Characterization of the pentacoordinate sodium cations in hydrated nucleoside 5′-phosphates by solid-state 23Na NMR and quantum mechanical calculations

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 107, Issue 4, 2003, Pages 579-586

  Wong, Alan ^a   Wu, Gang ^a  

^a QUEEN S UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ADENOSINE TRIPHOSPHATE; DEOXYCYTIDINE MONOPHOSPHATE; DEOXYGUANOSINE MONOPHOSPHATE; DEOXYURIDINE MONOPHOSPHATE; HARTREE-FOCK LEVEL; HYDRATED NUCLEOSIDES;

CRYSTALLOGRAPHY; ELECTRIC FIELD EFFECTS; MATHEMATICAL MODELS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PHOSPHORUS COMPOUNDS; POSITIVE IONS; QUANTUM THEORY; SODIUM COMPOUNDS;

AROMATIZATION;

EID: 0037473037     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp021937k     Document Type: Article

References (38)

1. Shui, X. Q.; McFail-Isom, L.; Hu, G. G.; Williams, L. D. Biochemistry 1998, 37, 8341.
2. Tereshko, V.; Minasov, G.; Egli, M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 3590.
3. Hud, N. V.; Feigon, J. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 5756.
4. Hud, N. V.; Sklenár, V.; Feigon, J. J. Mol. Biol. 1999, 286, 651.
5. Young, M. A.; Jayaram, B.; Beveridge, D. L. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 59.
6. Nayal, M.; DiCera, E. J. Mol. Biol. 1996, 256, 228.
7. Tereshko, V.; Wilds, C. J.; Minasov, G.; Prakash, T. P.; Maier, M. A.; Howard, A.; Wawrzak, Z.; Manoharan, M.; Egli, M. Nucl. Acids Res. 2001, 29, 1208.
8. Denisov, V. P.; Halle, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 629.
9. Wu, G. Biochem. Cell Biol. 1998, 76, 429.
10. Wong, A.; Wu, G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 11844.
11. Rovnyak, D.; Baldus, M.; Wu, G.; Hud, N. V.; Feigon, J.; Griffin, R. G. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11423.
12. Ding, S.; McDowell C. A. Chem. Phys. Lett. 2000, 320, 316.
13. Wu, G.; Wong, A. Chem. Commun. 2001, 2658.
14. Wong, A.; Fettinger, J. C.; Forman, S. L.; Davis, J. T.; Wu, G. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 742.
15. (a) Laughlan, G.; Murchie, A. I. H.; Norman, D. G.; Moore, M. H.; Moody, P. C. E.; Lilley, D. M. J.; Luisi, B. Science (Washington, D.C.) 1994, 265, 520.
16. (b) Phillips, K.; Dauter, Z.; Murchie, A. I. H.; Lilley, D. M. J.; Luisi, B. J. Mol. Biol. 1997, 273, 171.
17. Koller, H.; Engelhardt, G.; Kentgens, A. P. M.; Sauer, J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 1544.
18. Wong, A.; Wu, G. Can. J. Anal. Sci. Spectrosc. 2001, 46, 188.
19. Frydman, L.; Hardwood, J. S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5367.
20. Tossell, J. A. Phys. Chem. Minerals 1999, 27, 70.
21. Johnson, C.; Moore, E. A.; Mortimer, M. Chem. Commun. 2000, 791.
22. Tossell, J. A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11060.
23. Pandit, J.; Seshadri, T. P.; Viswamitra, M. A. Acta Crystallogr. 1983, C39, 342.
24. (a) Young, D. W.; Tollin, P.; Wilson, H. R. Nature (London) 1974, 248, 513.
25. (b) Young, D. W.; Tollin, P.; Wilson, H. R. Acta Crystallogr. 1974, B30, 2012.
26. (c) Viswamitra, M. A.; Seshadri, T. P. Nature (London) 1974, 252, 176.
27. Viswamitra, M. A.; Seshadri, T. P.; Post, M. L. Acta Crystallogr. 1980, B36, 2019.
28. Hayashi, S.; Hayamizu, K. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1990, 63, 913.
29. Amoureux, J.-P.; Fernandez, C.; Steuernagel, S. J. Magn. Reson. Ser. A 1996, 123, 116.
30. States, D. J.; Haberkorn, R. A.; Ruben, D. J. J. Magn. Reson. 1982, 48, 286.
31. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Gonzalez, C.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian 98, revision A.6; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA, 1998.
32. (a) Kennard, O.; Isaacs, N. W.; Coppola, J. C.; Kirby, A. J.; Warren, S.; Motherwell, W. D. S.; Watson, D. G.; Wampler, D. L.; Chenery, D. H.; Larson, A. C.; Ann Kerr, K.; Riva di Sanseverino, L. Nature (London) 1970, 225, 333.
33. (b) Kennard, O.; Isaacs, N. W.; Motherwell, W. D. W.; Coppola, J. C.; Wampler, D. L.; Larson, A. C.; Watson, D. G. Proc. R. Soc. London A 1971, 325, 401.
34. Larson, A. C. Acta Crystallogr. 1978, B34, 3601.
35. SHELTXTL Crystal Structure Analysis Package, version 5.1; Bruker AXS, Analytical X-ray System: Siemens: Madison, WI, 1998.
36. Pacios, L. F.; Christiansen, P. A. J. Chem. Phys. 1985, 82, 2664.
37. Meyer, M.; Steinke, T.; Brandi, M.; Sühnel, J. J. Comput. Chem. 2001, 22, 109.
38. Pyykkö, P. Mol. Phys. 2001, 99, 1617.