A near-infrared transient absorption study of the excited-state dynamics of the carotenoid spirilloxanthin in solution and in the LH1 complex of Rhodospirillum rubrum

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 40, 2003, Pages 11216-11223

  Papagiannakis, Emmanouil ^a   Van Stokkum, Ivo H M ^a   Van Grondelle, Rienk ^a   Niederman, Robert A ^b   Zigmantas, Donatas ^c   Sundström, Villy ^c   Polívka, Tomáš ^c  

^a VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

^b RUTGERS UNIVERSITY   (United States)

^c LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSORPTION SPECTROSCOPY; BACTERIA; ELECTRON TRANSITIONS; ENERGY TRANSFER; GROUND STATE; MOLECULAR DYNAMICS; PARAFFINS; PIGMENTS; SOLUTIONS;

BACTERIOCHLOROPHYLL; CAROTENOID SPIRILLOXANTHIN; EXCITED STATE; HEXANE; NEAR INFRARED TRANSIENT ABSORPTION SPECTROSCOPY; RHODOSPIRILLUM RUBRUM;

BIOCHEMISTRY;

EID: 0242323638     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp034931j     Document Type: Article

References (46)

1. Frank, H. A.; Cogdell, R. J. Photochem. Photobiol. 1996, 63, 257.
2. Ritz, T.; Damjanovic, A.; Schulten, K.; Zhang, J. P.; Koyama, Y. Photosynth. Res. 2000, 66, 125.
3. Tavan, P.; Schulten, K. J. Chem. Phys. 1986, 85, 6602.
4. Fujii, R.; Inaba, T.; Watanabe, Y.; Koyama, Y.; Zhang, J. P. Chem. Phys. Lett. 2003, 369, 165.
5. Cerullo, G.; Polli, D.; Lanzani, G.; De Silvestri, S.; Hashimoto, H.; Cogdell, R. J. Science 2002, 298, 2395.
6. Gradinaru, C. C.; Kennis, J. T. M.; Papagiannakis, E.; van Stokkum, I. H. M.; Cogdell, R. J.; Fleming, G. R.; Niederman, R. A.; van Grondelle, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 2364.
7. Papagiannakis, E.; Kennis, J. T. M.; van Stokkum, I. H. M.; Cogdell, R. J.; van Grondelle, R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 6017.
8. Papagiannakis, E.; Das, S. K.; Gall, A.; van Stokkum, I. H. M.; Robert, B.; van Grondelle, R.; Frank, H. A.; Kennis, J. T. M. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 5642.
9. Frank, H. A.; Desamero, R. Z. B.; Chynwat, V.; Gebhard, R.; vanderHoef, I.; Jansen, F. J.; Lugtenburg, J.; Gosztola, D.; Wasielewski, M. R. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 149.
10. Chynwat, V.; Frank, H. A. Chem. Phys. 1995, 194, 237.
11. Zhang, J. P.; Fujii, R.; Qian, P.; Inaba, T.; Mizoguchi, T.; Koyama, Y.; Onaka, K.; Watanabe, Y.; Nagae, H. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 3683.
12. Picorel, R.; Bélanger, G.; Gingras, G. Biochemistry 1983, 22, 2491.
13. Karrasch, S.; Bullough, P. A.; Ghosh, R. EMBO J. 1995, 14, 631.
14. Duysens, L. N. M. Ph.D. Thesis, University of Utrecht, Utrecht, The Netherlands, 1952.
15. Papagiannakis, E. Manuscript in preparation, 2003.
16. Polivka, T.; Herek, J. L.; Zigmantas, D.; Akerlund, H. E.; Sundstrom, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 4914.
17. Polivka, T.; Zigmantas, D.; Frank, H. A.; Bautista, J. A.; Herek, J. L.; Koyama, Y.; Fujii, R.; Sundstrom, V. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 1072.
