Competitive binding in magnesium coordination chemistry: Water versus ligands of biological interest

Journal of the American Chemical Society

Volumn 121, Issue 33, 1999, Pages 7665-7673

  Dudev, Todor ^a   Cowan, J A ^b   Lim, Carmay ^a,c  

^a INSTITUTE OF BIOMEDICAL SCIENCES   (Taiwan)

^b OHIO STATE UNIVERSITY   (United States)

^c NATIONAL TSING HUA UNIVERSITY   (Taiwan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

LIGAND; MAGNESIUM; WATER;

ARTICLE; BINDING AFFINITY; BINDING COMPETITION; BINDING SITE; ENERGY; LIGAND BINDING; THERMODYNAMICS;

EID: 0033603838     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja984470t     Document Type: Article

References (49)

1. Cowan, J. A., Ed. Biological Chemistry of Magnesium; VCH: New York, 1995.
2. Ebel, H.; Gunther, T. J. Clin. Chem. Clin. Biochem. 1980, 18, 257.
3. Black, C. B.; Huang, H. W.; Cowan, J. A. Coord. Chem. Rev. 1994, 135/136, 165.
4. Burgess, M. A. Metal ions in solution; Ellis Horwood: Chichester, 1978.
5. Blades, A. T.; Jayaweera, P.; Ikonomou, M. G.; Kebarle, P. J. Chem. Phys. 1990, 92, 5900.
6. Peschke, M.; Blades, A. T.; Kebarle, P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 9978.
7. Markham, G. D.; Glusker, J. P.; Bock, C. L.; Trachtman, M.; Bock, C. W. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3488.
8. Yliniemela, A.; Uchimaru, T.; Hirose, T.; Baldwin, B. W.; Tanabe, K. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 1996, 369, 9.
9. Garmer, D. R.; Gresh, N. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3556. Gresh, N.; Garmer, D. R. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1481.
10. Garmer, D. R.; Gresh, N. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 3556. Gresh, N.; Garmer, D. R. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1481.
11. Floris, M. F.; Persico, M.; Tani, A.; Tomasi, J. Chem. Phys. 1995, 195, 207,
12. Krauss, M.; Stevens, W. J. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 1460.
13. Glendening, E. D.; Feller, D. J. Phys. Chem. 1996, 100, 4790.
14. Partridge, H.; Bauschlicher, C. W., Jr. J. Phys. Chem. 1992, 96, 8827.
15. Marcos, E. S.; Pappalardo, R. R.; Rinaldi, D. J. Phys. Chem. 1991, 95, 8928.
16. Klobukowski, M. Can. J. Chem. 1992, 70, 589.
17. Katz, A. K.; Glusker, J. P.; Beebe, S. A.; Bock, C. W. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 5752.
18. Sponer, J.; Burda, J. V.; Sabat, M.; Leszczynski, J.; Hobza, P. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 5951.
19. Pavlov, M.; Siegbahn, P. E. M.; Sandström, M. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 219.
20. Bernstein, F. C.; Koetzle, T. F.; Williams, G. J. B.; Meyer, E. F., Jr.; Brice, M. D.; Rodgers, J. R.; Kennard, O.; Shimannouchi, T.; Tasumi, M. J. Mol. Biol. 1977, 112, 535-542.
21. Ziegler, T. Can. J. Chem. 1995, 73, 743.
22. Beeke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
23. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. 1988, B37, 785.
24. Hartmann, M.; Clark, T.; van Eldik, R. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 7843.
25. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 94, Revision D.4; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 1994.
26. Wong, M. W. Chem. Phys. Lett. 1996, 256, 391.
27. McQuarrie, D. A. Statistical Mechanics; Harper and Row: New York, 1976.
28. Stevens, W. J.; Fink, W. H. Chem. Phys. Lett. 1987, 139, 15.
29. Schmidt, M. W.; Baldridge, K. K.; Boatz, J. A.; Elbert, S. T.; Gordon, M. S.; Jensen, J. H.; Koseki, S.; Matsunaga, N.; Nguyen, K. A.; Su, S. J.; Windus, T. L.; Dupuis, M.; Montgomery, J. A. J. Comput. Chem. 1993, 14, 1347.
30. Gilson, M. K.; Honig, B. H. Proteins 1988, 4, 7.
31. Lim, C.; Bashford, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5610.
32. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. D.; Olafson, B. O.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187.
33. Cabani, S.; Gianni, P.; Mollica V.; Lepori, L. J. Solution Chem. 1981, 10, 563. Ben-Naim, A. Marcus, Y. J. Chem. Phys. 1984, 81, 2016.
34. Cabani, S.; Gianni, P.; Mollica V.; Lepori, L. J. Solution Chem. 1981, 10, 563. Ben-Naim, A. Marcus, Y. J. Chem. Phys. 1984, 81, 2016.
35. Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894.
36. Harvey, S. C.; Hoekstra, P. J. Phys. Chem. 1972, 76, 2987. Gilson, M. K.; Honig, B. H. Biopolymers 1986, 25, 2097.
37. Harvey, S. C.; Hoekstra, P. J. Phys. Chem. 1972, 76, 2987. Gilson, M. K.; Honig, B. H. Biopolymers 1986, 25, 2097.
38. Operti, L.; Tews, E. C.; Freiser, B. S. J. Am. Chem. Soc. 1988 110, 3847.
39. Boys, S. F.; Bernardi, F. Mol. Phys. 1970, 19, 553.
40. Dudev, T.; Lim, C. To be submitted for publication.
41. Cowan, J. A. Chem. Rev. 1998, 98, 1067.
42. Stryer, L. Biochemistry; Freeman: New York, 1988.
43. Cowan, J. A. Inorganic Biochemistry: An Introduction, 2nd ed.; Wiley-VCH: New York, 1997.
44. Oda, Y.; Yamazaki, T.; Nagayama, K.; Kanaya, S.; Kuroda, Y.; Nakamura, H. Biochemistry 1994, 33, 5275.
45. Declercq, J. P.; Tinant, B.; Parello, J.; Rambaud, J. J. Mol. Biol. 1991, 220, 1017.
46. King, H.; Lipscomb, W. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5006.
47. Lukatela, G.; Krauss, N.; Theis, K.; Selmer, T.; Gieselmann, V.; von Figura, K.; Saenger, W. Biochemistry 1998, 37, 3654.
48. Black, C. B.; Foster, M.; Cowan, J. A. J. Biol. Inorg. Chem. 1996, 1, 500.
49. Cowan, J. A. Inorg. Chim. Acta 1997, 275/276, 24.