Overlapping genes in bacterial and phage genomes

Molekulyarnaya Biologiya

Volumn 34, Issue 4, 2000, Pages 572-583

  Shcherbakov, D V ^a   Garber, M B ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIAL GENE; BACTERIAL GENOME; BACTERIOPHAGE; GENE; GENETICS; REVIEW; VIRUS GENE; VIRUS GENOME;

BACTERIOPHAGES; GENES, BACTERIAL; GENES, OVERLAPPING; GENES, VIRAL; GENOME, BACTERIAL; GENOME, VIRAL;

EID: 0034221653     PISSN: 00268984     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (91)

1. Barrel B.G., Air G.M., Hutchison C.A. // Nature. 1976. V. 264. P. 34-40.
2. Godson G. N., Barrell B. G., Staden R., Fiddes J. C. Il Nature. 1978. V. 276. P. 236-247.
3. Oppenheim D. S., Yanofsky C. // Genetics. 1980. V. 95. P. 785-795.
4. Barnes W. M., Tuley E. Il J. Mol. Biol. 1983. V. 165. p. 443-459.
5. McKenney K., Shimatake H., Court D., Schmeissner U., Brady C., Rosenberg M. Il Gène Amplif. Anal. 1981. V. 2. P. 383-415.
6. Cole S. T. //Eur. J. Biochem. 1982. V. 122. P. 479-484.
7. LinneyE.,Hayashi M. //Nature New Biol. 1973. V. 245. P. 6-8.
8. Dünn J. J., Studier F. W. Il J. Mol. Biol. 1981. V. 148. P. 303-330.
9. ShawJ. E.,MurialdoH.//Nature. 1980. V. 283.P. 30-35.
10. Gesteland R. F., Atkins J. F. Il Annu. Rev. Biochem. 1996. V. 65. P. 741-768.
11. O'Connor M. Il J. Mol. Biol. 1998. V. 279. P. 727-736.
12. Rettberg C. C., Prere M. F., Gesteland R. F., Atkins J. F., Fayet 0, //l. Mol. Biol. 1999. V. 286. P. 1365-1378.
13. Das A., Yanofsky C. II Nucleic Acids Res. 1989. V. 17. P. 9333-9340.
14. Liljestrom P., Laamanen I., Palva E. T. // J. Mol. Biol. 1988. V. 201. P. 663-673.
15. Bell A. W., Buckel S. D., Groarke J. M., Hope J. N., Kingsley D. H., Hermodson M.A./I J. Biol. Chem. 1986. V. 261. P. 7652-7658.
16. Selivanov N. A., Prilipov A. G., Efimov V. P., MarusichE. J., Mesyanzhinov V. V. II Biomed. Sci. 1990. V.l. P. 55-62.
17. Navarro C., Wu L. F., Mandrand-Berthelot M.A.I I Mol. Microbiol. 1993. V. 9. P. 1181-1191.
18. Vysotskaya V. S., Shcherbakov D. V., Garber M. B. // Gene. 1997. V. 193. P. 23-30.
19. Dandekar T., Snel B., Huynen M., Bork P. II Trends Biochem. Sci. 1998. V. 23. P. 324-328.
20. Turner R. J., Lu Y., Switzer R. L. II J. Bacteriol. 1994. V. 176. P. 3708-3722.
21. Sipley J., Stassi D., Dunn J., Goldman E. Il Gene Expr. 1991. V. 1. P. 127-136.
22. Condron B. G., Atkins J. F., Gesteland R. F. Il J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 6998-7003.
23. Levin M. E., HendrixR. W., Casjens S. R. // J. Mol. Biol. 1993. V. 234. P. 124-139.
24. Katsura J., Kühl P. W. // J. Mol. Biol. 1975. V. 91. P. 257-273.
25. Model P., Webster R. E., Zinder N. D. // Cell. 1979. V. 18. P. 235-246.
26. Fiers W., Contreras R., Duerinck F., Haegeman G., Iserentant D., Merregaert J., Min Jou W., Molemans F., Raeymaekers A., Van den Berghe A., Volckaert G., YsebaeriM. //Nature. 1976. V. 260. P. 500-507.
