Fluorescent amino acid analogs

Methods in Enzymology

Volumn 360, Issue , 2003, Pages 104-127

  Twine, Susan M ^a   Szabo, Arthur G ^a  

^a WILFRID LAURIER UNIVERSITY   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

5 HYDROXYTRYPTOPHAN; ACETONITRILE; ALKALINE PHOSPHATASE; AMINO ACID DERIVATIVE; RECOMBINANT PROTEIN; TRYPTOPHAN; TRYPTOPHAN DERIVATIVE;

ABSORPTION SPECTROPHOTOMETRY; ARTICLE; AUXOTROPHIC MUTANT; BIOSYNTHESIS; ESCHERICHIA COLI; FLUORESCENCE SPECTROSCOPY; FLUORINATION; HYDROLYSIS; IN VIVO STUDY; MASS SPECTROMETRY; MELTING POINT; MOLECULAR PROBE; NONHUMAN; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PLASMID; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN EXPRESSION; PROTEIN FUNCTION; PROTEIN PROTEIN INTERACTION; PROTEIN PURIFICATION; PROTEIN STABILITY; PROTEIN STRUCTURE; QUANTUM MECHANICS; RAT; REPORTER GENE; SITE DIRECTED MUTAGENESIS; STRUCTURE ANALYSIS; TECHNIQUE;

ESCHERICHIA COLI;

EID: 0037278244     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(03)60108-4     Document Type: Article

References (81)

