975).
12. S. R. J. Brueck and R. M. Osgood, Chem. Phys. Lett. 39, 568 (1976).
13. A. Laubereau and W. Kaiser, Rev. Mod. Phys. 50, 607 (1978).
14. B. Faltermeier, R. Protz, M. Maier, and E. Werner, Chem. Phys. Lett. 74, 425 (1980).
15. B. Faltermeier, R. Protz, and M. Maier, Chem. Phys. 62, 377 (1981).
16. M. Chateau et al., J. Chem. Phys. 71, 4799 (1979).
17. C. Delalande and G. M. Gale, J. Chem. Phys. 73, 1918 (1980).
18. P. Roussignol, C. Delalande, and G. M. Gale, Chem. Phys. 70, 319 (1982).
19. E. J. Heilweil, F. E. Doany, R. Moore, and R. M. Hochstrasser, J. Chem. Phys. 76, 5632 (1982).
20. E. J. Heilweil, M. P. Casassa, R. R. Cavanagh, and J. C. Stephenson, Chem. Phys. Lett. 117, 185 (1985).
21. E. J. Heilweil, M. P. Casassa, R. R. Cavanagh, and J. C. Stephenson, J. Chem. Phys. 85, 5004 (1986).
22. A. L. Harris, J. K. Brown, and C. B. Harris, Annu. Rev. Phys. Chem. 39, 341 (1988).
23. M. E. Paige, D. J. Russell, and C. B. Harris, J. Chem. Phys. 85, 3699 (1986).
24. J. C. Owrutsky et al., Chem. Phys. Lett. 184, 368 (1991).
25. A. Moustakas and E. Weitz, J. Chem. Phys. 98, 6947 (1993).
26. D. A. V. Kliner, J. C. Alfano, and P. F. Barbara, J. Chem. Phys. 98, 5375 (1993).
27. D. Zimdars et al., Phys. Rev. Lett. 70, 2718 (1993).
28. N. Pugliano, A. Z. Szarka, S. Gnanakaran, and R. M. Hochstrasser, J. Chem. Phys. 103, 6498 (1995).
29. M. E. Paige and C. B. Harris, Chem. Phys. 149, 37 (1990).
30. A. Salloum and H. Dubost, Chem. Phys. 189, 179 (1994).
31. A. Tokmakoff, B. Sauter, and M. D. Fayer, J. Chem. Phys. 100, 9035 (1994).
32. A. Tokmakoff and M. D. Fayer, J. Chem. Phys. 103, 2810 (1995).
33. R. S. Urdahl et al., J. Chem. Phys. 107, 3747 (1997).
34. J. C. Owrutsky, M. Li, B. Locke, and R. M. Hochstrasser, J. Phys. Chem. 99, 4842 (1995).
35. R. Laenen, C. Rauscher, and A. Laubereau, Phys. Rev. Lett. 80, 2622(1998).
36. S. Woutersen, U. Emmerichs, H. Nienhuys, and H. J. Bakker, Phys. Rev. Lett. 81, 1106 (1998).
37. D. J. Myers et al., J. Chem. Phys. 109, 5971 (1998).
38. D. E. Sagnella et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96, 14324 (1999).
39. P. Hamm, M. Lim, and R. M. Hochstrasser. J. Chem. Phys. 107, 1523 (1997).
40. Q. Shi and E. Geva, J. Chem. Phys. 118, 7562 (2003).
41. A. Nitzan, S. Mukamel, and J. Jortner, J. Chem. Phys. 60, 3929 (1974).
42. A. Nitzan, S. Mukamel, and J. Jortner, J. Chem. Phys. 63, 200 (1975).
43. S. A. Egorov and J. L. Skinner, J. Chem. Phys. 105, 7047 (1996).
44. K. F. Everitt, S. A. Egorov, and J. L. Skinner, Chem. Phys. 235, 115 (1998).
45. K. P. Everitt and J. L. Skinner, J. Chem. Phys. 110, 4467 (1999).
46. J. Poulsen and P. J. Rossky, J. Chem. Phys. 115, 8014 (2001).
47. D. C. Douglass, J. Chem. Phys. 35, 81 (1961).
48. S. A. Adelman and R. H. Stote, J. Chem. Phys. 88, 4397 (1988).
49. R. H. Stote and S. A. Adelman, J. Chem. Phys. 88, 4415 (1988).