27. Atkins J. F., Steitz J. A., Anderson C. W., Model P. Il Cell. 1979. V. 18. P. 247-256.
28. Beremand M. N., Blumenthal T. Il Cell. 1979. V. 18. P. 257-266.
29. Kastelein R. A., Remaut E., Fiers W., van Duin J. Il Nature. 1982. V. 295. P. 35-41.
30. DeMarsCodyJ.,ConwayT. W.I/J. Virol. 1981. V. 37. P. 813-820.
31. Davies R. W. Il Nucleic Acids Res. 1980. V. 8. P. 17651782.
32. UmauiHe M. riepemiroieHHe reHOB. M.: Mnp, 1988.
33. Normark S., Bergstrom S., Edlund T., Grundstrom T., Jaurin B., Lindberg F. P, Olsson 0. II Annu. Rev. Genet. 1983. V. 17. P. 499-525.
34. Zajanckauskaite A., Malys N., Nivinskas R. II Gene. 1997. V. 194. P. 157-162.
35. Garrett J., Fusselman R., Hise J., Chiou L., Smith-GrilloD., Schuh J., Young R. II Mol. Gen. Genet. 1981. V. 182. P. 326-331.
36. Hanych B., Kedzierska S., Walderich B., Uznanski B., TaylorA. //Gene. 1993. V. 129. P. 1-8.
37. Kedzierska S., Wawrzynow A., Taylor A. II Gene. 1996. V. 168. P. 1-8.
38. Blasi U., Nam K., Lubitz W., Young R. H J. Bacteriol. 1990. V. 172. P. 5617-5623.
39. Linney E.,Hayashi M. II Nature New Biol. 1973. V. 245. P. 6-8.
40. Johnson R.C., Yin J.C., Reznikoff W.S. II Cell. 1982. V. 30. P. 873-S82.
41. De la Cruz N.B., Weinreich M.D., Wiegand T.W., Krebs M.P., Reznikoff W. S. II J. Bacteriol. 1993. V. 175. P. 6932-6938.
42. Rosenberg AJH., Patel S.S., Johnson KA., Studier F.W. // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. P. 15005-15012.
43. Nishiyama M., Kukimoto M., Beppu T., Horinouchi S, // Microbiology. 1995. V. 141. P. 1211-1219.
44. Yen T. S., Webster R. E. IIJ. Biol. Chem. 1981. V. 256. P. 11259-11265.
45. Fulford W., Model P. II J. Mol. Biol. 1984. V. 178. P. 137-153.
46. Fulford W., Model P. II J. Mol. Biol. 1988. V. 203. P. 49-62.
47. Kokoska R. J., Steege D. A. II J. Bacteriol. 1998. V. 180. P. 3245-3249.
48. Jalajakumari M. B., Thomas C. J., Halter R., Manning P. A. II Mol. Microbiol. 1989. V. 3. P. 1685-1695.
49. Tsuchihashi Z., Kornberg A. // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990. V. 87. P. 2516-2520.
50. Kim S., Marians K. J. II Nucleic Acids Res. 1995. V. 23. P. 1374-1379.
51. Larsen B., Wills N. M., Gesteland R. F., Atkins J. F. // J. Bacteriol. 1994. V. 176. P. 6842-6851.
52. Yurieva O., Skangalis M., Kuriyan J., O'Donnell M. // J. Biol. Chem. 1997. V. 272. P. 27131-27139.
53. JohnsrudL.//Mol.Gen.Genet. 1979. V. 169.P. 213-218.
54. Ghosal D., Sommer H., Saedler H. II Nucleic Acids Res. 1979. V. 6. P. 1111-1122.
55. Klaer R., Kühn S., Tillmann E., Fritz H. J., Starlinger P.11 Mol. Gen. Genet. 1981. V. 181. P. 169-175.
56. Kroger M., Hobom G. II Nature. 1982. V. 297. P. 159-162.
57. Kumamoto C. A., Nault A. K. II Gene. 1989. V. 75. P. 167-175.
