-
5
-
-
0028455053
-
-
Schlitter, J.; Engels, M.; Kruger, P. J. Mol. Graphics 1994, 12, 84-89.
-
(1994)
J. Mol. Graphics
, vol.12
, pp. 84-89
-
-
Schlitter, J.1
Engels, M.2
Kruger, P.3
-
6
-
-
0029985860
-
-
Amadei, A,; Linssen, A. B. M.; de Groot, B. L.; van Aalten, D. M. F.; Berendsen, H. J. C. J. Biomol. Struct. Dyn. 1996, 13, 615-625.
-
(1996)
J. Biomol. Struct. Dyn.
, vol.13
, pp. 615-625
-
-
Amadei, A.1
Linssen, A.B.M.2
De Groot, B.L.3
Van Aalten, D.M.F.4
Berendsen, H.J.C.5
-
9
-
-
0034864528
-
-
Mitsutake, A.; Sugita, Y.; Okamoto, Y. Biopolymers 2001, 60, 96-123.
-
(2001)
Biopolymers
, vol.60
, pp. 96-123
-
-
Mitsutake, A.1
Sugita, Y.2
Okamoto, Y.3
-
10
-
-
0001455445
-
-
Phillips, S. C.; Essex, J. W.; Edge, C. M. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2586-2597.
-
(2000)
J. Chem. Phys.
, vol.112
, pp. 2586-2597
-
-
Phillips, S.C.1
Essex, J.W.2
Edge, C.M.3
-
11
-
-
0030157592
-
-
Dauber-Osguthorpe, P.; Maunder, C. M.; Osguthorpe, D. J. J. Comput.-Aided Mol. Design 1996, 10, 177-185.
-
(1996)
J. Comput.-Aided Mol. Design
, vol.10
, pp. 177-185
-
-
Dauber-Osguthorpe, P.1
Maunder, C.M.2
Osguthorpe, D.J.3
-
13
-
-
0345698009
-
-
MATLAB 5.3.0; The MathWorks Inc.: Natick, MA
-
MATLAB 5.3.0; The MathWorks Inc.: Natick, MA, 1999.
-
(1999)
-
-
-
15
-
-
5444236478
-
-
Huang, N. E.; Shen, Z.; Long, S. R.; Wu, M. L. C.; Shih, H. H.; Zheng, Q. N.; Yen, N. C.; Tung, C. C.; Liu, H. H. Proc. R. Soc. London Ser. A-Math. Phys. Eng. Sci. 1998, 454, 903-995.
-
(1998)
Proc. R. Soc. London Ser. A-Math. Phys. Eng. Sci.
, vol.454
, pp. 903-995
-
-
Huang, N.E.1
Shen, Z.2
Long, S.R.3
Wu, M.L.C.4
Shih, H.H.5
Zheng, Q.N.6
Yen, N.C.7
Tung, C.C.8
Liu, H.H.9
-
17
-
-
0024802618
-
-
Sessions, R. B.; Dauber-Osguthorpe, P.; Osguthorpe, D. J. J. Mol. Biol. 1989, 210, 617-633.
-
(1989)
J. Mol. Biol.
, vol.210
, pp. 617-633
-
-
Sessions, R.B.1
Dauber-Osguthorpe, P.2
Osguthorpe, D.J.3
-
19
-
-
0013237284
-
-
Sessions, R. B.; Osguthorpe, D. J.; Dauber-Osguthorpe, P. J. Phys. Chem. 1995, 99, 9034-9044.
-
(1995)
J. Phys. Chem.
, vol.99
, pp. 9034-9044
-
-
Sessions, R.B.1
Osguthorpe, D.J.2
Dauber-Osguthorpe, P.3
-
23
-
-
0034737727
-
-
Kleinjung, J.; Bayley, P.; Fraternali, F. Febs Lett. 2000, 470, 257-262.
-
(2000)
Febs Lett.
, vol.470
, pp. 257-262
-
-
Kleinjung, J.1
Bayley, P.2
Fraternali, F.3
-
25
-
-
0000435390
-
-
Marrone, T. J.; Gilson, M. K.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 1439-1441.
