A Combined Car-Parrinello Quantum Mechanical-Molecular Mechanical Implementation for Ab Initio Molecular Dynamics Simulations of Extended Systems

ACS Symposium Series

Volumn 712, Issue , 1998, Pages 128-147

  Woo, Tom K ^a   Margl, Peter M ^a   Deng, Liqun ^a   Ziegler, Tom ^a  

^a UNIVERSITY OF CALGARY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0041853291     PISSN: 00976156     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1021/bk-1998-0712.ch008     Document Type: Article

References (54)

1. Tuckerman, M. E.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1994, 101, 1316.
2. Galli, G.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1992, 69, 3547.
3. Mauri, F.; Galli, G.; Car, R. Phys. Rev. B 1993, 47, 9973.
4. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
5. Aqvist, J.; Warshel, A. Chem. Rev. 1993, 93, 2523.
6. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comp. Chem. 1986, 7, 718.
7. Field, M. J.; Bash, P. A.; Karplus, M. J. Comp. Chem. 1990, 11, 700.
8. Bash, P. A.; Field, M. J.; Davenport, R.; Ringe, D.; Petsko, G.; Karplus, M. Biochemistry 1991, 30, 5826.
9. Tuñón, I.; Martins-Costa, M. T. C.; Millot, C.; Ruis-Lópes, M. F. J. Chem. Phys 1997, 106, 3633.
10. Deng, L.; Woo, T. K.; Cavallo, L.; Margl, P. M.; Ziegler, T. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 6177.
11. Maseras, F.; Morokuma, K. J. Comp. Chem. 1995, 16, 1170.
12. Gao, J. In Reviews in Computational Chemistry; K. B. Lipkowitz and D. B. Boyd, Ed.; VCH: New York, 1996; Vol. 7.
13. Remler, D. K.; Madden, P. A. Molecular Physics 1990, 70, 921.
14. Meier, R. J.; Dormaele, G. H. J. v.; Larlori, S.; Buda, F. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7274.
15. Margl, P.; Schwarz, K.; Blöchl, P. E. J. Chem. Phys. 1995, 103, 683.
16. Margl, P.; Schwarz, K.; Blöchl, P. E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11177.
17. Woo, T. K.; Margl, P. M.; Lohrenz, J. C. W.; Blöchl, P. E.; Ziegler, T. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 13021.
18. Margl, P.; Lohrenz, J. C. W.; Blöchl, P.; Ziegler, T. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 4434.
19. Margl, P.; Blöchl, P.; Ziegler, T. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 12625.
20. Curioni, A.; Sprik, M.; Andreoni, W.; Schiffer, H.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7218.
21. Milman, V.; Payne, M. C.; Heine, V.; Needs, R. J.; Lin, J. S.; Lee, M. H. Phys. Rev. Lett. 1993, 70, 2928.
22. Woo, T. K.; Margl, P. M.; Blöchl, P. E.; Ziegler, T. Organometallics 1997, 16, 3454.
23. Hartke, B.; Carter, E. A. J. Chem. Phys. 1992, 97, 6569.
24. Hartke, B.; Carter, E. A. Chem. Phys. Lett. 1992, 189, 358.
25. Blöchl, P. E. Phys. Rev. B 1994, 50, 17953.
26. Blöchl, P. E.; Margl, P. M.; Schwarz, K., ACS Symposium Series 629: Chemical Applications of Density-Functional Theory; B. B. Laird; R. B. Ross and T. Ziegler Ed.; American Chemical Society: Washington, DC, 1996, pp 54.
27. Blöchl, P. E. J. Chem. Phys. 1995, 103, 7422.
28. Beveridge, D. L.; DiCapua, F. M. Annu. Rev. Biophys. Chem. 1989, 18, 431.
29. Paci, E.; Ciccotti, G.; Ferrario, M.; Kapral, R. Chem. Phys. Lett. 1991, 176, 581.
30. Carter, E. A.; Ciccotti, G.; Hynes, J. T.; Kapral, R. Chem. Phys. Lett. 1989, 156, 472.
31. Fukui, K. J. Phys. Chem. 1970, 74, 4161.
32. Fukui, K. Acc. Chem. Res. 1981, 14, 363.
33. Straatsma, T. P.; Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M. J. Chem. Phys. 1986, 85, 6720.
34. De-Raedt, B.; Sprik, M.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1984, 80, 5719.
35. Nosé, S. Mol. Phys. 1984, 52, 255.
36. Blöchl, P. E.; Parrinello, M. Phys. Rev. B 1992, 45, 9413.
37. Ryckaert, J.-P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comp. Phys. 1977, 23, 327.
38. Woo, T. K.; Cavallo, L.; Ziegler, T. unpublished work
39. Baerends, E. J.; Ros, P. Chem. Phys. 1973, 2, 52.
40. Baerends, E. J. PhD Thesis, Free University, Amsterdam, The Netherlands, 1975.
41. Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Jr., K. M. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179.
42. Rappé, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; III, W. A. G.; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.
43. Tuckerman, M. E.; Berne, B. J.; Martyna, G. J. J. Chem. Phys. 1992, 97, 1990.
44. Gibson, D. A.; Carter, E. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13429.
45. Becke, A. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
46. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 34, 7406.
47. Perdew, J. P.; Zunger, A. PRB 1981, 23, 5048.
48. Johnson, L. K.; Killian, C. M.; Brookhart, M. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6414.
49. Johnson, L. K.; Mecking, S.; Brookhart, M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 267.
50. Haggin, J. in Chemical and Engineering News, February 5 1996; pp. 6.
51. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
52. Woo, T. K.; Margl, P. M.; Blöchl, P. E.; Ziegler, T. J. Phys. Chem. 1997, 101, 7877.
53. Brookhart, M., Department of Chemistry, University of North Carolina at Chapel Hill. A private communication.
54. Woo, T. K.; Margl, P. M.; Deng, L.; Ziegler, T. in preparation.