Functional genomic analysis reveals the utility of the I/LWEQ module as a predictor of protein:actin interaction

Biochemical and Biophysical Research Communications

Volumn 266, Issue 1, 1999, Pages 135-140

  McCann, Richard O ^a   Craig, Susan W ^a  

^a JOHNS HOPKINS UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ACTIN; F ACTIN; HYBRID PROTEIN; TALIN;

AMINO ACID SEQUENCE; ANIMAL CELL; ARTICLE; CELL ADHESION; CELL DIFFERENTIATION; CONTROLLED STUDY; CYTOSKELETON; DICTYOSTELIUM DISCOIDEUM; GENE SEQUENCE; GENETIC ANALYSIS; MAMMAL; MOULD; NONHUMAN; NUCLEOTIDE SEQUENCE; PHYLOGENY; PRIORITY JOURNAL; YEAST;

ACRASIDA; ANIMALIA; DICTYOSTELIUM DISCOIDEUM; MAMMALIA; METAZOA; MYXOGASTRIA;

EID: 0033539916     PISSN: 0006291X     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1006/bbrc.1999.1776     Document Type: Article

References (28)

1. Rees D. J., Ades S. E., Singer S. J., Hynes R. O. Nature. 347:1990;685-689.
2. Moulder G. L., Huang M. M., Waterston R. H., Barstead R. J. Mol. Biol. Cell. 7:1996;1181-1193.
3. Hemmings L., Rees D. J. G., Ohanian V., Bolton S. J., Gilmore A. P., Patel B., Priddle H., Trevithick J. E., Hynes R. O., Critchley D. R. J. Cell Sci. 109:1996;2715-2726.
4. Holtzman D. A., Yang S., Drubin D. G. J. Cell Biol. 122:1993;635-644.
5. McCann R. O., Craig S. W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;5679-5684.
6. Wanker E. E., Rovira C., Scherzinger E., Hasenbank R., Walter S., Tait D., Colocelli J., Lahrach H. Hum. Mol. Genet. 6:1997;487-495.
7. Kalchman M. A., Koide H. B., McCutcheon K., Graham R. K., Nichol K., Nishiyama K., Kazemi-Esfarjani P., Lynn F. C., Wellington C., Metzler M., Goldberg Y. P., Kanazawa I., Gietz R. D., Hayden M. R. Nature Genet. 16:1997;44-53.
8. Altschul S. F., Madden T. L., Schaffer A. A., Zhang J., Zhang Z., Miller W., Lipman D. J. Nucleic Acids Res. 25:1997;3389-3402.
9. Thompson J. D., Higgins J. D., Gibson T. J. Nucl. Acids. Res. 22:1994;4673-4680.
10. Henikoff S., Henikoff J. G., Alford W. J., Pietrokovski S. Gene-COMBIS. 163:1995;GC17-GC26.
11. Rost B. Methods Enzymol. 266:1996;525-539.
12. Page R. D. M. Comp. Appl. Biosci. 12:1996;357-358.
13. Baldauf S. L., Doolittle W. F. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;12007-12012.
14. Roger A. J., Smith M. W., Doolittle R. F., Doolittle W. F. J. Eukaryot. Micriobiol. 43:1996;475-485.
15. Kuma K., Nikoh N., Iwabe N., Miyata T. J. Mol. Evol. 41:1995;238-246.
16. Berbee M. L., Taylor J. W. Can. J. Bot. 71:1994;1114-1127.
17. Feng D.-F., Cho G., Doolittle R. F. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94:1997;13028-13033.
18. Tsujioka M., Machesky L. M., Cole S. L., Yahata K., Inouye K. Curr. Biol. 9:1999;389-392.
19. Niewohner J., Weber I., Maniak M., Muller-Taubenberger A., Gerisch G. J. Cell Biol. 138:1997;349-361.
20. Li R., Zheng Y., Drubin D. G. J. Cell Biol. 128:1995;599-615.
21. Wesp A., Hicke L., Palecek J., Lombardi R., Aust T., Munn A. L., Riezman H. Mol. Biol. Cell. 8:1997;2291-2306.
22. Na S., Hincapie M., McCusker J. H., Haber J. E. J. Biol. Chem. 270:1995;6815-6823.
23. Yang S., Cope M. J., Drubin D. G. Mol. Biol. Cell. 10:1999;2265-2283.
24. Nagase T., Ishikawa K., Nakajima D., Ohira M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O., Seki N. DNA Res. 4:1997;141-150.
25. Ishikawa K., Nagase T., Suyama M., Miyajima N., Tanaka A., Kotani H., Nomura N., Ohara O. DNA Res. 5:1998;169-176.
26. Kay B. K., Yamabhai M., Wendland B., Emr S. D. Protein Sci. 8:1999;435-438.
27. Chishti A. H., Kim A. C., Marfatia S. M., Lutchman M., Hanspal M., Jindal H., Liu S. C., Low P. S., Rouleau G. A., Mohandas N., Chasis J. A., Conboy J. G., Gascard P., Takakuwa Y., Huang S. C., Benz E. J., Bretscher A., Fehon R. G., Gusella J. F., Ramesh V., Solomon F., Marchesi V. T., Tsukita S., Arpin M., Louvard D., Tonks N. K., Anderson J. M., Fanning A. S., Bryant P. J., Woods D. F., Hoover K. B. Trends Biochem. Sci. 23:1998;281-282.
28. Girault J.-A., Labesse G., Mornon J.-P., Callebaut I. Trends Biochem. Sci. 24:1999;47-53.