What happens inside lentivirus or influenza virus infected cells: Insights into regulation of cellular and viral protein synthesis

Methods: A Companion to Methods in Enzymology

Volumn 11, Issue 4, 1997, Pages 383-401

  Gale Jr , Michael ^a   Katze, Michael G ^a  

^a UNIVERSITY OF WASHINGTON SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CELL PROTEIN; MESSENGER RNA; VIRUS PROTEIN; VIRUS RNA;

ARTICLE; GENE CONTROL; GENE EXPRESSION REGULATION; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; INFLUENZA VIRUS; LENTIVIRINAE; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN SYNTHESIS REGULATION; TRANSLATION REGULATION; VIRUS CELL INTERACTION; VIRUS INFECTION;

ANIMALIA; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; INFLUENZA VIRUS; LENTIVIRUS; RNA VIRUSES;

EID: 0342618445     PISSN: 10462023     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/meth.1996.0436     Document Type: Article

References (126)

1. Steffy K., Wong-Staal F. Microbiol. Rev. 55:1991;193-205.
2. Sonenberg N., Meerovitch K. Enzyme. 44:1990;278-291.
3. Krikorian C. R., Read G. S. Biochem. Biophys. Res. Commun. 164:1989;355-361.
4. Pak A. S., Everly D. N., Knight K., Read G. S. Virology. 211:1995;491-506.
5. Agy M. B., Wambach M., Foy K., Katze M. G. Virology. 177:1990;251-258.
6. Agy M. B., Sherbert C. H., Katze M. G. Virology. 217:1996;158-166.
7. Cullen B. R. Cell. 46:1986;973-982.
8. Rosen C. A., Sodroski J., Haseltine W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82:1985;6502-6506.
9. Pavlakis G. N., Felber B. K. The New Biologist. 2:1990;20-31.
10. Katze M. G., Agy M. B. Enzyme. 44:1990;332-346.
11. Beelman C. A., Parker R. Cell. 81:1995;179-183.
12. Decker C. J., Parker R. Trends Biochem. Sci. 19:1994;336-340.
13. Sen G. C., Lengyel P. J. Biol. Chem. 267:1992;5017-5020.
14. Samuel C. E. Virology. 183:1991;1-11.
15. Sen G. C., Ransohoff R. M. Adv. Virus. Res. 42:1993;57-62.
16. Staehli P. Adv. Virus Res. 38:1990;147-200.
17. Meurs E., Chong K. L., Galabru J., Thomas N., Kerr I., Williams B. R. G., Hovanessian A. G. Cell. 62:1990;379-390.
18. Zhou A., Hassel B. A., Silverman R. H. Cell. 72:1993;753-765.
19. Silverman R. H. J. Interferon Res. 14:1994;101-104.
20. Pavlovic J., Staehli P. J. Interferon Res. 11:1991;215-219.
21. Hovanessian A. G. J. Interferon Res. 1:1991;199-205.
22. Yoo B. J., Selby M. J., Choe J., Suh B. S., Choi S. H., Joh J. S., Nuovo G. J., Lee Y.-S., Houghton M., Han J. H. J. Virol. 69:1995;32-38.
23. Silverman R. H., Cayley P. J., Knight M., Gilbert C. S., Kerr I. M. Eur. J. Biochem. 124:1982;131-138.
24. Samuel C. E. J. Biol. Chem. 268:1993;7603-7606.
25. Katze M. G. Trends Microbiol. 3:1995;75-78.
26. Katze M. G. Semin. Virol. 4:1993;259-268.
27. Katze M. G., Krug R. M. Enzyme. 44:1990;265-277.
28. Laurence J. AIDS Res. Hum. Retroviruses. 6:1990;1149-1156.
29. Pitha P. Interferon Res. 11:1991;313-318.
