Multiplex dye DNA sequencing in capillary gel electrophoresis by diode laser-based time-resolved fluorescence detection

Analytical Chemistry

Volumn 70, Issue 22, 1998, Pages 4771-4779

  Lieberwirth, Ulrike ^a   Arden Jacob, Jutta ^b   Drexhage, Karl H ^b   Herten, Dirk P ^a   Müller, Ralph ^a   Neumann, Michael ^a   Schulz, Andreas ^a   Siebert, Stefan ^a   Sagner, Gregor ^c   Klingel, Sven ^c   Sauer, Markus ^a   Wolfrum, Jürgen ^a  

^a UNIVERSITY OF HEIDELBERG   (Germany)

^b UNIVERSITY OF SIEGEN   (Germany)

^c F HOFFMANN LA ROCHE LTD   (Switzerland)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DYES; ELECTROPHORESIS; FLUORESCENCE; GELS; PHOTODIODES; SEMICONDUCTOR LASERS;

CAPILLARY GEL ELECTROPHORESIS; ELECTROPHORETIC DNA SEPARATIONS; FLUORESCENCE DECAY; FLUORESCENT DYE LABELED PRIMERS; MULTIPLEX DYES; TIME RESOLVED FLUORESCENCE DETECTION;

DNA SEQUENCES;

CYANINE DYE; DNA; DNA FRAGMENT; FLUORESCENT DYE; OLIGONUCLEOTIDE; OXAZINE DERIVATIVE; POLYACRYLAMIDE GEL; PRIMER DNA; RHODAMINE;

ARTICLE; COVALENT BOND; DIODE LASER; DNA SEQUENCE; FLUORESCENCE; GEL ELECTROPHORESIS; PULSED DYE LASER;

DNA; ELECTROPHORESIS, CAPILLARY; OLIGONUCLEOTIDES; SPECTROMETRY, FLUORESCENCE;

EID: 0032533533     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac980230k     Document Type: Article

References (44)

