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Selected examples: (a) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4032-4033. (b) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Org. Chem. 1992, 57, 3225-3230. (c) Koh, J. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1470-1478. (d) Priestley, E. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4761-4765. (e) Xiang, G.; Soussou, W.; McLaughlin, L. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11155-11156. (f) Berressem, R.; Engels, J. W. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3465-3472. (g) Xiang, G.; Bogacki, R.; McLaughlin, L. W. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1963-1970. (h) Miller, P. S.; Bhan, P.; Cushman, C. D.; Trapane, T. L. Biochemistry 1992, 31, 6788-6793. (i) Jetter, M. C.; Hobbs, F. W. Biochemistry 1993, 32, 3249-3254. (k) Davison, E. C.; Johnsson, K. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 237-243. (l) Young, S. L.; Krawczyk, S. H.; Matteucci, M. D.; Toole, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 10023-10026. (m) Krawczyk, S. H.; Milligan, J. F.; Wadwani, S.; Moulds, C.; Froehler, B. C.; Matteucci, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 3761-3764. (n) Hunziker, J.; Priestley, E. S.; Brunar, H.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2661-2662. (o) von Krosigk, U.; Benner, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5361-5362.
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(1993)
Nucleosides Nucleotides
, vol.12
, pp. 237-243
-
-
Davison, E.C.1
Johnsson, K.2
-
17
-
-
0025836751
-
-
Selected examples: (a) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4032-4033. (b) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Org. Chem. 1992, 57, 3225-3230. (c) Koh, J. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1470-1478. (d) Priestley, E. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4761-4765. (e) Xiang, G.; Soussou, W.; McLaughlin, L. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11155-11156. (f) Berressem, R.; Engels, J. W. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3465-3472. (g) Xiang, G.; Bogacki, R.; McLaughlin, L. W. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1963-1970. (h) Miller, P. S.; Bhan, P.; Cushman, C. D.; Trapane, T. L. Biochemistry 1992, 31, 6788-6793. (i) Jetter, M. C.; Hobbs, F. W. Biochemistry 1993, 32, 3249-3254. (k) Davison, E. C.; Johnsson, K. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 237-243. (l) Young, S. L.; Krawczyk, S. H.; Matteucci, M. D.; Toole, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 10023-10026. (m) Krawczyk, S. H.; Milligan, J. F.; Wadwani, S.; Moulds, C.; Froehler, B. C.; Matteucci, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 3761-3764. (n) Hunziker, J.; Priestley, E. S.; Brunar, H.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2661-2662. (o) von Krosigk, U.; Benner, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5361-5362.
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, vol.88
, pp. 10023-10026
-
-
Young, S.L.1
Krawczyk, S.H.2
Matteucci, M.D.3
Toole, J.J.4
-
18
-
-
0026517296
-
-
Selected examples: (a) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4032-4033. (b) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Org. Chem. 1992, 57, 3225-3230. (c) Koh, J. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1470-1478. (d) Priestley, E. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4761-4765. (e) Xiang, G.; Soussou, W.; McLaughlin, L. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11155-11156. (f) Berressem, R.; Engels, J. W. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3465-3472. (g) Xiang, G.; Bogacki, R.; McLaughlin, L. W. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1963-1970. (h) Miller, P. S.; Bhan, P.; Cushman, C. D.; Trapane, T. L. Biochemistry 1992, 31, 6788-6793. (i) Jetter, M. C.; Hobbs, F. W. Biochemistry 1993, 32, 3249-3254. (k) Davison, E. C.; Johnsson, K. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 237-243. (l) Young, S. L.; Krawczyk, S. H.; Matteucci, M. D.; Toole, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 10023-10026. (m) Krawczyk, S. H.; Milligan, J. F.; Wadwani, S.; Moulds, C.; Froehler, B. C.; Matteucci, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 3761-3764. (n) Hunziker, J.; Priestley, E. S.; Brunar, H.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2661-2662. (o) von Krosigk, U.; Benner, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5361-5362.
-
(1992)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA
, vol.89
, pp. 3761-3764
-
-
Krawczyk, S.H.1
Milligan, J.F.2
Wadwani, S.3
Moulds, C.4
Froehler, B.C.5
Matteucci, M.D.6
-
19
-
-
0028986580
-
-
Selected examples: (a) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4032-4033. (b) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Org. Chem. 1992, 57, 3225-3230. (c) Koh, J. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1470-1478. (d) Priestley, E. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4761-4765. (e) Xiang, G.; Soussou, W.; McLaughlin, L. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11155-11156. (f) Berressem, R.; Engels, J. W. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3465-3472. (g) Xiang, G.; Bogacki, R.; McLaughlin, L. W. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1963-1970. (h) Miller, P. S.; Bhan, P.; Cushman, C. D.; Trapane, T. L. Biochemistry 1992, 31, 6788-6793. (i) Jetter, M. C.; Hobbs, F. W. Biochemistry 1993, 32, 3249-3254. (k) Davison, E. C.; Johnsson, K. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 237-243. (l) Young, S. L.; Krawczyk, S. H.; Matteucci, M. D.; Toole, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 10023-10026. (m) Krawczyk, S. H.; Milligan, J. F.; Wadwani, S.; Moulds, C.; Froehler, B. C.; Matteucci, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 3761-3764. (n) Hunziker, J.; Priestley, E. S.; Brunar, H.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2661-2662. (o) von Krosigk, U.; Benner, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5361-5362.
