Off-resonance TROSY (R1ρ - R1) for quantitation of fast exchange processes in large proteins

Journal of the American Chemical Society

Volumn 125, Issue 40, 2003, Pages 12064-12065

  Kempf, James G ^a   Jung, Ju Yeon ^b   Sampson, Nicole S ^b   Loria, J Patrick ^a  

^a YALE UNIVERSITY   (United States)

^b STONY BROOK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; MATHEMATICAL ANALYSIS; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PHYSICAL CHEMISTRY; PROTEIN PROCESSING; QUANTITATIVE ANALYSIS; TRANSVERSE RELAXATION OPTIMIZED COHERENCE;

KINETICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE, BIOMOLECULAR; PROTEIN CONFORMATION; PROTEINS;

EID: 0141889001     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja037101s     Document Type: Article

References (23)

1. Palmer, A. G.; Kroenke, C. D.; Loria, J. P. Methods Enzymol. 2001, 339 Part B, 204-238.
2. Kempf, J. G.; Loria, J. P. Cell Biochem. Biophys. 2003, 37, 187-212.
3. Szyperski, T.; Luginbühl, P.; Otting, G.; Güntert, P.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1993, 3, 151-164; Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332; Ishima, R.; Wingfield, P. T.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10534-10542; Mulder, F. A.; Mittermaier, A.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 932-935.
4. Szyperski, T.; Luginbühl, P.; Otting, G.; Güntert, P.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1993, 3, 151-164; Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332; Ishima, R.; Wingfield, P. T.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10534-10542; Mulder, F. A.; Mittermaier, A.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 932-935.
5. Szyperski, T.; Luginbühl, P.; Otting, G.; Güntert, P.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1993, 3, 151-164; Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332; Ishima, R.; Wingfield, P. T.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10534-10542; Mulder, F. A.; Mittermaier, A.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 932-935.
6. Szyperski, T.; Luginbühl, P.; Otting, G.; Güntert, P.; Wüthrich, K. J. Biomol. NMR 1993, 3, 151-164; Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2331-2332; Ishima, R.; Wingfield, P. T.; Stahl, S. J.; Kaufman, J. D.; Torchia, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10534-10542; Mulder, F. A.; Mittermaier, A.; Hon, B.; Dahlquist, F. W.; Kay, L. E. Nat. Struct. Biol. 2001, 8, 932-935.
7. Akke, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 911-912.
8. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Biomol. NMR 1999, 15, 151-155; Zhu, G.; Xia, Y.; Nicholson, L. K.; Sze, K. H. J. Magn. Reson. 2000, 143, 423-426; Caffrey, M.; Kaufman, J.; Stahl, S.; Wingfield, P.; Gronenborn, A.; Clore, G. J. Magn. Reson. 1998, 135, 368-372; Wang, C.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8968-8969.
9. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Biomol. NMR 1999, 15, 151-155; Zhu, G.; Xia, Y.; Nicholson, L. K.; Sze, K. H. J. Magn. Reson. 2000, 143, 423-426; Caffrey, M.; Kaufman, J.; Stahl, S.; Wingfield, P.; Gronenborn, A.; Clore, G. J. Magn. Reson. 1998, 135, 368-372; Wang, C.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8968-8969.
10. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Biomol. NMR 1999, 15, 151-155; Zhu, G.; Xia, Y.; Nicholson, L. K.; Sze, K. H. J. Magn. Reson. 2000, 143, 423-426; Caffrey, M.; Kaufman, J.; Stahl, S.; Wingfield, P.; Gronenborn, A.; Clore, G. J. Magn. Reson. 1998, 135, 368-372; Wang, C.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8968-8969.
11. Loria, J. P.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Biomol. NMR 1999, 15, 151-155; Zhu, G.; Xia, Y.; Nicholson, L. K.; Sze, K. H. J. Magn. Reson. 2000, 143, 423-426; Caffrey, M.; Kaufman, J.; Stahl, S.; Wingfield, P.; Gronenborn, A.; Clore, G. J. Magn. Reson. 1998, 135, 368-372; Wang, C.; Rance, M.; Palmer, A. G. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 8968-8969.
12. Akke, M.; Liu, J.; Cavanagh, J.; Erickson, H. P.; Palmer, A. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 55-59; Vugmeyster, L.; Kroenke, C. D.; Picart, F.; Palmer, A. G.; Raleigh, D. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5387-5388; Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523.
13. Akke, M.; Liu, J.; Cavanagh, J.; Erickson, H. P.; Palmer, A. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 55-59; Vugmeyster, L.; Kroenke, C. D.; Picart, F.; Palmer, A. G.; Raleigh, D. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5387-5388; Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523.
14. Akke, M.; Liu, J.; Cavanagh, J.; Erickson, H. P.; Palmer, A. G. Nat. Struct. Biol. 1998, 5, 55-59; Vugmeyster, L.; Kroenke, C. D.; Picart, F.; Palmer, A. G.; Raleigh, D. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 5387-5388; Eisenmesser, E. Z.; Bosco, D. A.; Akke, M.; Kern, D. Science 2002, 295, 1520-1523.
15. Pervushin, K.; Riek, R.; Wider, G.; Wuthrich, K. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 12366-12371.
16. Desvaux, H.; Berthault, P.; Birlirakis, N.; Goldman, M.; Piotto, M. J. Magn. Reson., Ser. A 1995, 113, 47-52; Mulder, F. A. A.; de Graaf, R. A.; Kaptein, R.; Boelens, R. J. Magn. Reson. 1998, 131, 351-357.
17. Desvaux, H.; Berthault, P.; Birlirakis, N.; Goldman, M.; Piotto, M. J. Magn. Reson., Ser. A 1995, 113, 47-52; Mulder, F. A. A.; de Graaf, R. A.; Kaptein, R.; Boelens, R. J. Magn. Reson. 1998, 131, 351-357.
18. Korzhnev, D. M.; Skymnikov, N. R.; Millet, O.; Torchia, D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10743-10753.
19. Davis, D. G.; Perlman, M. E.; London, R. E. J. Magn. Reson., Ser B 1994, 104, 266-275.
20. Cavanagh, J.; Rance, M. J. Magn. Reson. 1990, 88, 72-85.
21. Palmer, A. G.; Skelton, N. J.; Chazin, W. J.; Wright, P. E.; Rance, M. Mol. Phys. 1992, 75, 699-711.
22. Sklenar, V.; Piotto, M.; Leppik, R.; Saudek, V. J. Magn. Reson., Ser. A 1993, 102, 241-245.
23. Rance, M.; Loria, J. P.; Palmer, A. G. J. Magn. Reson. 1999, 136, 92-101.