-
(1996)
J. Phys. Chem.
, vol.100
, pp. 1439-1441
-
-
Marrone, T.J.1
Gilson, M.K.2
McCammon, J.A.3
-
27
-
-
11644251375
-
-
Scarsi, M.; Apostolakis, J.; Caflisch, A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3637-3641.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3637-3641
-
-
Scarsi, M.1
Apostolakis, J.2
Caflisch, A.3
-
30
-
-
36449009704
-
-
Lazaridis, T.; Tobias, D. J.; Brooks, C. L.; Paulaitis, M. E. J. Chem. Phys. 1991, 95, 7612-7625.
-
(1991)
J. Chem. Phys.
, vol.95
, pp. 7612-7625
-
-
Lazaridis, T.1
Tobias, D.J.2
Brooks, C.L.3
Paulaitis, M.E.4
-
31
-
-
0001568871
-
-
Apostolakis, J.; Ferrara, P.; Caflisch, A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2099-2108.
-
(1999)
J. Chem. Phys.
, vol.110
, pp. 2099-2108
-
-
Apostolakis, J.1
Ferrara, P.2
Caflisch, A.3
-
32
-
-
0345698008
-
-
Yale University, New Haven, CT
-
Jorgensen, W. L. BOSS 4.1; Yale University, New Haven, CT, 1999.
-
(1999)
BOSS 4.1
-
-
Jorgensen, W.L.1
-
34
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccoti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccoti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
35
-
-
0008901450
-
-
Jorgensen, W. L.; Briggs, J. M.; Contreras, M. L. J. Phys. Chem. 1990, 90, 1683-1686.
-
(1990)
J. Phys. Chem.
, vol.94
, pp. 1683-1686
-
-
Jorgensen, W.L.1
Briggs, J.M.2
Contreras, M.L.3
-
37
-
-
84925711387
-
-
Melchionna, S.; Ciccotti, G.; Holian, B. L. Mol. Phys. 1993, 78, 533-544.
-
(1993)
Mol. Phys.
, vol.78
, pp. 533-544
-
-
Melchionna, S.1
Ciccotti, G.2
Holian, B.L.3
-
38
-
-
0024278597
-
-
Dyson, H. J.; Rance, M.; Houghten, R. A.; Lerner, R. A.; Wright, P. E. J. Mol. Biol. 1988, 201, 161-200.
-
(1988)
J. Mol. Biol.
, vol.201
, pp. 161-200
-
-
Dyson, H.J.1
Rance, M.2
Houghten, R.A.3
Lerner, R.A.4
Wright, P.E.5
-
39
-
-
0025743641
-
-
Tobias, D. J.; Mertz, J. E.; Brooks, C. L. Biochemistry 1991, 30, 6054-6058.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 6054-6058
-
-
Tobias, D.J.1
Mertz, J.E.2
Brooks, C.L.3
-
40
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217.
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
41
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935.
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
42
-
-
0027393187
-
-
Karpen, M. E.; Tobias, D. J.; Brooks, C. L. Biochemistry 1993, 32, 412-420.
-
(1993)
Biochemistry
, vol.32
, pp. 412-420
-
-
Karpen, M.E.1
Tobias, D.J.2
Brooks, C.L.3
-
44
-
-
0041784950
-
-
Mackerell, A. D.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L.; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-Mccarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616.
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
Mackerell, A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
45
-
-
0013179370
-
-
Yale University, New Haven, CT
-
Jorgensen, W. L. MCPRO 1.4.; Yale University, New Haven, CT, 1996.
-
(1996)
MCPRO 1.4
-
-
Jorgensen, W.L.1
-
46
-
-
0029912748
-
-
Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225-11236.
-
(1996)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.118
, pp. 11225-11236
-
-
Jorgensen, W.L.1
Maxwell, D.S.2
Tirado-Rives, J.3
-
47
-
-
0042415783
-
-
Kale, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Krawetz, N.; Phillips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J. Comput. Phys. 1999, 151, 283-312.
-
(1999)
J. Comput. Phys.
, vol.151
, pp. 283-312
-
-
Kale, L.1
Skeel, R.2
Bhandarkar, M.3
Brunner, R.4
Gursoy, A.5
Krawetz, N.6
Phillips, J.7
Shinozaki, A.8
Varadarajan, K.9
Schulten, K.10
-
48
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
50
-
-
36449007836
-
-
Feller, S. E.; Zhang, Y. H.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621.
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 4613-4621
-
-
Feller, S.E.1
Zhang, Y.H.2
Pastor, R.W.3
Brooks, B.R.4
|