30. Pitha P. M. Antiviral Res. 24:1994;205-219.
31. Poli G., Orenstein J. M., Kinter A., Folks T. M., Fauci A. S. Science. 244:1989;575-577.
32. Smith M. S., Thresher R. J., Pagano J. S. Antimicrob. Agents Chemother. 35:1991;62-67.
33. Meylan P. R. A., Guatelli J. C., Munis J. R., Richman D. D., Kornbluth R. S. Virology. 193:1993;138-148.
34. Shirazi Y., Pitha P. M. Virology. 193:1993;303-312.
35. Shirazi Y., Pitha P. M. J. Virol. 66:1995;1321-1328.
36. Coccia E. M., Krust B., Hovanessian A. G. J. Biol. Chem. 269:1994;23087-23094.
37. Baca-Regen L., Heinzinger N., Stevenson M., Gendelman H. E. J. Virol. 68:1995;7559-7565.
38. Agy M. B., Acker R. L., Sherbert C. H., Katze M. G. Virology. 214:1996;379-386.
39. Krug R. M., Caplen F. Alonso, Julkunen I., Katze M. G. The Influenza Viruses. 1989;Plenum, New York/London. p. 89-152.
40. Krug R. M., Etkind P. R. Virology. 56:1973;334-348.
41. Mathews M. B. Hershey J., Mathews M. B., Sonenberg N. Translational Control. 1996;505-548 Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor.
42. Katze M. G. Hershey J. W. B., Mathews M. B., Sonenberg N. Translational Control. 1996;607-630 Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor.
43. Garfinkel M. S., Katze M. G. Sci. Am. Science Med. July/August:1994;64-73.
44. Garfinkel M. S., Katze M. G. Gene. Expr. 3:1993;109-118.
45. Katze M. G., Krug R. M. Mol. Cell Biol. 4:1984;2198-2206.
46. Shapiro G. I., Gurney T. Jr., Krug R. M. J. Virol. 61:1987;764-773.
47. Katze M. G., DeCorato D., Krug R. M. J. Virol. 60:1986;1027-1039.
48. Lee T. G., Tang N., Thompson S., Miller J., Katze M. G. Mol. Cell. Biol. 14:1994;2331-2342.
49. Lee T. G., Tomita J., Hovanessian A. G., Katze M. G. J. Biol. Chem. 267:1992;14238-14243.
50. Lee T. G., Tomita J., Hovanessian A. G., Katze M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87:1990;6208-6212.
51. Tang N., Ho C. Y., Katze M. G. J. Biol. Chem. 271:1996;28660-28666.
52. Berger J., Hauber J., Hauber R., Gelger R., Cullen B. R. Gene. 66:1988;1-10.
53. Garfinkel M. S., Katze M. G. J. Biol. Chem. 267:1992;9383-9390.
54. Garfinkel M. S., Katze M. G. J. Biol. Chem. 268:1993;22223-22226.
55. Park Y.-W., Katze M. G. J. Biol. Chem. 270:1995;28433-28439.
56. Chan E. K. L., Tan E. M. J. Exp. Med. 166:1987;1627-1640.
57. Meerovitch K., Svitkin Y. V., Lee H. S., Lejbkowicz F., Kenan D. J., Chan E. K. L., Agol V. I., Keene J. D., Sonenberg N. J. Virol. 67:1993;3798-3807.
58. Enami K., Sato T. A., Nakada S., Enami M. J. Virol. 68:1994;1432-1437.
59. Yamanaka K., Nagata K., Ishihama A. Arch. Virol. 120:1991;33-42.
60. Lu Y., Qian X.-Y., Krug R. M. Genes Dev. 8:1994;1817-1828.
61. Hershey J. W. B. Annu. Rev. Biochem. 60:1991;717-755.
62. Merrick W. C. Microbiol. Rev. 56:1992;291-315.
63. Rhoads R. E. J. Biol. Chem. 268:1993;3017-3020.
64. Katze M. G. Semin. Virol. 4:1993;259-268.
