Biochemical and functional interactions between HIV-1 Tat protein and TAR RNA

Archives of Biochemistry and Biophysics

Volumn 365, Issue 2, 1999, Pages 175-185

  Rana, Tariq M ^a   Jeang, Kuan Teh ^b  

^a Robert Wood Johnson   (United States)

^b NATIONAL INSTITUTES OF HEALTH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PHOSPHOTRANSFERASE; RNA BINDING PROTEIN; TRANSACTIVATOR PROTEIN; VIRUS PROTEIN;

HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN RNA BINDING; RNA SEQUENCE; RNA TRANSCRIPTION; SHORT SURVEY;

EID: 0033562094     PISSN: 00039861     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/abbi.1999.1206     Document Type: Article

References (99)

1. Jeang K. T., Gatignol A. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 188:1994;123-144.
2. Meyers G., Henderson L. E., Korber B., Jeang K. T., Wain-Hobson S. Los Alamos Natl. Lab. 3:1996;3-18.
3. Neuveut C., Jeang K. T. J. Virol. 70:1996;5572-5581.
4. Berkhout B., Silverman R. H., Jeang K. T. Cell. 59:1989;273-282.
5. Dingwall C., Ernberg I., Gait M. J., Green S. M., Heaphy S., Karn J., Lowe A. D., Singh M., Skinner M. A. EMBO J. 9:1990;4145-4153.
6. Cordingley M. G., La Femina R. L., Callahan P. L., Condra J. H., Sardana V. V., Graham D. J., Nguyen T. M., Le Grow K., Gotlib L., Schlabach A. J., Colonno R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87:1990;8985-8989.
7. Calnan B. J., Biancalana S., Hudson D., Frankel A. D. Genes Dev. 5:1991;201-210.
8. Berkhout B., Jeang K. T. J. Virol. 66:1992;139-149.
9. Berkhout B., Gatignol A. Cell. 62:1990;7257-7267.
10. Kamine J., Subramanian T., Chinnadurai G. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 8:1991;8510-8514.
11. Kamine J., Subramanian T., Chinnadurai G. J. Virol. 67:1993;6828-6834.
12. Jeang K. T., Chun R. F., Lin N. H., Gatignol A., Glabe C. G., Fan H. J. Virol. 67:1993;6224-6233.
13. Huang L. M., Jeang K. T. J. Virol. 67:1993;6937-6944.
14. Southgate C. D., Green M. R. Genes Dev. 5:1995;2496-2507.
15. Sune C., Garcia-Blanco M. A. J. Virol. 69:1995;6572-6576.
16. Pagtakhan A. S., Tong-Starksen S. E. Virology. 238:1997;221-230.
17. Xiao H., Lis J. T., Jeang K. T. Mol. Cell. Biol. 17:1997;6898-6905.
18. Chun R. F., Semmes O. J., Neuveut C., Jeang K. T. J. Virol. 72:1998;2615-2629.
19. Jones K. A., Peterlin B. M. Annu. Rev. Biochem. 63:1994;717-743.
20. Selby M. J., Peterlin B. M. Cell. 62:1990;769-776.
21. Berkhout B., Silverman R. H., Jeang K. T. Cell. 59:1989;273-282.
22. Rosen C. A., Sodroski J. G., Haseltine W. A. Cell. 41:1985;813-823.
23. Jakobovits A., Smith D. H., Jakobovits E. B., Capon D. J. Mol. Cell. Biol. 8:1988;2555-2561.
24. Weeks K. M., Crothers D. M. Cell. 66:1991;577-588.
25. Churcher M. J., Lamont C., Hamy F., Dingwall C., Green S. M., Lowe A., Butler P. J. C., Gait M. J., Karn J. J. Mol. Biol. 230:1993;90-110.
26. Berkhout B., Jeang K.-T. Nucleic Acids Res. 19:1991;6169-6176.
27. Sumner-Smith M., Roy S., Barnett R., Reid L. S., Kuperman R., Delling U., Sonenberg N. J. Virol. 65:1991;5196-5202.
28. Hamy F., Asseline U., Grasby J., Iwai S., Pritchard C., Slim G., Butler P. J. G., Karn J., Gait M. J. J. Mol. Biol. 230:1993;111-123.
