Interactions of HIV-1 TAR RNA with Tat-derived peptides discriminated by on-line acoustic wave detector

Analytical Chemistry

Volumn 71, Issue 6, 1999, Pages 1167-1175

  Furtado, L Michelle ^a   Su, Hongbo ^a   Thompson, Michael ^a   Mack, David P ^b   Hayward, Gordon L ^c  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^b PFIZER INC   (United States)

^c UNIVERSITY OF GUELPH   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACID; ANTIVIRUS AGENT; BIOTIN; MESSENGER RNA; NUCLEIC ACID; PEPTIDE; TRANSACTIVATOR PROTEIN; VIRUS RNA;

ACOUSTICS; ARTICLE; BINDING AFFINITY; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1; SENSOR;

ACOUSTICS; AMINO ACID SEQUENCE; BASE SEQUENCE; GENE PRODUCTS, TAT; HIV-1; KINETICS; MOLECULAR SEQUENCE DATA; NUCLEIC ACID CONFORMATION; PEPTIDE FRAGMENTS; RNA, VIRAL;

EID: 0033560028     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac980880o     Document Type: Article

References (48)

1. Cullen, B. R.; Greene, W. C. Cell 1989, 58, 423.
2. Cullen, B. R. FASEB J. 1991, 5, 2361.
3. Steffy, K.; Wong-Staal, F. Microbiol. Rev. 1991, 55, 193.
4. Churcher, M. J.; Lamont, C.; Hamy, F.; Dingwall, C.; Green, S. M.; Lowe, A. D.; Butler, P. J. G.; Gait, M. J.; Karn, J. J. Mol. Biol. 1993, 230, 90.
5. Arya, S. K.; Guo, G.; Josephs, S. F.; Wong-Staal, F. Science 1985, 229, 69.
6. Sodroski, J.; Patarca, R.; Rosen, C. Science 1985, 229, 74.
7. Frankel, A. D.; Bredt, D. S.; Pabo, C. O. Science 1985, 240, 70.
8. Cordingley, M. G.; LaFemina, R. L.; Callahan, P. L.; Condra, J.; Sardana, V. V.; Graham, D. J.; Nguyen, T. M.; LeGrow, K.; Gotlib, L.; Schlabach, A. J.; Collonno, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.SA. 1990, 87, 8985.
9. Dingwall, C.; Ernberg, I.; Gait, M. J.; Green, S. M.; Heaphy, S.; Kam, J.; Lowe, A. D.; Singh, M. S.; Skinner, M. A.; Valerio, R. Proc. Natl. Acad. Sci. 1989, 86, 6925.
10. Roy, S.; Delling, U.; Chen, C.-H.; Rosen, C. A.; Sonnenberg, N. Genes Dev. 1990, 4, 1365.
11. Sumner-Smith, M.; Roy, S.; Barnett, R.; Reid, L. S.; Kupeman, R.; Delling, U.; Sonenberg, N. Virology 1991, 65, 5196.
12. Hamy, F.; Asseline, U.; Grasby, J.; Iwai, S.; Pretchard, C.; Slim, G.; Butler, P. J. G.; Gait, M. J. J. Mol. Biol. 1993, 230, 111.
13. Aboul-ela, F.; Karn, J.; Varani, G. J. Mol. Biol. 1995, 253, 313.
14. Calnan, B. J.; Tidar, B,; Biancalana, S.; Hudson, D.; Frankel, A. D. Science 1991, 252, 1167.
15. Weeks, K. M.; Crothers, D. M. Cell 1991, 66, 577.
16. Tao, J.; Frankel, A. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 2723.
17. Tao, J.; Frankel, A. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 990, 1571.
18. Weeks, K. M.; Ampe, C.; Schultz, S. C.; Steitz, T. A.; Crothers, D. M. Science 1990, 249, 1281.
19. The Molecular Biology of HIV/AIDS, Lever, A. M. L., Ed.; John Wiley: New York, 1996.
