EUDOC: A computer program for identification of drug interaction sites in macromolecules and drug leads from chemical databases

Journal of Computational Chemistry

Volumn 22, Issue 15, 2001, Pages 1750-1771

  Pang, Yuan Ping ^a,b   Perola, Emanuele ^b   Xu, Run ^b   Prendergast, Franklyn G ^a,b  

^a MAYO CLINIC CANCER CENTER   (United States)

^b MAYO CLINIC   (United States)

Author keywords

In silico screening; Molecular complexation; Molecular docking; Molecular recognition; Virtual screening

Indexed keywords

EID: 0035976367     PISSN: 01928651     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.1129     Document Type: Article

References (15)

1. Burley, S. K.; Almo, S. C.; Bonanno, J. B.; Capel, M.; Chance, M. R.; Gaasterland, T.; Lin, D. W.; Sali, A.; Studier, F. W.; Swaminathan, S. Nat Genet 1999, 23, 151.
2. Venter, J. C.; Adams, M. D.; Myers, E. W.; Li, P. W.; Mural, R. J.; Sutton, G. G.; Smith, H. O.; Yandell, M.; Evans, C. A.; Holt, R. A.; Gocayne, J. D.; Amanatides, P.; Ballew, R. M.; Huson, D. H.; Wortman, J. R.; Zhang, Q.; Kodira, C. D.; Zheng, X. Q. H.; Chen, L.; Skupski, M.; Subramanian, G.; Thomas, P. D.; Zhang, J. H.; Miklos, G. L. G.; Nelson, C.; et al. Science 2001, 291, 1304.
3. Banks, R. E.; Dunn, M. J.; Hochstrasser, D. F.; Sanchez, J. C.; Blackstock, W.; Pappin, D. J.; Selby, P. J. Lancet 2000, 356, 1749.
4. Kuntz, I. D.; Blaney, J. M.; Oatley, S. J.; Langridge, R.; Ferrin, T. E. J Mol Biol 1982, 161, 269.
5. Yamada, M.; Itai, A. Chem Pharm Bull 1993, 41, 1200.
6. Miller, M. D.; Kearsley, S. K.; Underwood, D. J.; Sheridan, R. P. J Comput-Aided Mol Design 1994, 8, 153.
7. Pang, Y. P.; Kozikowski, A. P. J Comput-Aided Mol Design 1994, 8, 669.
8. Rarey, M.; Kramer, B.; Lengauer, T.; Klebe, G. J Mol Biol 1996, 261, 470.
9. Goodsell, D. S.; Morris, G. M.; Olson, A. J. J Mol Recognit 1996, 9, 1.
10. Jones, G.; Willett, P.; Glen, R. C.; Leach, A. R.; Taylor, R. J Mol Biol 1997, 267, 727.
11. Morris, G. M.; Goodsell, D. S.; Halliday, R. S.; Huey, R.; Hart, W. E.; Belew, R. K.; Olson, A. J. J Comput Chem 1998, 19, 1639.
12. Liu, M.; Wang, S. J Comput-Aided Mol Design 1999, 13, 435.
13. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J.; Meyer, E. E., Jr.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimanouchi, T.; Tasumi, M. J Mol Biol 1977, 112, 53.
14. Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res 2000, 28, 235.
15. Pang, Y. P.; Kozikowski, A. P. J Comput-Aided Mol Design 1994, 8, 683.