Crystal structure of the anticancer drug cisplatin bound to duplex DNA

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 49, 1996, Pages 12309-12321

  Takahara, Patricia M ^a   Frederick, Christin A ^b   Lippard, Stephen J ^a  

^a MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^b DANA FARBER CANCER INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CISPLATIN;

ARTICLE; DNA BINDING; IN VITRO STUDY; X RAY CRYSTALLOGRAPHY;

EID: 0030471480     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9625079     Document Type: Article

References (63)

1. Comess, K. M.; Lippard, S. J. In Molecular Aspects of Anticancer Drug-DNA Interactions; Neidle, S., Waring, M., Eds.; MacMillan: London, 1993; p 134.
2. Lippard, S. J. Science 1982, 218, 1075.
3. Sherman, S. E.; Gibson, D.; Wang, A. H.-J.; Lippard, S. J. Science 1985, 230, 412.
4. Fichtinger-Schepman, A. M. J.; van der Veer, J. L.; den Hartog; J. H. J.; Lohman, P. H. M.; Reedijk, J. Biochemistry 1985, 24, 707.
5. Eastman, A. Biochemistry 1986, 25, 3912.
6. Reed, E.; Ozols, R. F.; Tarone, R.; Yuspa, S. H.; Poirer, M. C. Carcinogenesis 1988, 9, 1909.
7. Pil, P. M.; Lippard, S. J. Science 1992, 256, 234.
8. Whitehead, J. P.; Lippard, S. J. In Metal Ions in Biological Systems; Sigel, Hi, Sigel, A., Eds.; Marcel Dekker: New York, 1995; p 687.
9. Huang, J.-C.; Zamble, D. B.; Reardon, J. T.; Lippard, S. J.; Sancar, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 10394.
10. Zamble, D. B.; Mu, D.; Reardon, J. T.; Sancar, A.; Lippard, S. J. Biochemistry 1996, 35, 10004.
11. Sherman, S. E.; Lippard, S. J. Chem. Rev. 1987, 87, 1153.
12. Wing, R. M.; Pjura, P.; Drew, H. R.; Dickerson, R. E. EMBO J. 1984, 3, 1201.
13. Admiraal, G.; van der Veer, J. L.; de Graaff, R. A. G.; den Hartog, J. H. J.; Reedijk, J. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 592.
14. Sherman, S. E.; Gibson, D.; Wang, A. H.-J.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 7368.
15. Bellon, S. F., Ph. D. Dissertation, Massachusetts Institute of Technology, 1992.
16. Takahara, P. M.; Rosenzweig, A. C.; Frederick, C. A.; Lippard, S. J. Nature 1995, 377, 649.
17. Bellon, S. F.; Lippard, S. J. Biophys. Chem. 1990, 55, 179.
18. Bellon, S. F.; Coleman, J. H.; Lippard, S. J. Biochemistry 1991, 30, 8026.
19. Rice, J. A.; Crothers, D. M.; Pinto, A. L.; Lippard, S. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 55, 4158.
20. Bailey, S. Acta Crystallogr. 1994, D50, 760.
21. Jones, T. A.; Bergdoll, M.; Kjeldgaard, M. In Crystallographic Computing and Modeling Methods in Molecular Design; Bugg, C., Ealick, S., Eds.; Springer-Verlag: New York, 1989.
22. Brünger, A. T.; Kuriyan, J.; Karplus, M. Science 1987, 235, 458.
23. Brünger, A. T. X-PLOR Version 3.1. A System for X-ray Crystallography and NMR; Yale University Press: New Haven, CT, 1992.
24. Brünger, A. T. Nature 1992, 355, 472.
25. Brünger, A. T. Acta Crystallogr. 1993, D49, 24.
26. Kleywegt, G. J.; Brünger, A. T. Structure 1996, 4, 897.
27. Read, R. J. Acta Crystallogr. 1986, A42, 140.
28. Drenth, J. Principles of Protein X-ray Crystallography; Springer-Verlag: New York, 1994.