65. Galabru J., Hovanessian A. G. J. Biol. Chem. 262:1987;15538-15544.
66. Langland J. O., Jacobs B. L. J. Biol. Chem. 267:1992;10729-10736.
67. Thomis D. C., Samuel C. E. J. Virol. 67:1993;7695-7700.
68. Mathews M. B., Shenk T. Enzyme. 44:1990;250-264.
69. Mathews M. B. Semin. Virol. 4:1995;247-257.
70. Katze M. G., DeCorato D., Safer B., Galabru J., Hovanessian A. G. EMBO J. 6:1987;689-697.
71. Imani F., Jacobs B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 85:1988;7887-7891.
72. Chang H.-W., Watson J. C., Jacobs B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89:1992;4825-4829.
73. Carroll K., Elroy-Stein O., Moss R., Jagus R. J. Biol. Chem. 268:1993;12837-12842.
74. Gale M. Jr., Tan S.-L., Wambach M., Katze M. G. Mol. Cell. Biol. 16:1996;4172-4181.
75. Beattie E., Paoletti E., Tartaglia J. Virology. 210:1995;254-263.
76. Beattie E., Tartaglia J., Paoletti E. Virology. 183:1991;419-422.
77. Roy S., Agy M. B., Hovanessian A. G., Sonenberg N., Katze M. G. J. Virol. 65:1991;632-640.
78. Roy S., Katze M. G., Parkin N. T., Edery I., Hovanessian A. G., Sonenberg N. Science. 247:1990;1216-1219.
79. McMillan N. A. J., Chun R. F., Siderovski D. P., Galabru J., Toone W. M., Samuel C. E., Mak T. W., Hovanessian A. G., Jeang K.-T., Williams B. R. G. Virology. 213:1995;413-424.
80. Katze M. G., Tomita J., Black T., Krug R. M., Safer B., Hovanessian A. G. J. Virol. 62:1988;3710-3717.
81. Goebl M., Yanagida M. Trends Biochem. Sci. 16:1991;173-177.
82. Lamb J. R., Tugendreich S., Hieter P. Trends Biochem. Sci. 20:1995;257-259.
83. Silver P. A., Way J. C. Cell. 74:1993;5-6.
84. Korth M. J., Lyons C. N., Wambach M., Katze M. G. Gene. 170:1996;181-188.
85. Lee T.-G., Katze M. G. Prog. Mol. Subcell. Biol. 14:1994;48-65.
86. Polyak S. J., Tang N., Wambach M., Barber G. N., Katze M. G. J. Biol. Chem. 271:1996;1702-1707.
87. Williams B. R. Semin. Virol. 6:1995;191-202.
88. Lee S. B., Esteban M. Virology. 199:1994;491-496.
89. Barber G. N., Wambach M., Thompson S., Jagus R., Katze M. G. Mol. Cell. Biol. 15:1995;3138-3146.
90. Meurs E. F., Galabru J., Barber G. N., Katze M. G., Hovanessian A. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90:1993;232-236.
91. Koromilas A. E., Roy S., Barber G. N., Katze M. G., Sonenberg N. Science. 257:1992;1685-1689.
92. Barber G. N., Thompson S., Lee T. G., Strom T. J. R., Darveau A., Katze M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91:1994;4278-4282.
93. Morimoto R. I., Tissieres A., Georgopoulos C. Morimoto R. I., Tissieres A., Georgopoulos C. The Biology of Heat Shock Proteins and Molecular Chaperones. 1994;1-30 Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor.
94. Melville M. W., Hansen W. J., Welch W. J., Katze M. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;97-102.
95. M. Gale, M. Katze, 1996.