20. Chandra, A.; Demirhan, I. Arya, S. K.; Chandre, P. FEBS Lett. 1988, 236, 282.
21. Hsu, M.-C.; Schutt, A. D.; Holly, M.; Slice, L. W.; Sherman, M. I.; richman, D. P.; Potash, J. J.; Volsky, D. J. Science 1991, 254, 1799.
22. Michne, W. F.; Schroeder, J. D.; Bailey, T. R.; Young, D. C.; Hughes, J. V.; Dutko, F. J J. Med. Chem. 1993, 36, 2701.
23. Coffen, D. L.; Huang, T.-L.; Ramer, S. E.; West, R. C.; Connel, E. V.; Schutt, A. D.; Hsu, M.-C. Antiviral Chem. Chemother. 1994, 5, 128.
24. Mei, H.-Y.; Galan, A. A.; Halim, N. S.; Mack, D. P.; Moreland, D. W.; Sanders, K. B.; Trang, H. N.; Czarnik, A. W. Bioorg. Med. Chem. Lett. 1996, 5, 2755.
25. Hamy, F.; Felder, E. R.; Heizmann, G.; Lazdins, J.; Aboul-ela, F.; Varani, G.; Karn, J.; Klimkait, T. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1997, 94, 3548.
26. Hamy, F.; Brondani, V.; Flörsheimer, A.; Stark, W.; Blommers, M. J. J.; Klimkait, J. Biochemistry 1998, 37, 5076.
27. Long, K. S.; Crothers, D. M. Biochemistry 1995, 34, 8885.
28. Čavič, B. A.; Chu, F. L.; Furtado, L. M.; Hayward, G. L.; Mack, D. P.; McGovern, M. E.; Su, H.; Thompson, M. Faraday Discuss. 1997, 107, 159.
29. Stevenson, A. C.; Lowe, C. R. Appl. Phys. Lett. 1998, 73, 1.
30. Okahata, Y.; Matsunobu, Y.; Ijuro, K.; Makae, M.; Murakami, M.; Makino, K. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 8299.
31. Andle, J. C.; Vetelino, J. F.; Lade, M. W.; McAllister, D. J. Sens. Actuators B 1992, 8, 191.
32. Su, H.; Kallury, K. M. R.; Thompson, M.; Roach, A. Anal. Chem. 1994, 66, 769.
33. Su, H.; Thompson, M. Biosens. Bioelectron. 1995, 10, 329.
34. Su, H.; Chong, S.; Thompson, M. Biosens, Bioelectron. 1997, 12, 161.
35. Sato, T.; Kawakami, T.; Shirakawa, N.; Ikahata, Y. Bull. Chem. Soc. Jpn. 1995, 68, 2709.
36. Caruso, F.; Rodda, E.; Furlong, D. N.; Niikura, K.; Okahata, Y. Anal. Chem. 1997, 67, 22043.
37. Su, H.; Williams, P.; Thompson, M. Anal. Chem. 1995, 67, 1010.
38. Niikura, K.; Nagata. K.; Okahata, Y. Chem. Lett. 1996, 863.
39. Miller, Y.; Gershoni, J. M.; Bayer, E. A.; Wilchek, M. Biochem. J. 1987, 248, 167.
40. Furtado, L M.; Nisman, R.; Thompson, M., to be published.
41. Ebersole, R. C.; Miller, J. A.; Moran, J. R; Ward, M. D. J. Am. Chem Soc. 1990, ;12, 3239.
42. Sauerbrey, G. Z. Phys. 1959, 155, 206.
43. Hayward, G. L.; Chu, G. Z. Anal. Chim. Acta 1994, 288, 179.
44. Zacharias, M.; Hagerman, P. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 6052.
45. Puglisi, J. D.; Tan, R.; Calnan, B. J.; Frankel, A. D.; Williamson, J. P. Science 1992, 76, 257.
46. Hayward, G. L; Thompson, M. J. Appl. Phys. 1998, 83, 2194.
47. Yang, M.; Thompson, M.; Duncan-Hewitt, W. Langmuir 1993, 9, 802.
48. Bhattacharyya, A.; Murchie, A. J. H., Lilley, D. M. J. Nature 1990, 343, 484.