1. Ansorge, W.; Sproat, B.; Stegemann, J.; Schwager, C.; Zenke, M. Nucleic Acids Res. 1987, 15, 4593-4602.
2. Wu, S.; Dovichi, N. J. J. Chromatogr. 1989, 480, 141-155.
3. Chen, D. Y.; Swerdlow, H. P.; Harke, H. R.; Zhang, J. Z.; Dovichi, N. J. J. Chromatogr. 1991, 559, 237-246.
4. Yeung, E. S.; Wang, P.; Li, W.; Giese, R. W. J. Chromatogr. 1992, 608, 73-77.
5. Williams, D. C.; Soper, S. A. Anal. Chem. 1995, 67, 3427-3432.
6. Swerdlow, H.; Jones, B. J.; Wittwer, C. T. Anal. Chem. 1997, 69, 848-855.
7. Cohen, A. S.; Najarian, D. R.; Paulus, A.; Guttmann, A.; Smith, J. A.; Karger, B. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1988, 85, 9660-9668.
8. Swerdlow, H.; Gestland, R. F. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 1415-1419.
9. Luckey, J. A.; Drossman, H.; Kostichka, A. J.; Mead, D. A.; D'Cunha, J.; Norris, T. B.; Smith, L. M. Nucleic Acids Res. 1990, 18, 4417-4421.
10. Swerdlow, H.; Zhang, J. Z.; Chen, D. Y.; Harke, H. R.; Grey, R.; Wu, S.; Dovichi, N. J.; Fuller, C. Anal. Chem. 1991, 63, 2835-2841.
11. Karger, A. E.; Harris, J. M.; Gesteland, R. F. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 4955-4962.
12. Kheterpal, I.; Scherer, J. R.; Clark, S. M.; Radhakrishnan, A.; Ju, J.; Ginther, C. L.; Sensabaugh, G. F.; Mathies, R. A. Electrophoresis 1996, 17, 1852-1859.
13. Quesada, M. A.; Zhang, S. Electrophoresis 1996, 17, 1841-1851.
14. Woolley, A. T.; Mathies, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1994, 91, 11348-11352.
15. Prober, J. M.; Trainor, G. L.; Dam, R. J.; Hobbs, F. W.; Robertson, C. W.; Zagursky, R. J.; Cocuzza, A. J.; Jemsen, M. A.; Baumeister, K. Science 1987, 238, 336-341.
16. Smith, L. M.; Sanders, J. Z.; Kaiser, R. J.; Hughes, P.; Dodd, C.; Connell, C. R.; Heiner, C.; Kent, S. B. H.; Hood, L. E. Nature 1989, 312, 674-680.
17. Ju, J.; Glazer, A. N.; Mathies, R. A. Nature Med. 1996, 2, 246-249.
18. Ju, J.; Kheterpal, I.; Scherer, J. R.; Ruan, C.; Fuller, C. W.; Glazer, A. N.; Mathies, R. A. Anal. Biochem. 1995, 231, 131-140.
19. Ju, J.; Ruan, C.; Fuller, C. W.; Glazer, A. N.; Mathies, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 4347-4351.
20. Hung, S. C.; Mathies, R. A.; Glazer, A. N. Anal. Biochem. 1997, 252, 778-788.
21. Lee, L. G.; Spurgeon, S. L.; Heiner, C. R.; Benson, S. C.; Rosenblum, B. B.; Menchen, S. M.; Graham, R. J.; Constantinescu, A.; Upadhya, K. G.; Cassel, J. M. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 2816-2822.
22. Metzker, M. L.; Lu, J.; Gibbs, R. A. Science 1996, 271, 1420-1422.
23. Smalley, M. B.; Shaver, J. M.; McGown, L. B. Anal. Chem. 1993, 65, 3466-3472.
24. Smalley, M. B.; McGown, L. B. Anal. Chem. 1995, 67, 1371-1376.
25. Nunnally, B. K.; He, H.; Li, L.-C.; Tucker, S. A.; McGown, L. B. Anal. Chem. 1997, 69, 2392-2397.
26. Soper, S. A.; Legendre, B. L., Jr.; Williams, D. C. Anal. Chem. 1995, 67, 4358-4365.
27. Sauer, M.; Arden-Jacob, J.; Drexhage, K. H.; Marx, N. J.; Karger, A. E.; Lieberwirth, U.; Müller, R.; Neumann, M.; Nord, S.; Paulus, A.; Schulz, A.; Seeger, S.; Zander, C.; Wolfrum, J. J. Biomed. Chromatogr. 1997, 11, 81-82.
28. Legendre, B. L., Jr.; Williams, D. C.; Soper, S. A.; Erdmann, R.; Ortmann, U.; Enderlein, J. Rev. Sci. Instrum. 1996, 67, 3984-3989.
29. Sauer, M.; Han, K. T.; Müller, R.; Schulz, A.; Ebert, V.; Seeger, S.; Wolfrum, J.; Arden-Jacob, J.; Deltau, G.; Marx, N. J.; Drexhage, K. H. Proc. SPIE-Int. Soc. Opt. Eng. 1994, 2137, 762-774.
30. Sauer, M.; Han, K. T.; Müller, R.; Nord, S.; Schulz, A.; Seeger, S.; Wolfrum, J.; Arden-Jacob, J.; Deltau, G.; Marx, N. J.; Drexhage, K. H. J. Fluoresc. 1995, 5, 247.
31. Boehringer Mannheim. German Patent DE 4137934, 1991.
32. Boehringer Mannheim. European Patent EP 0747447, 1996.
33. Arden-Jacob, J. Ph.D. Thesis, Universität-Gesamthochschule Siegen, 1992.
34. Murray, V. Nucleic Acids Res. 1989, 17, 8889-8893.
35. Köllner, M.; Wolfrum, J. Chem. Phys. Lett. 1992, 200, 199-205.
36. Köllner, M.; Fischer, A.; Arden-Jacob, J.; Drexhage, K. H.; Müller, R.; Seeger, S.; Wolfrum, J. Chem. Phys. Lett. 1996, 250, 355-360.
37. Soper, S. A.; Legendre, B. L., Jr.; Williams, D. C. Anal. Chem. 1995, 67, 4358-4366.
38. Sauer, M.; Zander, C.; Müller, R.; Göbel, F.; Schulz, A.; Siebert, S.; Drexhage, K. H.; Wolfrum, J. Proc. SPIE-Int. Soc. Opt. Eng. 1997, 2985, 61-68.
39. Sauer, M.; Arden-Jacob, J.; Drexhage, K. H.; Göbel, F.; Lieberwirth, U.; Mühlegger, K.; Müller, R.; Wolfrum, J.; Zander, C. Bioimaging 1998, 6, 1-11.
40. Kullback, S. Information theory and statistics; Wiley: New York, 1959; Chapter 6.4.
41. Köllner, M. Appl. Opt. 1993, 32, 806-820.
42. Seidel, C. A. M.; Schulz, A.; Sauer, M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5541-5553.
43. Sauer, M.; Drexhage, K. H.; Herten, D.; Lieberwirth, U.; Müller, R.; Nord, S.; Schulz, A.; Siebert, S.; Wolfrum, J. In Daehne, S., et al., Eds.; Near-Infrared Dyes for High Technology Applications; Kluwer Academic Publishers: Dordrecht, The Netherlands, 1998; pp 57-85.
44. Sauer, M.; Drexhage, K. H., Lieberwirth, U.; Müller, R.; Nord, S.; Zander, C. Chem. Phys. Lett. 1997, 284, 153-163.