96. Barre-Sinoussi F., Chermann J. C., Rey F., Nugeyre M. T., Chamaret S., Gruest J., Dauguet C., Axler-Blin C., Vezinet-Brun F., Rouzioux C., Rozenbaum W., Montagnier L. Science. 220:1983;868-871.
97. Wain-Hobson S., Vartanian J. P., Henry M., Chenciner N., Cheynier R., Delassus S., Martins L. P., Sala M., Nugeure M. T., Gu'etard D. Science. 252:1991;961-965.
98. Salahuddin S. Z., Markham P. D., Wong-Staal F., Franchini G., Kalyanaraman V. S., Gallo R. C. Virology. 129:1983;51-64.
99. Harada S., Koyanagi Y., Yamamoto N. Science. 229:1985;563-566.
100. Salter R. D., Howell D. N., Cresswell P. Immunogenetics. 21:1985;235-246.
101. Foley G. E., Lazarus H., Farber S., Uzman B. G., Boone B. A., McCarthy R. E. Cancer. 18:1965;522-529.
102. Weiss A., Wiskocil R. L., Stobo J. D. J. Immunol. 133:1984;123-128.
103. Gazdar A. F., Carney D. N., Bunn P. A., Russell E. K., Jaffe E. S., Schechter G. P., Guccion J. R. Blood. 55:1980;409-417.
104. Chomczynski P., Sacchi N. Anal. Biochem. 162:1987;156-159.
105. Sambrook J., Fitsch E. F., Maniatis T. J. Biol. Chem. 268:1989;7603-7606.
106. Feinberg A. P., Voglestein B. Anal. Biochem. 132:1983;6-13.
107. Brown G. D., Peluso R. W., Moyer S. A., Moyer R. W. J. Biol. Chem. 258:1983;14309-14314.
108. Krikorian C. R., Read G. S. J. Virol. 65:1994;112-122.
109. Etkind P. R., Krug R. M. J. Virol. 16:1975;1464-1475.
110. Towbin H., Staehlin T., Gordon J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 76:1979;4350-4354.
111. Katze M. G., Krug R. M. Mol. Cell. Biol. 4:1984;2198-2206.
112. Cullen B. R. Methods Enzymol. 152:1987;684-704.
113. Meerovitch K., Pelletier J., Sonenberg N. Genes Dev. 13:1989;1026-1034.
114. Laurent A. G., Krust B., Galabru J., Svab J., Hovanessian A. G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82:1985;4341-4345.
115. Barber G. N., Tomita J., Garfinkel M. S., Hovanessian A. G., Meurs E., Katze M. G. Virology. 191:1992;670-679.
116. Barber G. N., Tomita J., Hovanessian A. G., Meurs E., Katze M. G. Biochemistry. 30:1991;10356-10361.
117. Konieczny A., Safer B. J. Biol. Chem. 256:1983;3402-3408.
118. Lee T.-G., Tang N., Thompson S., Miller J., Katze M. G. Mol. Cell. Biol. 14:1994;2331-2342.
119. Studier F. W., Rosenberg A. H., Dunn J. J., Debendorff J. W. Methods Enzymol. 185:1990;60-89.
120. Smith D. B., Johnson K. S. Gene. 67:1988;31-40.
121. Katze M. G., Wambach M., Wong M.-L., Garfinkel M. S., Meurs E., Chong K. L., Williams B. R. G., Hovanessian A. G., Barber G. N. Mol. Cell Biol. 11:1991;5497-5505.
122. Bartel P. L., Fields S. Methods Enzymol. 254:1995;241-263.
123. Estojak J., Brent R., Golemis E. A. Mol. Cell. Biol. 15:1995;5820-5829.
124. Bartel P. L., Chien C.-T., Sternglanz R., Fields S. Hartley D. A. Cellular Interactions in Development: A Practical Approach. 1993;153-179 Oxford Univ. Press, Oxford.
125. Kishore G. M., Shaw D. M. Annu. Rev. Biochem. 57:1988;627-663.
126. Geballe A. P., Mocarski E. S. J. Virol. 62:1988;3334-3340.