A three-dimensional difference map of the N intermediate in the bacteriorhodopsin photocycle: Part of the F helix tilts in the M to N transition

Biochemistry

Volumn 35, Issue 18, 1996, Pages 5870-5878

  Vonck, Janet ^a,b  

^a UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^b EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIORHODOPSIN;

ARTICLE; CONFORMATIONAL TRANSITION; ELECTRON DIFFRACTION; HALOBACTERIUM; INFRARED SPECTROSCOPY; NONHUMAN; PH; PHOTOREACTIVITY; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN STRUCTURE; SITE DIRECTED MUTAGENESIS;

BACTERIORHODOPSINS; ELECTROCHEMISTRY; HALOBACTERIUM; MOLECULAR STRUCTURE; PHOTOCHEMISTRY; POINT MUTATION; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; SPECTROSCOPY, FOURIER TRANSFORM INFRARED;

HALOBACTERIUM;

EID: 0029886089     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi952663c     Document Type: Article

References (59)

1. Ahl, P. L., Stern, L. J., Mogi, T., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1989) Biochemistry 28, 10028-10034.
2. Baldwin, J., & Henderson, R. (1984) Ultramicroscopy 14, 319-336.
3. Booy, F. P., & Pawley, J. B. (1993) Ultramicroscopy 48, 273-280.
4. Bousché, O., Braiman, M., He, Y.-W., Marti, T., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1991) J. Biol. Chem. 266, 11063-11067.
5. Braiman, M. S., Mogi, T., Marti, T., Stern, L. J., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1988) Biochemistry 27, 8516-8520.
6. Braiman, M. S., Bousché, O., & Rothschild, K. J. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 2388-2392.
7. Brink, J., & Chiu, W. (1994) J. Struct. Biol. 113, 23-34.
8. Brown, L. S., Yamazaki, Y., Maeda, A., Sun, L., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1994) J. Mol. Biol. 239, 401-414.
9. Brown, L. S., Váró, G., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1995) Biophys. J. 69, 2103-2111.
10. Cao, Y., Váró, G., Chang, M., Ni, B., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1991) Biochemistry 30, 10972-10979.
11. Cao, Y., Váró, G., Klinger, A. K., Czajkowsky, D. M., Braiman, M. S., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1993) Biochemistry 32, 1981-1990.
12. Ceska, T. A., & Henderson, R. (1990) J. Mol. Biol. 213, 539-560.
13. Dencher, N., Dresselhaus, G., Zaccai, G., & Büldt, G. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 7876-7879.
14. Edholm, O., Berger, O., & Jähnig, F. (1995) J. Mol. Biol. 250, 94-111.
15. Gat, Y., Grossjean, M., Pinevsky, I., Takei, H., Rothman, Z., Sigrist, H., Lewis, A., & Sheves, M. (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 2434-2438.
16. Gerwert, K., Hess, B., Soppa, J., & Oesterhelt, D. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 4943-4947.
17. Glaeser, R. M., Tong, L., & Kim, S.-H. (1989) Ultramicroscopy 27, 307-318.
18. Han, B.-G., Vonck, J., & Glaeser, R. M. (1994a) Biophys. J. 67, 1179-1186.
19. Han, B.-G., Wolf, S. G., Vonck, J., & Glaeser, R. M. (1994b) Ultramicroscopy 55, 1-5.
20. He, Y., Krebs, M. P., Fischer, W. B., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1993) Biochemistry 32, 2282-2290.
21. Henderson, R., Baldwin, J. M., Ceska, T. A., Zemlin, F., Beckmann, E., & Downing, K. H. (1990) J. Mol. Biol. 213, 899-929.
22. Holz, M., Drachev, L. A., Mogi, T., Otto, H., Kaulen, A. D., Heyn, M. P., Skulachev, V. P., & Khorana, H. G. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 2167-2171.
23. Hoppe, W., & Hegerl, R. (1980) in Computer processing of electron microscope images (Hawkes, P. W., Ed.) pp 127-189, Springer, Berlin.
24. Kataoka, M., Kamikubo, H., Tokunaga, F., Brown, L. S., Yamazaki, Y., Maeda, A., Sheves, M., Needleman, R., & Lanyi, J. K. (1994) J. Mol. Biol. 243, 621-638.