58. Merino E., Balbas P., Puente J. L., Bolivar F. II Nucleic Acids Res. 1994. V. 22. P. 1903-1908.
59. Alff-Steinberger C. II Nucleic Acids Res. 1984. V. 12. P. 2235-2241.
60. Rak B., Lusky M., Hoble M. Il Nature. 1982. V. 297. P. 124-128.
61. Horowitz H., Platt T. Il Nucleic Acids Res. 1982. V. 10. P. 5447-5465.
62. Wellington C. L., Taggart A. K., Beatty J. T. Il J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 2954-2961.
63. Silke J. //Gene. 1997. V. 194. P. 143-155.
64. Cebrat S., Mackiewicz P., Dudek M. R. // Biosystems. 1998. V. 45. P. 165-176.
65. Jaurin B., Grundstrom T., Edlund T., Normark S. // Nature. 1981. V. 290. P. 221-225.
66. Normark S., Burman L. G. II J. Bacteriol. 1977. V. 132. P. 1-7.
67. Jaurin, Normark S. II J. Bacteriol. 1979. V. 138. P. 896902.
68. Jones H. M., Gunsalus R. P. II J. Bacteriol. 1987. V. 169. P. 3340-3349.
69. Engel P., Trageser M., Unden G. // Arch. Microbiol. 1991. V. 156. P. 463-470.
70. Grundstrom T., Normark S. II Mol. Gen. Genet. 1985. V. 198. P. 411-415.
71. Bergstrom S., Lindberg F. P., Olsson O., Normark S. II J. Bacteriol. 1983. V. 155. P. 1297-12305.
72. Lindquist S., Lindberg F., Normark S. Il J. Bacteriol. 1989. V. 171. P. 3746-3753.
73. Lindberg F., Westman L., Normark S. II Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1985. V. 82. P. 4620-4624.
74. Honore N., Nicolas M. H, Cole S. T. IIEMBO J. 1986. V. 5. P. 3709-3714.
75. Cole S. T. II Eur. J. Biochem. 1987. V. 167. P. 481-488.
76. Tuomanen E., Lindquist S., Sande S., Galleni M., Light K., Gage D., Normark S. II Science. 1991. V. 251. P. 201-204.
77. Bishop R. E., Weiner J. H. // FEMS Microbiol. Lett. 1993. V. 114. P. 349-354.
78. Lindahl L, SorF., Archer R. H., Nomura M., ZengelJ. M. // Biochim. Biophys. Acta. 1990. V. 1050. P. 337-342.
79. Nomura M., YatesJ. L., Dean D., Post L. E. //Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1980. V. 77. P. 7084-7088.
80. Pfeiffer T., Jorcke D., Feltens R., Hartmann R. K. // Gene. 1995. V. 167. P. 141-145.
81. Wellington C. L., Beatty J. T. // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 1432-1433.
82. Wellington C. L., TaggartA. K., Beatty J. T. // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 2954-2961.
83. Umbarger H. E. // Annu. Rev. Biochem. 1978. V. 47. P. 532-606.
84. WekR. C.,HatfieldG. W. Il J. Biol. Chem. 1986. V. 261. P. 2441-2450.
85. RheeK. Y.,SenearD. F., Hatfield G. W. Il J. Biol. Chem. 1998. V. 273. P. 11257-11266.
86. Chen J. W., Bennett D. C., Umbarger H. E. // J. Bacteriol. 1991. V. 173. P. 2328-2340.
87. Pagel J. M., Ha field G. W. Il J. Biol. Chem. 1991. V. 266. P. 1985-1996.
88. Rhee K. Y., Parekh B.S., Hatfield G. W. Il J. Biol. Chem. 1996. V. 271. P. 26499-26507.
89. Sameshima J. H., Wek R. C., Hatfield G. W. H J. Biol. Chem. 1989. V. 264. P. 1224-1231.