Electron tunneling in proteins: Implementation of ZINDO model for tunneling currents calculations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 107, Issue 27, 2003, Pages 6621-6628

  Zheng, Xuehe ^a   Stuchebrukhov, Alexei A ^a  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHARGE TRANSFER; ELECTRON TUNNELING; MOLECULAR STRUCTURE;

TUNNELING CURRENTS;

PROTEINS;

EID: 0037703755     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp022203a     Document Type: Article

References (63)

1. Gray, H. B.; Winkler, J. R. Annu. Rev. Biochem. 1996, 110, 8865.
2. Moser, C. C.; Keske, J. M.; Warncke, K.; Farid, R. S.; Dutton, P. L. Nature 1992, 355, 796.
3. Page, C. C.; Moser, C. C.; Chen, X.; Dutton, P. L. Nature 1999, 402, 47.
4. Eggers, E.; Michel-Beyerle, M. E.; Giese, B. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 12950.
5. Giese, B. Acc. Chem. Res. 2000, 33, 631.
6. Ratner, M. Nature 1999, 397, 480.
7. Mujica, V.; Nitzan, A.; Mao, Y.; Davis, W.; Kemp, M.; Roitberg, A. E.; Ratner, M. Adv. Chem. Phys. 1999, 107, 403.
8. Skourtis, S. S.; Beratan, D. Adv. Chem. Phys. 1999, 706, 377.
9. Regan, J. J.; Onuchic, J. N. Adv. Chem. Phys. 1999, 107, 497.
10. Balabin, I. A.; Onuchic, J. N. Science 2000, 114, 114.
11. Newton, M. D. Chem. Rev. 1991, 91, 767.
12. Newton, M. D. Adv. Chem. Phys. 1999, 106, 303.
13. Newton, M. D. Int. J. Quantum Chem. 2000, 77, 255.
14. Bixon, M.; Jortner, J. Adv. Chem. Phys. 1999, 106, 107.
15. Stuchebrukhov, A. A. Adv. Chem. Phys. 2001, 118, 1.
16. Stuchebrukhov, A. A. Int. J. Quantum Chem. 2000, 77, 16.
17. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8424; 1996, 105, 10819; 1997, 707, 6495; 1998, 108, 8499.
18. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8424; 1996, 105, 10819; 1997, 707, 6495; 1998, 108, 8499.
19. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8424; 1996, 105, 10819; 1997, 707, 6495; 1998, 108, 8499.
20. Stuchebrukhov, A. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 8424; 1996, 105, 10819; 1997, 707, 6495; 1998, 108, 8499.
21. Daizadeh, I.; Medvedev, D. M.; Stuchebrukhov, A. A. Mol. Biol. Evol. 2002, 19, 987.
22. Medvedev, I. D. D. M.; Stuchebrukhov, A. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 6571.
23. Medvedev, D.; Stuchebrukhov, A. A. J. Theor. Bio. 2001, 210, 237.
24. Gehlen, J. N.; Daizadeh, I.; Stuchebrukhov, A. A.; Marcus, R. A. Inorg. Chim. Acta 1996, 243, 271.
25. Kim, J.; Stuchebrukhov, A. A. J. Phys. Chem. 2000, 104, 8606.
26. Wang, J.; Stuchebrukhov, A. A. Int. J. Quantum Chem. 2000, 80, 591.
27. Pople, J. A.; Beveridge, D. L.; Dobosh, P. A. J. Chem. Phys. 1967, 47, 2026.
28. Ridley, J.; Zerner, M. C. Theor. Chim. Acta 1973, 32, 111.
29. Cory, M. G.; Kostlmeier, S.; Kotzian, M.; Rosch, N.; Zerner, M. C. J. Chem. Phys. 1994, 100, 1353.
30. Kurnikov, I. V.; Beratan, D. N. J. Chem. Phys. 1996, 105, 9561.
31. Loew, G. Int. J. Quantum Chem. 2000, 77, 54.