29. Naryshkin N. A., Farrow M. A., Ivanovskaya M. G., Oretskaya T. S., Shabarova Z. A., Gait M. J. Biochemistry. 36:1997;3496-3505.
30. Wang Z., Rana T. M. Biochemistry. 35:1996;6491-6499.
31. Wang Z., Rana T. M. Biochemistry. 37:1998;4235-4243.
32. Long K. S., Crothers D. M. Biochemistry. 34:1995;8885-8895.
33. Subramanian T., Govindarajan R., Chinnadurai G. EMBO J. 10:1991;2311-2318.
34. Luo Y., Peterlin B. M. J. Virol. 67:1993;3441-3445.
35. Wei P., Garber M. E., Fang S.-M., Fischer W. H., Jones K. A. Cell. 92:1998;451-462.
36. Garber M. E., Wei P., KewalRamani V. N., Mayall T. P., Herrmann C. H., Rice A. P., Littman D. R., Jones K. A. Genes Dev. 12:1998;3512-3527.
37. Bieniasz P. D., Grdina T. A., Bogerd H. P., Cullen B. R. EMBO J. 17:1998;7056-7065.
38. Bayer P., Kraft M., Ejchart A., Westendorp M., Frank R., Rösch P. J. Mol. Biol. 247:1995;529-535.
39. Willbold D., Rosin-Arbesfeld R., Sticht H., Frank R., Rösch P. Science. 264:1994;1584-1587.
40. Puglisi J. D., Tan R., Calnan B. J., Frankel A. D., Williamson J. R. Science. 257:1992;76-80.
41. Aboul-ela F., Karn J., Varani G. J. Mol. Biol. 253:1995;313-332.
42. Shah K., Wu H., Rana T. M. Bioconj. Chem. 5:1994;508-512.
43. Wang Z., Rana T. M. J. Am. Chem. Soc. 117:1995;5438-5444.
44. Wang Z., Wang X., Rana T. M. J. Biol. Chem. 271:1996;16995-16998.
45. Colvin R. A., Garcia-Blanco M. A. J. Virol. 66:1992;930-935.
46. Tullius T. D., Dombroski B. A. Science. 230:1985;679-681.
47. Neenhold H. R., Rana T. M. Biochemistry. 34:1995;6303-6309.
48. Huq I., Tamilarasu N., Rana T. M. Nucleic Acids Res. 1999.
49. Aboul-ela F., Karn J., Varani G. Nucleic Acids Res. 24:1996;3974-3981.
50. Mujeeb A., Bishop K., Peterlin B. M., Turk C., Parslow T. G., James T. L. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91:1994;8248-8252.
51. Ye X., Kumar R. A., Patel D. J. Chem. Biol. 2:1995;827-840.
52. Puglisi J. D., Chen L., Blanchard S., Frankel A. D. Science. 270:1995;1200-1203.
53. Brown S. A., Weirich C. S., Newton E. M., Kingston R. E. EMBO J. 17:1998;3146.
54. Sandaltzopoulos R., Becker P. B. Mol. Cell. Biol. 18:1998;361-367.
55. Marciniak R. A., Calnan B. J., Frankel A. D., Sharp P. A. Cell. 63:1990;791-802.
56. Kato H., Sumimoto H., Pognonec P., Chen C. H., Rosen C. A., Roeder R. G. Genes Dev. 4:1992;655-666.
57. Keen N. J., Gait M. J., Karn J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93:1996;2505-2511.
58. Li X. Y., Green M. R. Genes Dev. 12:1998;2992-2996.
59. Blair E. D., Roberts C. M., Clark-Lewis I. J. Biomed. Sci. 2:1995;136-145.
60. Widlak P., Gaynor R. B., Garrard W. T. J. Biol. Chem. 272:1997;7654-7661.
61. Sheridan P. L., Mayall T. P., Verdin E., Jones K. A. Genes Dev. 11:1997;3327-3362.
62. Laspia M. F., Rice A. P., Matthews M. B. Cell. 59:1989;283-292.
63. Jeang K. T., Berkhout B. J. Biol. Chem. 267:1992;17891-17899.
64. Herrmann C. H., Rice A. P. J. Virol. 69:1995;1612-1620.
65. Chun R. F., Jeang K. T. J. Biol. Chem. 271:1996;27888-27894.
66. Okamoto O., Sheline C. T., Corden J. L., Jones K. A., Peterlin B. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93:1996;11575-11579.
67. O'Brien T., Hardin S., Greenleaf A., Lis J. T. Nature. 370:1994;75-77.