18. Polivka, T.; Zigmantas, D.; Herek, J. L.; He, Z.; Pascher, T.; Pullerits, T.; Cogdell, R. J.; Frank, H. A.; Sundstrom, V. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 11016.
19. Polivka, T.; Zigmantas, D.; Sundstrom, V.; Formaggio, E.; Cinque, G.; Bassi, R. Biochemistry 2002, 41, 439.
20. Zigmantas, D.; Hiller, R. G.; Sundstrom, V.; Polivka, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 16760.
21. van Niel, C. B.; Goodwin, T. W.; Sissins, M. E. Biochem. J. 1956, 63, 408.
22. Komori, M.; Ghosh, R.; Takaichi, S.; Hu, Y.; Mizoguchi, T.; Koyama, Y.; Kuki, M. Biochemistry 1998, 37, 8987.
23. van Stokkum, I. H. M.; Scherer, T.; Brouwer, A. M.; Verhoeven, J. W. J. Phys. Chem. 1994, 98, 852.
24. Holzwarth, A. R. In Biophysical Techniques in Photosynthesis; Amesz, J., Hoff, A. J., Eds.; Kluwer: Dordrecht, The Netherlands, 1996; p 75.
25. Britton, G. In Carotenoids; Britton, G., Liaaen-Jensen, S., Pfander, H., Eds.; Birkhäuser: Basel, Switzerland, 1995; Vol. 1B (Spectroscopy), p 13.
26. Polgar, A.; van Niel, C. B.; Zechmeister, L. Arch. Biochem. 1944, 5, 243.
27. Lindal, T.-R.; Liaaen-Jensen, S. Acta Chem. Scand. 1997, 51, 1128.
28. Koyama, Y.; Takatsuka, I.; Kanaji, M.; Tomimoto, K.; Kito, M.; Shimamura, T.; Yamashita, J.; Saiki, K.; Tsukida, K. Photochem. Photobiol. 1990, 51, 119.
29. Zhang, J. P.; Skibsted, L. H.; Fujii, R.; Koyama, Y. Photochem. Photobiol. 2001, 73, 219.
30. de Weerd, F. L.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R. Chem. Phys. Lett. 2002, 354, 38.
31. Billsten, H. H.; Zigmantas, D.; Sundstrom, V.; Polivka, T. Chem. Phys. Lett. 2002, 355, 465.
32. Gradinaru, C. C. Ph.D. Thesis, Vrije Universiteit, Amsterdam, The Netherlands, 2001.
33. Monshouwer, R.; Abrahamsson, M.; van Mourik, F.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7241.
34. van Grondelle, R. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 147.
35. Kennis, J. T. M. Unpublished results.
36. Fujii, R.; Ishikawa, T.; Koyama, Y.; Taguchi, M.; Isobe, Y.; Nagae, H.; Watanabe, Y. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 5348.
37. Furuichi, K.; Sashima, T.; Koyama, Y. Chem. Phys. Lett. 2002, 356, 547.
38. Sashima, T.; Shiba, M.; Hashimoto, H.; Nagae, H.; Koyama, Y. Chem. Phys. Lett. 1998, 290, 36.
39. Krueger, B. P.; Yom, J.; Walla, P. J.; Fleming, G. R. Chem. Phys. Lett. 1999, 310, 57.
40. Walla, P. J.; Linden, P. A.; Ohta, K.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1909.
41. Fujii, R.; Onaka, K.; Kuki, M.; Koyama, Y.; Watanabe, Y. Chem. Phys. Lett. 1998, 288, 847.
42. Bautista, J. A.; Chynwat, V.; Cua, A.; Jansen, F. J.; Lugtenburg, J.; Gosztola, D.; Wasielewski, M. R.; Frank, H. A. Photosynth. Res. 1998, 55, 49.
43. Yoshizawa, M.; Aoki, H.; Hashimoto, H. Phys. Rev. B 2001, 6318.
44. Frank, H. A.; Bautista, J. A.; Josue, J. S.; Young, A. J. Biochemistry 2000, 39, 2831.
45. Hsu, C. P.; Walla, P. J.; Head-Gordon, M.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11016.
46. Bachilo, S. M. J. Photochem. Photobiol., A 1995, 91, 111.