29. Kennard, O.; Hunter, W. N. Q. Rev. Biophys. 1989, 22, 327.
30. Wang, A. H.-J.; Teng, M.-K. J. Cryst. Growth 1987, 90, 295.
31. Frederick, C. A.; Quigley, G. J.; Teng, M.-K.; Cqll, M.; van der Marel, G.; van Boom, J.; Rich, A.; Wang, A. H.-J. Eur. J. Biochem. 1989, 181, 295.
32. Wang, A. H.-J.; Fujii, S.; van Boom, J. H.; Rich, A: Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 3968.
33. Desiraju, G. R. Acc. Chem. Res. 1991, 24, 290.
34. Derewenda, Z. S.; Lee, L.; Derewenda, U. J. Mol. Biol. 1995, 252, 248.
35. (a) Leonard, G. A.; McAuley-Hecht, K.; Brown, T.; Hunter, W. N. Acta Crystallogr. 1995, D51, 136.
36. (b) Berger, I.; Egli, M.; Rich, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 12116.
37. Dickerson, R. E. J. Biomol. Struct. Dyn. 1989, 6, 627.
38. Saenger, W. Principles of Nucleic Acid Structure; Springer-Verlag: New York, 1984.
39. Lavery, R.; Sklenar, H. J. Biomol. Struct. Dyn. 1988, 6, 63.
40. Lavery, R.; Sklenar, H. J. Biomol. Struct. Dyn. 1989, 6, 655.
41. Yang, D.; van Boom, S. S. G. E.; Reedijk, J.; van Boom, J. H.; Wang, A. H.-J. Biochemistry 1995, 34, 12912.
42. Kennard, O.; Salisbury, S. A. J. Biol. Chem. 1993, 268, 10701.
43. Seising, E.; Wells, R. D.; Alden, C. J.; Amott, S. J. Biol. Chem. 1979, 254, 5417.
44. Gao, Y.-G.; Robinson, H.; van Boom, J. H.; Wang, A. H.-J. Biophys. J. 1995, 69, 559.
45. Robinson, H.; Wang, A. H.-J. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 676.
46. Duckett, D. R.; Murchie, A. I. H.; Lilley, D. M. J. EMBO J. 1990, 9, 583.
47. Doucet, J.; Benoit, J.-P.; Cruse, W. B. T.; Prange, T.; Kennard, O. Nature 1989, 337, 190.
48. Horton, N. C.; Finzel, B. C. Submitted for publication.
49. Kozelka, J.; Chottard, J.-C. Biophys. Chem. 1990, 35, 165.
50. Dunham, S. U.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10702.
51. Dunham, S. U.; Lippard, S. J. Unpublished results.
52. Esposito, G.; Cauci, S.; Fogolari, F.; Alessio, E.; Scocchi, M.; Quadrifoglio, F.; Viglino, P. Biochemistry 1992, 31, 7094.
53. Guan, Y.; Gao, Y.-G.; Liaw, Y.-C.; Robinson, H.; Wang, A. H.-J. J. Biomol. Struct. Dyn. 1993, 11, 253.
54. Kozelka, J.; Archer, S.; Petsko, G. A.; Lippard, S. J. Biopolymers 1987, 26, 1245.
55. Sandman, K. E.; Lippard, S. J. Unpublished results.
56. Chow, C. S.; Whitehead, J. P.; Lippard, S. J. Biochemistry' 1994, 33, 15124.
57. Werner, M. H.; Huth, J. R.; Gronenbom, A. M.; Clore, G. M. Cell 1995, 81, 705.
58. Love, J. J.; Li, X.; Case, D. A.; Giese, K.; Grosschedl, R.; Wright, P. E. Nature 1995, 376, 791.
59. Wright, P. E. Private communication.
60. Kim, Y.; Geiger, J. H.; Hahn, S.; Sigler, P. B. Nature 1993, 365, 512.
61. Kim, J. L.; Nikolov, D. B.; Burley, S. K. Nature 1993, 365, 520.
62. Jacobo-Molina, A.; Ding, J.; Nanni, R. G.; Clark, A. D.; Lu, X.; Tantillo, C.; Williams, R. L.; Kamer, G.; Ferris, A. L.; Clark, P.; Hizi, A.; Hughes, S. H.; Arnold, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 6320.
63. Note: The coordinates for the crystal structure described in this paper have been deposited with the Protein Data Bank and are available under the PDB access code 1GPG or from the authors lippard@lippard.mit.edu).