25. Koch, M. H. J., Dencher, N. A., Oesterhelt, D., Plöhn, H.-L, Rapp, G., & Büldt, G. (1991) EMBO J. 10, 521-526.
26. Krebs, M. P., & Khorana, H. G. (1993) J. Bacteriol. 175, 1555-1560.
27. Lanyi, J. K. (1993) Biochim. Biophys. Acta 1183, 241-261.
28. Lozier, R. H., Bogomolni, R. A., & Niederberger, W. (1975) Biophys. J. 15, 955-962.
29. Ludlam, C. F. C., Sonar, S., Lee, C-P., Coleman, M., Herzfeld, J., RajBhandary, U. L., & Rothschild, K. J. (1995) Biochemistry 34, 2-6.
30. Mathies, R. A., Lin, S. W., Ames, J. B., & Pollard, W. T. (1991) Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 20, 491-518.
31. Müller, D. J., Büldt, G., & Engel, A. (1995) J. Mol. Biol. 249, 239-243.
32. Nakasako, M., Kataoka, M., & Tokunaga, F. (1989) FEBS Lett. 254, 211-214.
33. Nakasako, M., Kataoka, M., Amemiya, Y., & Tokunaga, F. (1991) FEBS Lett. 292, 73-75.
34. Needleman, R., Chang, M., Ni, B., Váró, G., Fornés, J., White, S. H., & Lanyi, J. K. (1991) J. Biol. Chem. 266, 11478-11484.
35. Nilsson, A., Rath, P., Olejnik, J., Coleman, M., & Rothschild, K. J. (1995) J. Biol. Chem. 270, 29746-29751.
36. Oesterhelt, D., & Stoeckenius, W. (1974) Methods Enzymol. 31, 661-678.
37. Olejnik, J., Brzezinski, B., & Zundel, G. (1992) J. Mol. Struct. 271, 157-173.
38. Ormos, P., Chu, K., & Mourant, J. (1992) Biochemistry 31, 6933-6937.
39. Otto, H., Marti, T., Holz, M., Mogi, T., Lindau, M., Khorana, H. G., & Heyn, M. P. (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 9228-9232.
40. Otto, H., Marti, T., Holz, M., Mogi, T., Stern, L. J., Engel, F., Khorana, H. G., & Heyn, M. P. (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 1018-1022.
41. Perkins, G. A., Liu, E., Burkard, F., Berry, E. A., & Glaeser, R. M. (1992) J. Struct. Biol. 109, 142-151.
42. Perkins, G. A., Burkard, F., Liu, E., & Glaeser, R. M. (1993) J. Microsc. 169, 61-65.
43. Pfefferlé, L-M., Maeda, A., Sasaki, J., & Yoshizawa, T. (1991) Biochemistry 30, 6548-6556.
44. Rath, P., Krebs, M. P., He, Y., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1993) Biochemistry 32, 2272-2281.
45. Rothschild, K. J., Braiman, M. S., He, Y.-W., Marti, T., & Khorana, H. G. (1990a) J. Biol. Chem. 265, 16985-16991.
46. Rothschild, K. J., He, Y.-W., Mogi, T., Marti, T., Stern, L. J., & Khorana, H. G. (1990b) Biochemistry 29, 5954-5960.
47. Rothschild, K. J., Marti, T., Sonar, S., He, Y.-W., Rath, P., Fischer, W., & Khorana, H. G. (1993) J. Biol. Chem. 268, 27046-27052.
48. Sasaki, J., Shichida, Y., Lanyi, J. K., & Maeda, A. (1992) J. Biol. Chem. 267, 20782-20786.
49. Sonar, S., Krebs, M. P., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1993) Biochemistry 32, 2263-2271.
50. Sonar, S., Marti, T., Rath, P., Fischer, W., Coleman, M., Khorana, H. G., & Rothschild, K. J. (1994) J. Biol. Chem. 269, 28851-28858.
51. Soppa, J., Duschl, J., & Oesterhelt, D. (1993) J. Bacteriol. 175, 2720-2726.
52. Steinhoff, H.-J., Mollaaghababa, R., Altenbach, C., Hideg, K., Krebs, M., Khorana, H. G., & Hubbell, W. L. (1994) Science 299, 105-107.
53. Strader, C. D., Fong, T. M., Tota, M. R., Underwood, D., & Dixon, R. A. F. (1994) Annu. Rev. Biochem. 63, 101-132.
54. Subramaniam, S., Gerstein, M., Oesterhelt, D., & Henderson, R. (1993) EMBO J. 8, 1-12.
55. Takei, H., Gat, Y., Rothman, Z., Lewis, A., & Sheves, M. (1994) J. Biol. Chem. 269, 7387-7389.
56. Váró, G., & Lanyi, J. K. (1991a) Biochemistry 30, 5008-5015.
57. Váró, G., & Lanyi, J. K. (1991b) Biochemistry 30, 5016-5022.
58. Váró, G., & Lanyi, J. K. (1991c) Biophys. J. 59, 313-322.
59. Vonck, J., Han, B.-G., Burkard, F., Perkins, G. A., & Glaeser, R. M. (1994) Biophys. J. 67, 1173-1178.