Temperature dependence of vibrational energy transfer in a protein molecule

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 14, 2003, Pages 3309-3317

  Moritsugu, Kei ^a,b   Miyashita, Osamu ^b,c   Kidera, Akinori ^a  

^a YOKOHAMA CITY UNIVERSITY   (Japan)

^b KYOTO UNIVERSITY   (Japan)

^c UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; ENERGY TRANSFER; PROTEINS; RELAXATION PROCESSES; THERMAL EFFECTS;

PROTEIN MOLECULES;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0344080468     PISSN: 10895647     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp027823q     Document Type: Article

References (33)

1. Frauenfelder, H.; Slinger, S. G.; Wolynes, P. G. Science (Washington, D.C.) 1991, 254, 1598.
2. Frauenfelder, H.; Parak, F.; Young, R. D. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1988, 17, 451.
3. Kitao, A.; Go, N. Curr. Opin. Struct. Biol. 1999, 9, 164.
4. Amadei, A.; Linssen, A. B. M.; Berendsen, H. J. C. Proteins 1993, 17, 283.
5. Kitao, A.; Hayward, S.; Go, N. Proteins 1998, 33, 496.
6. Moritsugu, K.; Miyashita, O.; Kidera, A. Phys. Rev. Lett. 2000, 85, 3970.
7. Bigwood, R.; Gruebele, M. Chem. Phys. Lett. 1995, 255, 604.
8. Leitner, D. M.; Wolynes, P. G. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 541.
9. Pearman, R.; Gruebele, M. J. Chem. Phys. 1998, 108, 6561.
10. Bigwood, R.; Grubele, M.; Leitner, D. M.; Wolynes, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 5960.
11. Austin, R. H.; Beeson, K. W.; Eisenstein, L.; Frauenfelder, H.; Gunsalus, I. C. Biochemistry 1975, 14, 5355.
12. Iben, I. E. T.; Braunstein, D.; Doster, W.; Frauenfelder, H.; Hong, M. K.; Johnson, J. B.; Luck, S.; Ormos, P.; Schulte, A.; Steinbach, P. J.; Xie, A. H.; Young R. D. Phys. Rev. Lett. 1989, 62, 1916.
13. Doster, W.; Cusack, S.; Petry, W. Nature (London) 1989, 337, 754.
14. Smith, J.; Kuczera, K.; Karplus, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 1601.
15. Tilton, R. F.; Dewan, J. C.; Petsuko, G. A. Biochemistry 1992, 31, 2469.
16. Rasmussen, B. F.; Stock, A. M.; Ringe, D.; Petsuko, G. A. Nature (London) 1992, 557, 423.
17. Zaccai, G. Science (Washington, D.C.) 2000, 258, 1604.
18. Mizutani, Y.; Kitagawa, T. Science (Washington, D.C.) 1997, 278, 443.
19. Lian, T.; Lucke, B.; Kholodenko, Y.; Hochstrasser, R. M. J. Chem. Phys. 1997, 98, 11648.
20. Henry, E. R.; Eaton, W. A.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1986, 83, 8982.
21. Sagnella, D. E.; Straub, J. E. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 7057.
22. Lingle, R., Jr.; Xu, X.; Zhu, H.; Yu, S.-C.; Hopkins, J. B. J. Phys. Chem. 1991, 95, 9320.
23. Li, P.; Sage, J. T.; Champion, P. M. J. Chem. Phys. 1992, 97, 3214.
24. Franzen, S.; Bohn, B.; Poyart, C.; Martin, J. L. Biochemistry 1995, 34, 1224.
25. Petrich, J. W.; Martin, J. L.; Houde, D.; Poyart, C.; Orszag, A. Biochemistry 1987, 26, 7914.
26. Martin, J. L.; Migus, A.; Poyart, C.; Lecarpentier, Y.; Astier, R.; Antonetti, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 173.
27. Norikami, K.; Nakai, T.; Kidera, A.; Saito, M.; Nakamura, H. Comput. Chem. 1996, 100, 2567.
28. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. L; Gould, I. R.; Merz, K. M., Jr.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
29. Wilson, E. B.; Decius, J. C.; Cross, P. C. Molecular Vibrations; McGraw-Hill: New York, 1955.
30. Sakurai J.; Tuan, S. F. Modern Quantum Mechanics; Addison-Wesley: New York, 1995.
31. Chong, S.-H.; Joti, Y.; Kidera, A.; Go, N.; Ostermann, A.; Gassmann, A.; Parak, F. Eur. Biophys. J. 2001, 30, 319-329.
32. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 9135.
33. Steinbach, P. J.; Brooks, B. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 55.