Methylphosphonate modified hairpin loops

Nucleosides and Nucleotides

Volumn 17, Issue 1-3, 1998, Pages 317-326

  Schweitzer, Markus ^a   Engels, Joachim W ^a  

^a GOETHE UNIVERSITY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; METHYLPHOSPHONIC ACID; OLIGONUCLEOTIDE;

ARTICLE; DNA CONFORMATION; DNA DETERMINATION; DNA MODIFICATION; DNA SYNTHESIS; STEREOCHEMISTRY; TEMPERATURE;

EID: 0031912395     PISSN: 07328311     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (34)

1. Miller, P. S.; Yano, J.; Yano, E.; Carroll, C.; Jayaraman, K.; Ts'o, P. O. P.; Biochemistry 1979 18, 5134-5143. Agrawal; K. L.; Riftina, F.; Nucleic Acids Res. 1979 6, 3009-3024.
2. Miller, P. S.; Yano, J.; Yano, E.; Carroll, C.; Jayaraman, K.; Ts'o, P. O. P.; Biochemistry 1979 18, 5134-5143. Agrawal; K. L.; Riftina, F.; Nucleic Acids Res. 1979 6, 3009-3024.
3. Löschner, T.; Engels, J. W.; Nucleos. Nucleot. 1988 7, 729-732. Agrawal, S.; Goodchild, J.; Tetrahedron Letters 1987 28, 3539-3542. Jäger, A.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1984 25, 1437-1440.
4. Löschner, T.; Engels, J. W.; Nucleos. Nucleot. 1988 7, 729-732. Agrawal, S.; Goodchild, J.; Tetrahedron Letters 1987 28, 3539-3542. Jäger, A.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1984 25, 1437-1440.
5. Löschner, T.; Engels, J. W.; Nucleos. Nucleot. 1988 7, 729-732. Agrawal, S.; Goodchild, J.; Tetrahedron Letters 1987 28, 3539-3542. Jäger, A.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1984 25, 1437-1440.
6. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1988 16, 11675-11689. Jaworska-Maslanka, M. M.; Kacperczyk, W.; Korczynski, D.; Lesnikovski, Z. J.; Antisense & Nucleic Acids Drug Dev. 1997 7, 23-30. Wozniak, L.; Pyzowski, J.; Stec, W. J.; J. Org. Chem 1996 61, 879-881. Le Bec, C.; Wickstrom, E.; J. Org. Chem. 1996 61, 510-513. Dineva, M. A.; Chakurov, S.; Bratovanova, E. K.; Devedjiev, I.; Petkov, D. D.; Bioorg. Med. Chem. 1993 1, 411-414.
7. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1988 16, 11675-11689. Jaworska-Maslanka, M. M.; Kacperczyk, W.; Korczynski, D.; Lesnikovski, Z. J.; Antisense & Nucleic Acids Drug Dev. 1997 7, 23-30. Wozniak, L.; Pyzowski, J.; Stec, W. J.; J. Org. Chem 1996 61, 879-881. Le Bec, C.; Wickstrom, E.; J. Org. Chem. 1996 61, 510-513. Dineva, M. A.; Chakurov, S.; Bratovanova, E. K.; Devedjiev, I.; Petkov, D. D.; Bioorg. Med. Chem. 1993 1, 411-414.
8. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1988 16, 11675-11689. Jaworska-Maslanka, M. M.; Kacperczyk, W.; Korczynski, D.; Lesnikovski, Z. J.; Antisense & Nucleic Acids Drug Dev. 1997 7, 23-30. Wozniak, L.; Pyzowski, J.; Stec, W. J.; J. Org. Chem 1996 61, 879-881. Le Bec, C.; Wickstrom, E.; J. Org. Chem. 1996 61, 510-513. Dineva, M. A.; Chakurov, S.; Bratovanova, E. K.; Devedjiev, I.; Petkov, D. D.; Bioorg. Med. Chem. 1993 1, 411-414.
9. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1988 16, 11675-11689. Jaworska-Maslanka, M. M.; Kacperczyk, W.; Korczynski, D.; Lesnikovski, Z. J.; Antisense & Nucleic Acids Drug Dev. 1997 7, 23-30. Wozniak, L.; Pyzowski, J.; Stec, W. J.; J. Org. Chem 1996 61, 879-881. Le Bec, C.; Wickstrom, E.; J. Org. Chem. 1996 61, 510-513. Dineva, M. A.; Chakurov, S.; Bratovanova, E. K.; Devedjiev, I.; Petkov, D. D.; Bioorg. Med. Chem. 1993 1, 411-414.
10. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1988 16, 11675-11689. Jaworska-Maslanka, M. M.; Kacperczyk, W.; Korczynski, D.; Lesnikovski, Z. J.; Antisense & Nucleic Acids Drug Dev. 1997 7, 23-30. Wozniak, L.; Pyzowski, J.; Stec, W. J.; J. Org. Chem 1996 61, 879-881. Le Bec, C.; Wickstrom, E.; J. Org. Chem. 1996 61, 510-513. Dineva, M. A.; Chakurov, S.; Bratovanova, E. K.; Devedjiev, I.; Petkov, D. D.; Bioorg. Med. Chem. 1993 1, 411-414.
11. Reynolds, M. A.; Hogrefe, R. I.; Jaeger, J. A.; Schwartz, D. A.; Riley, T. A.; Marvin, W. B.; Daily, W. J.; Vaghefi, M. M.; Beck, T. A.; Knowles, S. K.; Klem, R. E.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1996 24, 4584-4591. Vyazovkina, E. V.; Savchenko, E. V.; Lokhov, S. G.; Engels, J. W.; Wickstrom E.; Lebedev, A. V.; Nucleic Acids Res. 1994 22, 2404-2409. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2109-2115. Bower, M.; Summers, M. F.; Powell, C. Shinozuka, K.; Regan, J. B.; Zon, G.; Wilson, W. D.; Nucleic Acids Res. 1987 15, 4915-4930. Miller, P. S.; Annan, N. D.; McParland, K. B.; Pulford, S. M.; Biochemistry 1982 21, 2507-2512.
12. Reynolds, M. A.; Hogrefe, R. I.; Jaeger, J. A.; Schwartz, D. A.; Riley, T. A.; Marvin, W. B.; Daily, W. J.; Vaghefi, M. M.; Beck, T. A.; Knowles, S. K.; Klem, R. E.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1996 24, 4584-4591. Vyazovkina, E. V.; Savchenko, E. V.; Lokhov, S. G.; Engels, J. W.; Wickstrom E.; Lebedev, A. V.; Nucleic Acids Res. 1994 22, 2404-2409. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2109-2115. Bower, M.; Summers, M. F.; Powell, C. Shinozuka, K.; Regan, J. B.; Zon, G.; Wilson, W. D.; Nucleic Acids Res. 1987 15, 4915-4930. Miller, P. S.; Annan, N. D.; McParland, K. B.; Pulford, S. M.; Biochemistry 1982 21, 2507-2512.
13. Reynolds, M. A.; Hogrefe, R. I.; Jaeger, J. A.; Schwartz, D. A.; Riley, T. A.; Marvin, W. B.; Daily, W. J.; Vaghefi, M. M.; Beck, T. A.; Knowles, S. K.; Klem, R. E.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1996 24, 4584-4591. Vyazovkina, E. V.; Savchenko, E. V.; Lokhov, S. G.; Engels, J. W.; Wickstrom E.; Lebedev, A. V.; Nucleic Acids Res. 1994 22, 2404-2409. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2109-2115. Bower, M.; Summers, M. F.; Powell, C. Shinozuka, K.; Regan, J. B.; Zon, G.; Wilson, W. D.; Nucleic Acids Res. 1987 15, 4915-4930. Miller, P. S.; Annan, N. D.; McParland, K. B.; Pulford, S. M.; Biochemistry 1982 21, 2507-2512.
14. Reynolds, M. A.; Hogrefe, R. I.; Jaeger, J. A.; Schwartz, D. A.; Riley, T. A.; Marvin, W. B.; Daily, W. J.; Vaghefi, M. M.; Beck, T. A.; Knowles, S. K.; Klem, R. E.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1996 24, 4584-4591. Vyazovkina, E. V.; Savchenko, E. V.; Lokhov, S. G.; Engels, J. W.; Wickstrom E.; Lebedev, A. V.; Nucleic Acids Res. 1994 22, 2404-2409. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2109-2115. Bower, M.; Summers, M. F.; Powell, C. Shinozuka, K.; Regan, J. B.; Zon, G.; Wilson, W. D.; Nucleic Acids Res. 1987 15, 4915-4930. Miller, P. S.; Annan, N. D.; McParland, K. B.; Pulford, S. M.; Biochemistry 1982 21, 2507-2512.
15. Reynolds, M. A.; Hogrefe, R. I.; Jaeger, J. A.; Schwartz, D. A.; Riley, T. A.; Marvin, W. B.; Daily, W. J.; Vaghefi, M. M.; Beck, T. A.; Knowles, S. K.; Klem, R. E.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1996 24, 4584-4591. Vyazovkina, E. V.; Savchenko, E. V.; Lokhov, S. G.; Engels, J. W.; Wickstrom E.; Lebedev, A. V.; Nucleic Acids Res. 1994 22, 2404-2409. Lesnikowski, Z. J.; Jaworska, M.; Stec, W. J.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2109-2115. Bower, M.; Summers, M. F.; Powell, C. Shinozuka, K.; Regan, J. B.; Zon, G.; Wilson, W. D.; Nucleic Acids Res. 1987 15, 4915-4930. Miller, P. S.; Annan, N. D.; McParland, K. B.; Pulford, S. M.; Biochemistry 1982 21, 2507-2512.
16. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
17. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
18. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
19. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
20. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
21. Avizonis, D. Z.; Kearns, D. R.; Nucleic Acids Res. 1995 23, 1260-1268. James, J. K.; Tinoco Jr., I.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 3287-3293. Rentzeperis, D.; Alessi, K.; Marky, L. A.; Nucleic Acids Res. 1993 21, 2683-2689. Antao, V. P.; Tinoco Jr, I.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 819-824. Hirao, I.; Nishimura, Y.; Tagawa, Y.; Watanabe, K.; Miura, K.; Nucleic Acids Res. 1992 20, 3891-3896. Piotto, M. E.; Granger, J. N.; Cho, Y;Gorenstein, D. G.; J. Am. Chem. Soc. 1990 112, 8632-8634.
22. Han, F.; Watt, W.; Duchamp, D.J.; Callahan, L.; Kézdy, F.; Agrawal, K.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2759-2767. Chacko, K.K.; Lindner, K.; Saenger, W.; Nucleic Acids Res. 1983 11, 2801-2814. Szabó, T.; Noréus, D.; Norrestam, R.; Stawinsli, J.; Nucleic Acids Res. 1993 27, 3921-3926.
23. Han, F.; Watt, W.; Duchamp, D.J.; Callahan, L.; Kézdy, F.; Agrawal, K.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2759-2767. Chacko, K.K.; Lindner, K.; Saenger, W.; Nucleic Acids Res. 1983 11, 2801-2814. Szabó, T.; Noréus, D.; Norrestam, R.; Stawinsli, J.; Nucleic Acids Res. 1993 27, 3921-3926.
24. Han, F.; Watt, W.; Duchamp, D.J.; Callahan, L.; Kézdy, F.; Agrawal, K.; Nucleic Acids Res. 1990 18, 2759-2767. Chacko, K.K.; Lindner, K.; Saenger, W.; Nucleic Acids Res. 1983 11, 2801-2814. Szabó, T.; Noréus, D.; Norrestam, R.; Stawinsli, J.; Nucleic Acids Res. 1993 27, 3921-3926.
25. Löschner, T.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1989 30, 5587-5590. Engels, J. W.; Löschner, Frauendorf; Nucleos. Nucleot. 1991 10, 347-350. Engels, J. W.; Jäger, A.; Angew. Chem. Suppl. 1982 2010-2015
26. Löschner, T.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1989 30, 5587-5590. Engels, J. W.; Löschner, Frauendorf; Nucleos. Nucleot. 1991 10, 347-350. Engels, J. W.; Jäger, A.; Angew. Chem. Suppl. 1982 2010-2015
27. Löschner, T.; Engels, J. W.; Tetrahedron Letters 1989 30, 5587-5590. Engels, J. W.; Löschner, Frauendorf; Nucleos. Nucleot. 1991 10, 347-350. Engels, J. W.; Jäger, A.; Angew. Chem. Suppl. 1982 2010-2015
28. Schweitzer, M.; Samstag, W.; Engels, J. W.; Nucleos. Nucleot. 1995 14, 817-820.
29. Baxter, S. M.; Greizerstein, M. B.; Kushlan, D. M.; Ashley, G. W.; Biochemistry 1993 32, 8702-8711. Hare, D. R.; Reid, B. R.; Biochemistry 1986 25, 5341-5350.
30. Baxter, S. M.; Greizerstein, M. B.; Kushlan, D. M.; Ashley, G. W.; Biochemistry 1993 32, 8702-8711. Hare, D. R.; Reid, B. R.; Biochemistry 1986 25, 5341-5350.
31. Senior, M. M.; Jones, R. A.; Breslauer, K. J.; Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1988 85, 6242-6246.
32. Hogrefe, R. I.; Vaghefi, M. M.; Reynolds, M. A.; Young, K. M.; Arnold Jr, L. J.; Nucleic Acids Res. 1993 21 2031-2038.
33. Petersheim, M.; Turner, D. H.; Biochemistry 1983 22, 256-263. Puglisi, J. D.; Tinoco Jr, I.; Methods in Enzymology 1989 180, 304-325.
34. Petersheim, M.; Turner, D. H.; Biochemistry 1983 22, 256-263. Puglisi, J. D.; Tinoco Jr, I.; Methods in Enzymology 1989 180, 304-325.