Cisplatin-DNA adducts by vibrational circular dichroism spectroscopy: Structure and isomerization of d(CCTG*G*TCC)·d(GGACCAGG) intrastrand cross-linked by cisplatin

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 26, 2003, Pages 6479-6485

  Tsankov, Dimiter ^a,b   Kalisch, Berndt ^a   Van de Sande, Hans ^a   Wieser, Hal ^a  

^a UNIVERSITY OF CALGARY   (Canada)

^b BULGARIAN ACADEMY OF SCIENCES   (Bulgaria)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPLEXATION; CROSSLINKING; INFRARED SPECTROSCOPY; ISOMERIZATION; MOLECULAR STRUCTURE; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; SYNTHESIS (CHEMICAL);

CISPLATIN;

DNA;

EID: 0037765168     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp034246c     Document Type: Article

References (47)

1. Cohen, S.; Lippard, S. J. Prog. Nucleic Acid Res. Mol. Biol. 2001, 67, 93-130.
2. Jamieson, E.; Lippard, S. J. Chem. Rev. 1999, 99, 2467-2498.
3. Gelasco, A.; Lippard, S. J. In Metallopharmaceuticals I: DNA Interactions, Topics in Biological Inorganic Chemistry; Clarke, M. J., Sadler, P., Eds.; Springer-Verlag: Heidalberg, Germany, 1999; pp 1-43.
4. Reedijk, J. Pure Appl. Chem. 1987. 59, 181-192.
5. Reedijk, J. Chem. Commun. 1996, 801-806.
6. Fichtinger-Schepman, A. M. J.; van der Veer, J. L.; den Hartog, J. H. J.; Lohman, P. H. M.; Reedijk, J. Biochemistry 1985, 24, 707-713.
7. Reeder, F.; Guo, Z.; Murdoch, P. D.; Corazza, A.; Hambley, T. W.; Berners-Price, S. J.; Chottard, J. C.; Sadler, P. J. Eur. J. Biochem. 1997, 249, 370-382.
8. Sullivan, S. T.; Ciccarese, A.; Fanizzi, F. P.; Marzilli, L. G. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9345-9355.
9. Reed, E.; Ozols, R. A.; Tarone, R.; Yuspa, S. H.; Poirier, M. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1987, 84, 5024-5028.
10. Teuben, J. M.; Bauer, C.; Wang, A. H.-J; Reedijk, J. Biochemistry 1999, 38, 12305-12312.
11. Blommaert, F. A.; van Dijk-Knijnenburg, H. C. M.; Dijt, F. J.; den Engelse, L.; Baan, R. A.; Berends, F.; Fichtinger-Schepman, A. M. J. Biochemistry 1995, 34, 8474-8480.
12. Fichtinger-Schepman, A. M. J.; van Dijk-Knijnenburg, H. C. M.; van der Velde-Visser, S. D.; Berends, F.; Baan, R. Carcinogenesis 1995, 16 (6), 2447-2453.
13. Yang, D.; van Boom, S. S. G. E.; Reedijk, J.; van Boom, J. H.; Wang, A. H.-J. Biochemistry 1995, 34, 12912-12921.
14. Gelasco, A.; Lippard, S. J. Biochemistry 1998, 37, 9230-9239.
15. Chaconas, G.; van de Sande, J. H. Methods Enzymol., 1980, 65, 75-85.
16. den Hartog, J. H. J.; Altona, C.; van der Elst, H.; van der Marel, G. A.; Reedijk, J. Inorg. Chem. 1985, 24, 983-986.
17. Takahara, P. M.; Rosenzweig, A. C.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J. Nature 1995, 377, 649-652.
18. Takahara, P. M.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 12309-12321.
19. Tinoco, I., Jr. Radiat. Res. 1963, 20, 133-139.
20. Deutsche, C. W.; Moscowitz, A. J. Chem. Phys. 1968, 49, 3257-3272.
21. Snir, J.; Frankel, R. A.; Schellman, J. A. Biopolymers 1975, 14, 173-196.
22. Gulotta, M.; Goss, D. J.; Diem, M. Biopolymers 1989, 28, 2047-2058.
23. Keiderling, T. A. In Circular Dichroism and Conformational Analysis of Biomolecules; Fasman, G. D., Ed.; Plenum: New York, 1996; pp 555-598.
24. Diem, M. Spectroscopy 1995, 10, 38-43.
25. Maharaj, V.; Tsankov, D.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. J. Mol. Struct. 1995, 349, 25-28.
26. Maharaj, V.; Rauk, A.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. J. Mol. Struct. 1997, 408/409, 315-318.
27. Maharaj, V. Ph.D. Thesis. The University of Calgary, Calgary. AB, Canada, 1996.
28. Andrushchenko, V.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. Vibr. Spectrosc. 1999, 19, 341-345.
29. Andrushchenko, V.; van de Sande, J. H.; Wieser, H.; Kornilova, S.; Blagoi, Yu. J. Biomol. Struct. Dyn. 1999, 17, 545-560.
30. Andrushchenko, V. Ph.D. Thesis, The University of Calgary, Calgary, AB, Canada, 2000.
31. Andrushchenko, V.; Leonenko, Z.; Cramb, D.; van de Sande, H.; Wieser, H. Biopolymers 2002, 61, 243-260.
32. Tsankov, D.; Kalisch, B.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. Biospectroscopy, in press.
33. Andrushchenko, V.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. Biopolymers, in press, 2003.
34. Tsankov, D.; Eggimann, T.; Wieser, H. Appl. Spectrosc. 1995, 49, 132-138.
35. Krasteva, M. Ph.D. Thesis, The University of Calgary, Calgary, AB, Canada, 2002.
36. Andrushchenko, V.; Wieser, H.; Bour, P. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 12623-12634.
37. Andrushchenko, V.; Blagoi, Yu.; van de Sande, J. H.; Wieser, H. J. Biomol. Struct. Dyn. 2002, 19, 889-906.
38. Wang, L.; Keiderling, T. A. Biochemistry 1992, 31, 10265-10271.
39. Tsuboi, M. Appl. Spectrosc. Rev. 1969, 3, 45-90.
40. Letellier, R.; Ghomi, M.; Taillandier, E. J. Biomol. Struct. Dyn. 1989, 4, 755-768.
41. Dohy, D.; Ghomi, M.; Taillandier, E. J. Biomol. Struct. Dyn. 1989, 6, 741-754.
42. Wang, L.; Pancoska, P.; Keiderling, T. Biochemistry 1994, 33, 8428-8435.
43. den Hartog, J. H. J.; Altona, C.; van Boom, J. H.; van der Marel, J. H.; Haasnoot, C. A. G.; Reedijk, J. J. Biomol. Struct. Dyn. 1985, 2, 1137-1154.
44. Herman, F.; Kozelka, J.; Stoven, V.; Guittet, E.; Girault, J.-P.; Huynh-Dinh, T.; Igolen, J.; Lallemand, J.-Y.; Chottard, J.-C. Eur. J. Biochem. 1990, 194, 119-133.
45. Rice, J. A.; Crothers, D. M.; Pinto, A. L.; Lippard, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 4158-4161.
46. Bellon, S. F.; Lippard, S. J. Biophys. Chem. 1990, 35, 179-188.
47. Wang, L.; Keiderling, T. A. Biophys, J. 1994, 67, 2460-2467.