50. S. A. Adelman, R. Muralidhar, and R. H. Stote, J. Chem. Phys. 95, 2738 (1991).
51. E. Rabani and D. R. Reichman, J. Phys. Chem. B 105, 6550 (2001).
52. N. Makri, Annu. Rev. Phys. Chem. 50, 167 (1999).
53. B. J. Berne, J. Jortner, and R. Gordon, J. Chem. Phys. 47, 1600 (1967).
54. J. S. Bader and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 100, 8359 (1994).
55. S. A. Egorov, K. F. Everitt, and J. L. Skinner, J. Phys. Chem. A 103, 9494 (1999).
56. S. A. Egorov and J. L. Skinner, J. Chem. Phys. 112, 275 (2000).
57. J. L. Skinner and K. Park, J. Phys. Chem. B 105, 6716 (2001).
58. D. Rostkier-Edelstein, P. Graf, and A. Nitzan, J. Chem. Phys. 107, 10470 (1997).
59. D. Rostkier-Edelstein, P. Graf, and A. Nitzan, J. Chem. Phys. 108, 9598 (1998).
60. K. F. Everitt, J. L. Skinner, and B. M. Ladanyi, J. Chem. Phys. 116, 179 (2002).
61. P. H. Berens, S. R. White, and K. R. Wilson, J. Chem. Phys. 75, 515 (1981).
62. L. Frommhold, in Cambridge Monographs on Atomic, Molecular, and Chemical Physics. 1st ed. (Cambridge University Press, England, 1993), Vol. 2.
63. J. L. Skinner, J. Chem. Phys. 107, 8717 (1997).
64. S. C. An, C. J. Montrose, and T. A. Litovitz, J. Chem. Phys. 64, 3717 (1976).
65. S. A. Egorov and J. L. Skinner, Chem. Phys. Lett. 293, 439 (1998).
66. P. Schofield, Phys. Rev. Lett. 4, 239 (1960).
67. P. A. Egelstaff, Adv. Phys. 11, 203 (1962).
68. G. R. Kneller, Mol. Phys. 83, 63 (1994).
69. G. D. Billing, Chem. Phys. Lett. 30, 391 (1975).
70. G. D. Billing, J. Chem. Phys. 99, 5849 (1993).
71. J. C. Tully and R. K. Preston, J. Chem. Phys. 55, 562 (1971).
72. J. C. Tully, J. Chem. Phys. 93, 1061 (1990).
73. P. J. Kuntz, J. Chem. Phys. 95, 141 (1991).
74. A. I. Krylov et al., J. Chem. Phys. 104, 3651 (1996).
75. K. Yamashita and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 82, 5475 (1985).
76. E. Gallicchio and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 105, 7064 (1996).
77. E. Gallicchio, S. A. Egorov, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 109, 7745 (1998).
78. S. A. Egorov, E. Gallicchio, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 107, 9312 (1997).
79. G. Krilov and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 111, 9147 (1999).
80. E. Rabani, G. Krilov, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 112, 2605 (2000).
81. E. Sim, G. Krilov, and B. Berne, J. Phys. Chem. A 105. 2824 (2001).
82. S. Jang, Y. Pak, and G. A. Voth, J. Phys. Chem. A 103, 10289 (1999).
83. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 100, 5093 (1994).
84. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 100, 5106 (1994).
85. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 101, 6157 (1994).
86. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 101, 6168 (1994).
87. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 101, 6184 (1994).
