A Brownian dynamics simulation of an acyl chain and a trans-parmaric acid molecule confined in a phospholipid bilayer in the gel and liquid-crystal phases

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 104, Issue 48, 2000, Pages 11579-11584

  Fernandes, M X ^a,c   Garcia De La Torre, J ^b   Castanho, M A R B ^c  

^a UNIVERSITY OF LISBON   (Portugal)

^b UNIVERSITY OF MURCIA   (Spain)

^c INSTITUTO SUPERIOR TÉCNICO   (Portugal)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BROWNIAN MOVEMENT; FATTY ACIDS; GELS; LIPIDS; LIQUID CRYSTALS; SIMULATION;

ACYL CHAIN; BROWNIAN DYNAMICS SIMULATION; MEANFIELD POTENTIALS; PHOSPHOLIPID BILAYER; TRANS PARINARIC ACID;

MOLECULAR DYNAMICS;

EID: 0342903130     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp002415c     Document Type: Article

References (37)

1. Lewis, R. N. A. H.; McEIhaney R. N. In The Structure of Biological Membranes; Yeagle, P., Ed.; CRC Press Inc.: Boca Raton, FL, 1992; p 73.
2. Braganza, L. F.; Worcester, D. L. Biochemistry 1986, 25, 2591.
3. Morris, V.; Madsen, M. S. J. Mol. Biol. 1995, 253, 739.
4. Yang, L.; Glaser, M. Biochemistry 1996, 35, 13966.
5. Welby, M.; Poquet, Y.; Tocanne, J. F. FEBS Lett. 1996, 384, 107.
6. Tieleman, D. P.; Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. Biochim. Biophys. Acta 1997, 1331, 235.
7. Sun, W. J.; Suter, R. M.; Knewtson, M. A.; Worthington, R. C.; Tristram-Nagle, S.; Zhang, R.; Nagle, J. F. Phys. Rev. E 1994, 49, 4665.
8. Büldt, G.; Gaily, H. U.; Seelig, J.; Zaccai, G. J. Mol. Biol. 1979, 134, 673.
9. Zaccai, G.; Büldt, G.; Seelig, A.; Seelig, J. J. Mol. Biol. 1979,134, 693.
10. Wiener, M. C.; Suter, R. M.; Nagle, J. F. Biophys. J. 1989, 55, 315.
11. Heller, H.; Schaefer, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8343.
12. Egberts, E.; Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. Eur. Biophys. J. 1994, 22, 423.
13. Essman, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L. Langnuiir 1995,11,4519.
14. Tu, K.; Tobias, D. J.; Biaise, K.; Klein, M. L. Biophys. J. 1996, 70, 595.
15. Huang, P.; Ferez, J. J.; Loew, G. H. J. Biomol. Struct. Dyn. 1994, 11, 927.
16. Fernandas, M. X.; Huertas, M. L.; Castanho, M. A. R. B.; García de la Torre, J. Biochim. Biophys. Acta 2000, 1463, 131.
17. Huertas, M. L.; Cruz, V.; López Cascales, J. J.; Acuña, A. U.; García de la Torre, J. Biophys. J. 1996, 71, 1428.
18. Mateo, C. R.; Lillo, M. P.; Gonzalez-Rodriguez, J.; Acuña, A. U. Eur. Biophys. J. 1991, 20, 53.
19. Mateo, C. R.; Brochon, J. C.; Lillo, M. P.; Acuña, A. U. Biophys. J. 1993, 65, 2237.
20. Sklar, L. A.; Hudson, B. S.; Simoni, R. D. Biochemistry-1977, 16, 819.
21. Ryckaert, J. P.; Bellemans, A. Chem. Phys. Lett. 1975, 30, 123.
22. Rey, A.; Kolinski, A.; Skolnick. J.; Levine, Y. K. J. Chem. Phys. 1992, 97, 1240.
23. Wiener, M. C.; White, S. H. Biophys. J. 1992, 61, 434.
24. Leermakers, F. A. M.; Scheutjens, J. M. H. M. J. Chem. Phys. 1988, 89, 6912.
25. Yellin, N.; Levin, I. W. Biochemistry 1977, 16, 642.
26. Ermak, D. L.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1352.
27. Iniesta, A.; García de la Torre, J. J. Chem. Phys. 1990, 92, 2015.
28. Rotne, J.; Prager, S. J. Chem. Phys. 1969, 50, 4831.
29. Yamakawa, H. J. Chem. Phys. 1970, 53, 436.
30. Egberts, E.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1988, 89, 3718.
31. Lopes, S.; Fernandes; M. X.; Prieto, M.; Castanho, M. A. R. B. J. Phys. Chem., in press.
32. Kooyman, R. P. H.; Levine, Y. K.; van der Meer, B. W. Chem. Phys. 1981, 60, 317.
33. Pottel, H.; Herreman, W.; ven der Meer, B. W.; Ameloot, M. Chem. Phys. 1986, 702, 37.
34. Shang, Q. Y.; Dou, X.; Hudson, B. S. Nature (London) 1991, 352, 703.
35. Hudson, B. S.; Cavalier, S. In Spectroscoplc membrane probes, Vol. 1; Loew, L. M., Ed.; CRC Press Inc.: Boca Raton, FL, 1988; p 43.
36. Provencher, S. J. Chem. Phys. 1976, 64, 2272.
37. Provencher, S. Biophys. J. 1976, 16, 151.