Early and late M intermediates in the bacteriorhodopsin photocycle: A solid-state NMR study

Biochemistry

Volumn 37, Issue 22, 1998, Pages 8088-8096

  Hu, Jingui G ^a,b   Sun, Boqin Q ^a,b   Bizounok, Marina ^a   Hatcher, Mary E ^a,b   Lansing, Jonathan C ^b   Raap, Jan ^c   Verdegem, Peter J E ^c   Lugtenburg, Johan ^c   Griffin, Robert G ^b   Herzfeld, Judith ^a  

^a BRANDEIS UNIVERSITY   (United States)

^b MASSACHUSETTS INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^c LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIORHODOPSIN;

ARTICLE; HALOBACTERIUM; NONHUMAN; PHOTOACTIVATION; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN STRUCTURE; PROTON TRANSPORT; REACTION ANALYSIS; TEMPERATURE;

BACTERIORHODOPSINS; CARBON ISOTOPES; GUANIDINE; HALOBACTERIUM SALINARUM; LIGHT; LYSINE; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; NITROGEN ISOTOPES; PHOTOCHEMISTRY; PROLINE; PROTEIN CONFORMATION; PROTONS; SCHIFF BASES; SPECTROPHOTOMETRY;

EID: 0032474471     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi973168e     Document Type: Article

References (64)