1. A. B. Pardee, V. G. Shore, and L. S. Prestridge, Biochim. Biophys. Acta 21, 406 (1956).
2. E, W. Davie, V. V. Koningsberger, and F. Lipman, Arch. Biochem. Biophys. 65, 21 (1956).
3. N. Sharon and F. Lipmann, Arch. Biochem. Biophys. 69, 219 (1957).
4. C. W. V. Hogue, Ph.D. Dissertation. University of Ottawa, Ottawa, Ontario, Canada, 1994.
5. C. V. W. Hogue and A. G. Szabo, Biophys. Chem. 48, 159 (1993).
6. S. Schlesinger, J. Biol. Chem. 243, 3877 (1968).
7. B. D. Sykes, H. I. Weinarte, and M. J. Schlesinger, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 71, 469 (1974).
8. F. A. Pratt and C. Ho, Biochemistry 14, 3035 (1975).
9. M. Negrerie, S. M. Bellefeuille, S. Whitman, J. W. Petrich, and R. W. Thornburg, J. Am. Chem. Soc. 112, 7419 (1990).
10. M. Negrerie, M. Gai, S. M. Bellefeuille, and J. W. Petrich, J. Phys. Chem. 95, 8663 (1991).
11. F. Gai and J. W. Petrich, J. Am. Chem. Soc. 114, 8343 (1992).
12. M. Negrerie, F. Gai, J. C. Lambry, J. L. Martin, and J. W. Petrich, J. Phys. Chem. 97, 5045 (1993).
13. Y. Chen, R. L. Rich, F. Gai, and J. W. Petrich, J. Phys. Chem. 97, 1770 (1993).
14. R. L. Rich, Y. Chen, D. Neven, M. Negrerie, F. Gai, and J. W. Petrich, J. Phys. Chem. 97, 1781 (1993).
15. R. L. Rich, M. Negrerie, J. Li, S. Elliott, R. W. Thornburg, and J. W. Petrich, Photochem. Photobiol. 58, 28 (1993).
16. Y. Chen, F. Gai, and J. W. Petrich, J. Am. Chem. Soc. 115, 10158 (1993).
17. Y. Chen, F. Gai, and J. W. Petrich, J. Phys. Chem. 98, 2203 (1994).
18. F. Gai, R. L. Rich, and J. W. Petrich, J. Am. Chem. Soc. 116, 735 (1994).
19. R. L. Rich, F. Gai, Y. Chen, and J. W. Petrich, Proc. SPIE 2137, 435 (1994).
20. C. W. V. Hogue, I. Rasquina, A. G. Szabo, and J. P. MacManus, FEBS Lett. 310, 269 (1992).
21. J. B. A. Ross, D. F. Senear, E. Waxman, B. B. Kombo, E. Rusinova, Y. T. Huang, W. R. Laws, and C. A. Hasselbacher, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 12023 (1992).
22. J. B. A. Ross, A. G. Szabo, and C. W. V. Hogue, Methods Enzymol. 273, 151 (1997).
23. J. K. Judice, T. R. Gamble, E. C. Murphy, A. M. de Vos, and P. G. Schultz, Science 261, 1578 (1993).
24. P. M. Bronskill and J. T. Wong, Biochem. J. 249, 305 (1988).
25. C. Wong and M. R. Eftink, Biochemistry 37, 8938 (1998).
26. J. D. Bain, D. A. Wacker, C. G. Glabe, T. A. Dix, and A. R. Chamberlin, J. Am. Chem. Soc. 111, 8013 (1989).
27. J. D. Bain, D. A. Wacker, E. E. Kuo, M. H. Lyttle, and A. R. Chamberlin, J. Org. Chem. 56, 4615 (1991).
28. C. J. Noren, S. J. Anthony-Cahill, M. C. Griffith, and P. G. Schultz, Science 244, 182 (1989).
29. D. M. Mendel, J. A. Ellman, Z. Chang, D. L. Veenstra, P. A. Kollman, and P. Schultz, Science 256, 1798 (1992).
30. F. W. Studier, A. H. Rosenberg, J. J. Dunn, and J. W. Dubendorff, Methods Enzymol. 185, 60 (1990).
31. J. Sambrook, E. F. Fritsch, and T. Maniatis, "Molecular Cloning: A Laboratory Manual," 2nd Ed., Vols. I, II, and III. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY, 1989.
32. C. Wong and M. R. Eftink, Biochemistry 37, 8947 (1998).
33. H. Edelhoch, Biochemistry 6, 1948 (1967).
34. D. Wetlaufer, Adv. Protein Chem. 17, 303 (1962).
35. W. R. Laws and C. A. Hasselbacher, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 12023 (1992).
36. E. Waxman, E. Rusinova, C. A. Hasselbacher, G. P. Schwartz, W. R. Laws, and J. B. A. Ross, Anal. Biochem. 210, 425 (1993).
37. T. E. Hugli and S. Moore, J. Biol. Chem. 247, 2828 (1974).
38. S. Delhaye and J. Landry, Anal. Biochem. 159, 175 (1986).
39. Q. S. Zhang, L. Shen, E. D. Wang, and Y. L. Wang, J. Protein Chem. 18, 187 (1999).
40. J. F. Parsons, G. Xiao, G. L. Gilliland, and R. N. Armstrong, Biochemistry 37, 6286 (1998).
41. M. Acchione, unpublished data (2001).
42. A. Ozarowski, J. Q. Wu, S. K. Davis, C. Y. Wong, M. R. Eftink, and A. H. Maki, Biochemistry 37, 8954 (1998).
43. M. R. Eftink, R. Ionesu, G. D. Ramsay, C. Y. Wong, J. Q. Wu, and A. A. Maki, Biochemistry 35, 8084 (1996).