88. G. A. Voth, Adv. Chem. Phys. 93, 135 (1996).
89. S. Jang and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 111, 2357 (1999).
90. S. Jang and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 111, 2371 (1999).
91. D. R. Reichman, P.-N. Roy, S. Jang, and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 113, 919 (2000).
92. A. Calhoun, M. Pavese, and G. A. Voth, Chem. Phys. Lett. 262, 415 (1996).
93. U. W. Schmitt and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 111, 9361 (1999).
94. M. Pavese and G. A. Voth, Chem. Phys. Lett. 249, 231 (1996).
95. K. Kinugawa, P. B. Moore, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 106, 1154 (1997).
96. K. Kinugawa, P. B. Moore, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 109, 610 (1998).
97. K. Kinugawa, Chem. Phys. Lett. 292, 454 (1998).
98. M. Pavese, D. R. Bernard, and G. A. Voth, Chem. Phys. Lett. 300, 93 (1999).
99. R. Ramirez, T. Lopez-Ciudad, and J. C. Noya, Phys. Rev. Lett. 81, 3303 (1998).
100. R. Ramirez and T. Lopez-Ciudad, Phys. Rev. Lett. 83, 4456 (1999).
101. R. Ramirez and T. Lopez-Ciudad, J. Chem. Phys. 111, 3339 (1999).
102. T. Lopez-Ciudad and R. Ramirez, J. Chem. Phys. 113, 10849 (2000).
103. J. Poulsen, S. R. Keiding, and P. J. Rossky, Chem. Phys. Lett. 336, 488 (2001).
104. J. Poulsen and P. J. Rossky, J. Chem. Phys. 115, 8024 (2001).
105. E. Geva, Q. Shi, and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 115, 9209 (2001).
106. Q. Shi and E. Geva, J. Chem. Phys. 116, 3223 (2002).
107. E. Rabani and D. R. Reichman, J. Chem. Phys. 116, 6271 (2002).
108. E. Rabani and D. R. Reichman, Phys. Rev. E 65, 036111 (2002).
109. D. R. Reichman and E. Rabani, J. Chem. Phys. 116, 6279 (2002).
110. H. Wang, X. Sun, and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 108, 9726 (1998).
111. E. Pollak and J. Liao, J. Chem. Phys. 108, 2733 (1998).
112. W. H. Miller, Adv. Chem. Phys. 25, 69 (1974).
113. W. H. Miller, J. Chem. Phys. 53, 3578 (1970).
114. M. F. Herman and E. Kluk, Chem. Phys. 91, 27 (1984).
115. E. J. Heller, J. Chem. Phys. 94, 2723 (1981).
116. K. G. Kay, J. Chem. Phys. 100, 4377 (1994).
117. M. Ovchinnikov and V. A. Apkarian, J. Chem. Phys. 105, 10312 (1996).
118. M. Ovchinnikov and V. A. Apkarian, J. Chem. Phys. 108, 2277 (1998).
119. X. Sun and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 106, 916 (1997).
120. N. Makri and K. Thompson, Chem. Phys. Lett. 291, 101 (1998).
121. W. H. Miller, Faraday Discuss. 110, 1 (1998).
122. J. S. Shao and N. Makri, J. Phys. Chem. A 103, 7753 (1999).
123. K. Thompson and N. Makri, Phys. Rev. E 59, R4729 (1999).
124. O. Kühn and N. Makri, J. Phys. Chem. A 103, 9487 (1999).
125. H. Wang, M. Thoss, and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 112, 47 (2000).
126. M. Ovchinnikov, V. A. Apkarian, and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 184, 7130 (2001).
127. W. H. Miller, J. Phys. Chem. A 105, 2942 (2001).
128. N. Makri and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 116, 9207 (2002).
129. X. Sun, H. Wang, and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 109, 4190 (1998).
130. X. Sun, H. Wang, and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 109, 7064 (1998).
131. H. Wang, X. Song, D. Chandler, and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 110, 4828 (1999).
132. X. Sun and W. H. Miller, J. Chem. Phys. 110, 6635 (1999).
133. Q. Shi and E. Geva, J. Phys. Chem. A (in press).
134. B. J. Berne and D. Thirumalai, Annu. Rev. Phys. Chem. 37, 401 (1986).
135. D. M. Ceperley, Rev. Mod. Phys. 67, 279 (1995).
136. A. Nitzan and R. Silbey, J. Chem. Phys. 60, 4070 (1974).
137. F. E. Figueirido and R. M. Levy, J. Chem. Phys. 97, 703 (1992).
138. A. G. Redfield, IBM Syst. J. 1, 19 (1957).
139. R. K. Wangsness and F. Bloch, Phys. Rev. 89, 728 (1953).
140. C. P. Slichter, Principles of Magnetic Resonance (Springer-Verlag, Berlin, 1990).
141. A. Abragam, The Principles of Nuclear Magnetism (Oxford, London, 1961).
142. J. M. Jean, R. A. Friesner, and G. R. Fleming, J. Chem. Phys. 96, 5827 (1992).
143. H. Gai and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 99, 740 (1993).
144. W. T. Pollard and R. A. Friesner, J. Chem. Phys. 100, 5054 (1994).
145. E. Geva, E. Rosenman, and D. J. Tannor, J. Chem. Phys. 113, 1380 (2000).
146. N. G. V. Kampen, Stochastic Processes in Physics and Chemistry (Elsevier, Amsterdam, 1992).
147. R. Zwanzig, J. Chem. Phys. 34, 1931 (1961).
148. L. Landau and E. Teller, Physik Z. Sobyetunion 10, 34 (1936).
149. R. Kubo, M. Toda, and N. Hashitsume, Statistical Physics II: Nonequilibrium Statistical Mechanics (Springer-Verlag, Berlin, 1983).
150. J. Chesnoy and J. J. Weis, J. Chem. Phys. 84, 5378 (1986).
151. J. Hautman and M. L. Klein, Mol. Phys. 80, 647 (1993).
152. J. A. Barker, D. Henderson, and F. F. Abraham, Physica A 106, 226 (1981).
153. Q. Shi and E. Geva, J. Chem. Phys. 118, 8173 (2003).