1. Gerwert, K., Hess, B., & Engelhard, M. (1990) FEBS Lett. 261, 449-454.
2. Ames, J. B., & Mathies, R. A. (1990) Biochemistry 29, 7181-7190.
3. Druckman, S., Heyn, M. P., Lanyi, J. K., Ottolenghi, M., & Zimanyi, L. (1993) Biophys. J. 65, 1231-1234.
4. Milder, S. J. (1991) Biophys. J. 60, 440-446.
5. Varo, G., & Lanyi, J. K. (1990) Biochemistry 29, 2241-2250.
6. Varo, G., & Lanyi, J. K. (1991) Biochemistry 30, 7165-7171.
7. Varo, G., & Lanyi, J. K. (1991) Biochemistry 30, 5008-5015.
8. Varo, G., & Lanyi, J. K. (1991) Biochemistry 30, 5016-5022.
9. Varo, G., & Lanyi, J. K. (1991) Biophys. J. 59, 313-322.
10. Brown, L. S., Sasaki, J., Kandori, H., Maeda, A., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1995) J. Biol. Chem. 270, 27122-27126.
11. Braiman, M. S., Bousche, O., & Rothschild, K. J. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 2388-2392.
12. Gerwert, K., Souvignier, G., & Hess, B. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 9774-9778.
13. Otto, H., Marti, T., Holz, M., Mogi, T., Stern, L. J., Engel, F., Khorana, H. G., & Heyn, M. P. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 1018-1022.
14. Rothschild, K. J. (1992) J. Bioenerg. Biomembr. 24, 147-167.
15. Oesterhelt, D., Tittor, J., & Bamberg, E. (1992) J. Bioenerg. Biomembr. 24, 181-192.
16. Fodor, S. P. A., Ames, J. B., Gebhard, R., Van den Berg, E. M. M., Stoeckenius, W., Lugtenburg, J., & Mathies, R. A. (1988) Biochemistry 27, 7097-7101.
17. Henderson, R., Baldwin, J. M., Ceska, T. A., Zemlin, F., Beckmann, E., & Downing, K. H. (1990) J. Mol. Biol. 213, 899-929.
18. Lanyi, J. K. (1992) J. Bioenerg. Biomembr. 24, 169-179.
19. Varo, G., Zimanyi, L., Chang, M., Ni, B., Needleman, R., & Lanyi, J. (1992) Biophys. J. 61, 820-826.
20. Zimanyi, L., Varo, G., Chang, M., Ni, B., Needleman, R., & Lanyi, J. (1992) Biochemistry 31, 8535-8543.
21. Zimanyi, L., Cao, Y., Chang, M, Ni, B., Needleman, R., & Lanyi, J. (1992) Photochem. Photobiol. 56, 1049-1055.
22. Drachev, L. A., Kaulen, A. D., & Komrakov, A. Y. (1994) Biochemistry (Moscow) 59, 95-102.
23. Friedman, N., Gat, Y., Sheves, M., & Ottolenghi, M. (1994) Biochemistry 33, 14758-14767.
24. Ormos, P., Chu, K., & Mourant, J. (1992) Biochemistry 31, 6933-6937.
25. Perkins, G. A., Liu, E., Burkard, F., Berry, E. A., & Glaeser, R. M. (1992) J. Struct. Biol. 109, 142-151.
26. Vonck, J., Han, B.-G., Burkard, F., Perkins, G. A., & Glaeser, R. M. (1994) Biophys. J. 67, 1173-1178.
27. Sasaki, J., Shichida, Y., Lanyi, J. K., & Maeda, A. (1992) J. Biol. Chem. 267, 20782-20786.
28. Sass, H. J., Schachowa, I. W., Rapp, G., Koch, M. H. J., Oesterhelt, D., Dencher, N. A., & Bueldt, G. (1997) EMBO J. 16, 1484-1491.
29. Druckmann, S., Friedman, N., Lanyi, J. K., Needleman, R., Ottolenghi, M., & Sheves, M. (1992) Photochem. Photobiol. 56, 1041-1047.
30. Dickopf, S., & Heyn, M. P. (1997) Biophys. J. 73, 3171-3181.
31. Hessling, B., Herbst, J., Rammelsberg, R., & Gerwert, K. (1997) Biophys. J. 73, 2071-2080.
32. Han, B.-G., Vonck, J., & Glaeser, R. M. (1994) Biophys. J. 67, 1179-1186.
33. Dencher, N. A., Dresselhaus, D., Zaccai, G., & Bueldt, G. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 7876-7879.
34. Dencher, N. A., Heberle, J., Bark, C., Koch, M. H. J., Rapp, G., Oesterhelt, D., Bartels, K., & Bueldt, G. (1991) Photochem. Photobiol. 54, 881-887.
35. Nakasako, M., Kataoka, M., Amemiya, Y., & Tokunaga, F. (1991) FEBS Lett. 292, 73-75.
36. Koch, M. H. J., Dencher, N. A., Oesterhelt, D., Ploehn, H. J., Rapp, G., & Bueldt, G. (1991) EMBO J. 10, 521-526.
37. Subramaniam, S., Gerstein, M., Oesterhelt, D., & Henderson, R. (1993) EMBO J. 12, 1-8.
38. Kamikubo, H., Kataoka, M., Varo, G., Oka, T., Tokunaga, F., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93, 1386-1390.
39. Vonck, J. (1996) Biochemistry 35, 5870-8.
40. Harbison, G. S., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1983) Biochemistry 22, 1-5.
41. Hu, J. G., Sun, B. Q., Petkova, A. T., Griffin, R. G., & Herzfeld, J. (1997) Biochemistry 36, 9316-9322.
42. De Groot, H. J. M., Harbison, G. S., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1989) Biochemistry 28, 3346-3353.
43. Lakshmi, K. V., Farrar, M. R., Raap, J., Lugtenburg, J., Griffin, R. G., & Herzfeld, J. (1994) Biochemistry 33, 8853-8857.
44. Smith, S. O., Courtin, J., Van den Berg, E., Winkel, C., Lugtenburg, J., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1989) Biochemistry 28, 237-243.
45. Smith, S. O., De Groot, H. J. M., Gebhard, R., Courtin, J. M. L., Lugtenburg, J., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1989) Biochemistry 28, 8897-8904.
46. Farrar, M. R., Lakshmi, K. V., Smith, S. O., Brown, R. S., Raap, J., Lugtenburg, J., Griffin, R. G., & Herzfeld, J. (1993) Biophys. J. 65, 310-315.
47. Hamanaka, T., Hiraki, K., & Kito, Y. (1986) Photochem. Photobiol. 44, 75-78.
48. Oesterhelt, D., & Schuhmann, L. (1974) FEBS Lett. 44, 262-265.
49. Gochauer, M. B., & Kushner, D. (1969) Can. J. Microbiol. 15, 1157-1165.
50. Oesterhelt, D., & Stoeckenius, W. (1974) Methods Enzymol. 31, 667-678.
51. de Groot, H. J. M., Copie, V. C., Smith, S. O., Allen, P. J., Winkel, C., Lugtenburg, J., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1988) J. Magn. Reson. 77, 251.
52. Harbison, G. S., Smith, S. O., Pardoen, J. A., Mulder, P. P. J., Lugtenburg, J., Herzfeld, J., Mathies, R., & Griffin, R. G. (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81, 7106.
53. Yoshida, M., Ohono, K., Takeuchi, Y., & Kagawa, Y. (1977) Biochem. Biophys. Res. Commun. 75, 1111-1116.
54. Thompson, L. K., McDermott, A. E., Raap, J., van der Weilen, C. M., Lugtenburg, J., Herzfeld, J., & Griffin, R. G. (1992) Biochemistry 31, 7931.
55. Lakshmi, K. V., Auger, M., Raap, J., Lugtenburg, J., Griffin, R. G., & Herzfeld, J. (1993) J. Am. Chem. Soc. 115, 8515.
56. Smith, S. O., Hornung, I., van der Stern, R., Pardoen, J. A., Braiman, M., Lugtenburg, J., & Mathies, R. (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 967-971.
57. Braiman, M. S., & Mathies, R. (1982) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 79, 403-407.
58. Fodor, S. P. A., Pollard, W. T., Gebhard, R., Van den Berg, E. M. M., Lugtenburg, J., & Mathies, R. A. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85, 2156-2160.
59. Rousso, I., Friedman, N., Sheves, M., & Ottolenghi, M. (1995) Biochemistry 34, 12059-12065.
60. Westerman, P. W., Botto, R. E., & Roberts, J. D. (1978) J. Org. Chem. 43, 2590-2596.
61. Yuzuri, T., Wada, H., Suezawa, H., & Hirota, M. (1994) J. Phys. Org. Chem. 7, 280-286.
62. Weinstein, J., & McIninch, E. (1960) J. Am. Chem. Soc. 82, 6064-6067.
63. Ormos, P. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 473-477.
64. Radionov, A. N., & Kaulen, A. D. (1997) FEBS Lett. 409, 137-140.