68. Dahmus M. E. J. Biol. Chem. 271:1996;19009-19012.
69. Cujec T. P., Okamoto H., Fujinaga K., Meyer J., Chamberlin H., Morgan D., Peterlin B. M. Genes Dev. 11:1997;2645-2657.
70. Garcia-Martinex L. F., Mavankal G., Neveu J. M., Lane W. S., Ivanov D., Ganynor R. B. EMBO J. 16:1997;2836-2850.
71. Parada C. A., Roeder R. G. Nature. 384:1996;375-377.
72. Marshall N. F., Peng J., Xie Z., Price D. H. J. Biol. Chem. 271:1996;27176-27183.
73. Yang X., Herrmann C. H., Rice A. P. J. Virol. 70:1995;4576-4584.
74. Zhou Q., Chen D., Pierstorff E., Luo K. EMBO J. 17:1998;3681-3691.
75. Mancebo H. S. Y., Lee G., Flygare H., Tomasssini J., Luu P., Zhu Y., Peng J., Blau C., Hazuda D., Price D., Flores O. Genes Dev. 11:1997;2633-2644.
76. Jones K. A. Genes Dev. 11:1997;2593-2599.
77. Jeang K. T. J. Biomed. Sci. 5:1998;24-27.
78. Van Holde K., Zlatanova J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93:1996;10548-10555.
79. Pennisi E. Science. 275:1997;155-157.
80. Verdin E., Paras P., Van Lint C. EMBO J. 12:1993;3249-3259.
81. Jeang K. T., Berkhout B., Dropulic B. J. Biol. Chem. 268:1993;24949-24959.
82. Hottiger M. O., Nabel G. J. J. Virol. 72:1998;8252-8256.
83. Benkirane M., Chun R. F., Xiao H., Ogryzko V. V., Howard B. H., Nakatani Y., Jeang K. T. J. Biol. Chem. 273:1998;24898-24905.
84. Marzio G., Tyagi M., Gutierrez M. I., Giacca M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95:1998;13519-13524.
85. Weissman J. D., Brown J. A., Howcroft T. K., Hwang J., Chawla A., Roche P. A., Schiltz L., Nakatani Y. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95:1998;11601-11606.
86. Huang L. M., Joshi A., Willey R., Orenstein J., Jeang K. T. EMBO J. 13:1994;2886-2896.
87. Li C. J., Ueda Y., Shi B., Borodyansky L., Huang L., Li Y. Z., Pardee A. B. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;8116-8120.
88. Ott M., Emiliani S., Van Lint C., Herbein G., Lovett J., Chirmule N., McCloskey T., Pahwa S., Verdin E. Science. 275:1997;1481-1485.
89. Li C. J., Friedman D. J., Wang C., Metelev V., Pardee A. B. Science. 268:1995;429-431.
90. Westendorp M. O., Shatrov V. A., Schulze-Osthoff K., Frank R., Kraft M., Los M., Krammer P. H., Droge W., Lehmann V. EMBO J. 14:1995;546-554.
91. Albini A., Ferrini S., Benelli R., Sforzini S., Giunciuglio D., Aluigi M. G., Proudfoot A. E., Alouani S., Wells T. N., Mariani G., Rabin R. L., Farber J. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95:1998;13153-13158.
92. Trinh D. P., Brown K. M., Jeang K. T. Biochem. Biophy. Res. Commun. 1999.
93. McMillan N. A., Chun R. F., Siderovski D. P., Galabru J., Toone W. M., Samuel C. E., Mak T. W., Hovanessian A. G., Jeang K. T., Williams B. R. Virology. 213:1995;413-424.
94. Xiao H., Neuveut C., Benkirane M., Jeang K. T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 244:1998;384-389.
95. Harrich D., Ulich C., Garcia-Martinez L. F., Gaynor R. EMBO J. 16:1997;1224-1235.
96. Chang H. K., Gallo R. C., Ensoli B. J. Biomed. Sci. 2:1995;189-202.
97. Vocero-Akbani A. M., Heyden N. V., Lissy N. A., Ratner L., Dowdy S. F. Nat. Med. 5:1999;29-33.
98. Goldstein G. Nat. Med. 2:1996;960-964.
99. Kestler H. W., Jeang K. T. Science. 270:1995;1219.