32. Scherer, P. O. J.; Fisher, S. Chem. Phys. 1989, 131, 115.
33. Thompson, M. A.; Fajer, J.; Zerner, M. C. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5693.
34. Cory, M. G.; Zerner, M. C.; Hu, X. H.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1998, 702, 7640.
35. Newton, M. D. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3049.
36. Miller, N. E.; Wander, M. C.; Cave, R. J. J. Phys. Chem. A 1999, 103 (8), 1084.
37. Castner, E. W.; Kennedy, D.; Cave, R. J. J. Phys. Chem. A 2000, 104 (13), 2869.
38. Cave, R. J.; Newton, M. D. J. Chem. Phys. 1997, 106 (22), 9213.
39. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
40. Daizadeh, I.; Medvedev, E. S.; Stuchebrukhov, A. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 3703.
41. Brooks, C. L.; Onuchic, J. N.; Wales, D. J. Science 20001, 293, 612.
42. Miller, W. H.; Schartz, S. D.; Tromp, J. W. J. Chem. Phys. 1983, 79, 4889.
43. Truhlar, D. G.; Garret, B. C. Annu. Rev. Phys. Chem. 1984, 35, 159.
44. Harriman, J. J. Chem. Phys. 1964, 40, 2827.
45. Amos, A. T.; Hall, G. G. Proc. R. Soc. (London) 1961, A263, 483.
46. Amos, A. T.; Hall, G. G. Proc. R. Soc. (London) 1961, A263, 483.
47. King, H.; Stanton, R. E.; Kim, H.; Wyatt, R. E.; Parr, R. G. J. Chem. Phys. 1967, 47, 1936.
48. Voter, A. F.; Goddard, I. W. A. Chem. Phys. 1981, 57, 253.
49. Hardisson, A.; Harriman, J. J. Chem. Phys. 1967, 46, 3639.
50. Cory, M. G.; Zerner, M. C. J. Phys. Chem. 1999, 36, 7287.
51. Zhang, L. Y.; Murphy, R.; Friesner, R. A. Ab Initio Quantum Chemical Calculation of Electron Transfer Matrix Element for Large Molecules; Schrodinger, Inc.: Portland, OR, 1997.
52. Newton, M. D.; Ohta, K.; Zhong, E. J. Phys. Chem. 1991, 95, 2317.
53. Zerner, M. C. Rev. Comput. Chem. 1991, 2, 313.
54. Zheng, X.; Zerner, M. C. Int. J. Quantum Chem. 1993, 527, 431.
55. Zerner, M. C.; Ridely, J. E.; Bacon, A.; McKelvey, J.; Edwards, W.; Head, J. D.; Culberson, C.; Cory, M. G.; Zheng, X.; Parkinson, W.; Yu, Y.; Cameron, A.; Tamm, T.; Pearl, G.; Broo, A.; Albert, K.; et al. ZINDO; Quantum Theory Project, the University of Florida, Gainesville, FL 32611, distributed by Accelrys Inc.: San Diego, CA, 2001.
56. Onuchic, J. N.; Beratan, D. N.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1992, 258, 1740.
57. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94, revision E.2; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1995.
58. Langen, R.; Chang, I.; Germanas, J. P.; Richards, J. H.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Science 1995, 268, 1733.
59. Gittins, D. I.; Bethell, D.; Schiffrin, D. J.; Nichols, R. J. Nature 2000, 408, 67.
60. Yen, A.; Shank, C. V.; McCusker, J. Science 2000, 291, 289.
61. Szabo, A.; Ostlund, N. S. Modern Quantum Chemistry; Macmillan: New York, 1982.
62. Casimiro, D. R.; Richards, J. H.; Winkler, J.; Gray, H. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13073.
63. Zheng, X.; Stuchebrukhov, A. A. J. Phys. Chem. B, accepted for publication.