44. C. Y. Wong and M. R. Eftink, Protein Sci. 6, 689 (1997).
45. D. Shortle and A. K. Mecker, Biochemistry 28, 938 (1989).
46. D. Shortle and C. Abygunwardana, Structure 1, 121 (1993).
47. J. Broos, F. der Veld, and G. T. Robillard, Biochemistry 38, 9798 (1999).
48. P. Soumillion, D. J. Sexton, and S. J. Benkovic, Biochemistry 37, 1819 (1998).
49. B. Sengupta, J. Guharay, and P. K. Sengupta, Spectrochim. Acta A 56, 1213 (2000).
50. J. Guharay, B. Sengupta, and P. K. Sengupta, Spectrochim. Acta A 54, 185 (1998).
51. B. Sengupta, J. Guharay, and P. K. Sengupta, J. Mol. Struct. 559, 347 (2001).
52. J. D. Bain, E. S. Diala, C. G. Glabe, T. A. Dix, and A. R. Chamberlain, J. Am. Chem. Soc. 111, 8013 (1989).
53. J. D. Bain, D. A. Wacker, E. E. Juo, M. H. Lyttle, and A. R. Chamberlin, J. Org. Chem. 56, 4615 (1991).
54. C. J. Noren, S. J. Anthony-Cahill, and P. G. Schultz, Science 244, 182 (1989).
55. D. M. Mendel, J. A. Ellman, Z. Chang, D. L. Veenstra, P. A. Kollman, and P. G. Schultz, Science 256, 1798 (1992).
56. J. K. Judice, T. R. Gamble, E. C. Murphy, A. M. de Vos, and P. G. Schultz, Science 261, 1578 (1993).
57. V. W. Cornish, D. R. Benson, C. A. Altenbach, K. Hideg, W. L. Hubbell, and P. G. Schultz, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 2910 (1994).
58. D. R. Liu, T. J. Magliery, M. Pastrnak, and P. G. Schultz, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 10092 (1997).
59. L. Jermutus, L. A. Ryabova, and A. Pluckthun, Curr. Opin. Biotechnol. 9, 534 (1998).
60. K. J. Rothschild and S. Gite, Curr. Opin. Biotechnol. 10, 64 (1999).
61. S. J. Anthony-Cahill, M. C. Griffith, C. J. Noren, D. J. Suich, and P. G. Schultz, Trends Biochem. Sci. 14, 400 (1990).
62. E. Resto, A. Lida, M. D. van Cleve, and S. M. Hecht, Nucleic Acids Res. 20, 5979 (1992).
63. G. Xiao, J. F. Parsons, K. Tesh, R. N. Armstrong, and G. L. Gilliland, J. Mol. Biol. 281, 323 (1998).
64. L. E. Steward, C. S. Collins, M. A. Gilmore, J. E. Carlson, J. B. A. Ross, and A. R. Chamberlin, J. Am. Chem. Soc. 119, 6 (1997).
65. M. W. Nowak, J. P. Gallivan, S. K. Silverman, C. G. Labarca, D. A. Dougherty, and H. A. Lester, Methods Enzymol. 293, 504 (1998).
66. L. E. Steward and A. R. Chamberlin, Methods Mol. Biol. 77, 325 (1998).
67. A. K. Koval and J. S. Oliver, Nucleic Acids Res. 25, 4685 (1997).
68. A. E. Johnson, Trends Biochem. Sci. 18, 235 (1993).
69. G. Barany and R. B. Merrifield, in "The Peptides" (E. Gross and J. Meienhofer, eds.), Vol. 2, p. 3. Academic Press, New York, 1980.
70. W. R. Laws, G. P. Schwartz, E. Rusinova, G. T. Burke, Y. C. Chi, P. Katsoyannis, and J. B. A. Ross, J. Protein Chem. 14, 225 (1995).
71. J. D. Brennan, C. W. V. Hogue, B. Rajendran, K. J. Willis, and A. G. Szabo, Anal. Biochem. 252, 260 (1997).
72. L. Lecointe, V. Rolland-Fulcrand, M. L. Roumestant, P. Viallefont, and J. Martinez, Tetrahedron Asym. 9, 1753 (1998).
73. J. R. Sydor, C. Herrmann, S. B. H. Kent, R. S. Goody, and M. Engelhard, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96, 7865 (1999).
74. P. E. Dawson, T. W. Muir, I. Clark-Lewis, and S. B. H. Kent, Science 266, 776 (1994).
75. J. P. Tam, Y. Lu, C. Liu, and J. Shao, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92, 12485 (1995).
76. L. E. Canne, A. R. Ferré-D'Amaré, S. K. Burley, and S. B. H. Kent, J. Am. Chem. Soc. 117, 2998 (1995).
77. T. M. Hackeng, C. M. Mounier, C. Bon, P. E. Dawson, J. H. Griffith, and S. B. H. Kent, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94, 7845 (1997).
78. M. L. McLaughlin and M. D. Barkley, Methods Enzymol. 278, 190 (1997).
79. Y. Kanagae, K. Peariso, and S. S. Martinez, Appl. Spectrom. 50, 316 (1996).
80. S. M. Twine, L. Murphy, P. Malinowski, R. S. Phillips, and A. G. Szabo, Biophys. J. 80, 1537 (2001).
81. G. M. Moran, R. S. Philips, and P. F. Fitzpatrick, Biochemistry 38, 16283 (1999).