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Hunziker, J.1
Priestley, E.S.2
Brunar, H.3
Dervan, P.B.4
-
20
-
-
0029137887
-
-
Selected examples: (a) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4032-4033. (b) Ono, A.; Ts'o, P. O. P.; Kan, L.-S. J. Org. Chem. 1992, 57, 3225-3230. (c) Koh, J. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1470-1478. (d) Priestley, E. S.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4761-4765. (e) Xiang, G.; Soussou, W.; McLaughlin, L. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11155-11156. (f) Berressem, R.; Engels, J. W. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 3465-3472. (g) Xiang, G.; Bogacki, R.; McLaughlin, L. W. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1963-1970. (h) Miller, P. S.; Bhan, P.; Cushman, C. D.; Trapane, T. L. Biochemistry 1992, 31, 6788-6793. (i) Jetter, M. C.; Hobbs, F. W. Biochemistry 1993, 32, 3249-3254. (k) Davison, E. C.; Johnsson, K. Nucleosides Nucleotides 1993, 12, 237-243. (l) Young, S. L.; Krawczyk, S. H.; Matteucci, M. D.; Toole, J. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 10023-10026. (m) Krawczyk, S. H.; Milligan, J. F.; Wadwani, S.; Moulds, C.; Froehler, B. C.; Matteucci, M. D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1992, 89, 3761-3764. (n) Hunziker, J.; Priestley, E. S.; Brunar, H.; Dervan, P. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2661-2662. (o) von Krosigk, U.; Benner, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5361-5362.
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-
Von Krosigk, U.1
Benner, S.A.2
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22
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0028288325
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Pudlo, J.S.1
Wadwani, S.2
Milligan, J.F.3
Matteucci, M.D.4
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0013395689
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25
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-
-
Hildbrand, S.; Leumann C. Angew. Chem. 1996, 108, 2100-2102; Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1996, 35, 1968-1970.
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Angew. Chem., Int. Ed. Engl.
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26
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-
-
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Nucleic Acids Res.
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-
-
Bates, P.J.1
Laughton, C.A.2
Jenkins, T.C.3
Capaldi, D.C.4
Roselt, P.D.5
Reese, C.B.6
Neidle, S.7
-
27
-
-
1842353524
-
-
note
-
OMe previously were unknown.
-
-
-
-
29
-
-
0001858114
-
-
Timpe, W.; Dax, K.; Wolf, N.; Weidmann, H. Carbohydr. Res. 1975, 39, 53-60.
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Carbohydr. Res.
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Timpe, W.1
Dax, K.2
Wolf, N.3
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31
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0026605818
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Krohn, K.1
Heins, H.2
Wielckens, K.3
-
32
-
-
0026029434
-
-
2O quenching after the addition step. See also: Piccirilli, J. A.; Krauch, T.; MacPherson, L. J.; Benner, S. A. Helv. Chim. Acta 1991, 74, 397-406.
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-
Piccirilli, J.A.1
Krauch, T.2
MacPherson, L.J.3
Benner, S.A.4
-
33
-
-
1842264840
-
-
note
-
This reagent was used, because standard conditions for the introduction of the p-tolylthioformate residue resulted in a loss of the phenoxyacetyl group in 6b during the reaction.
-
-
-
-
34
-
-
0001687673
-
-
(a) Sinha, N. D.; Biernat, J.; Köster, H. Tetrahedron Lett. 1983, 24, 5843.
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(1983)
Tetrahedron Lett.
, vol.24
, pp. 5843
-
-
Sinha, N.D.1
Biernat, J.2
Köster, H.3
-
35
-
-
1842383314
-
-
note
-
(b) Users Manual (56-1111-56) "Gene Assembler Special / 4 Primers" from Pharmacia.
-
-
-
-
36
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-
0003880161
-
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Garland: New York
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Alberts, B.; Bray, D.; Lewis, J.; Raff, M.; Roberts, K.; Watson, J. D. Molecular Biology of the Cell, 3rd ed.; Garland: New York, 1994; p 508.
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(1994)
Molecular Biology of the Cell, 3rd Ed.
, pp. 508
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Alberts, B.1
Bray, D.2
Lewis, J.3
Raff, M.4
Roberts, K.5
Watson, J.D.6
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37
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0029883304
-
-
and references cited therein
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Brunar, H.; Dervan, P. B. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 1987-1991 and references cited therein.
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(1996)
Nucleic Acids Res.
, vol.24
, pp. 1987-1991
-
-
Brunar, H.1
Dervan, P.B.2
-
38
-
-
1842345605
-
-
note
-
20 was not successful due to increased DNase I activity on either edges of the bound third strand, which may be due to sequence composition effects still not fully understood.
-
-
-
-
39
-
-
0022437260
-
-
Brenowitz, M.; Senear, D. F.; Shea, M. A.; Ackers, G. K. Methods Enzymol. 1986, 130, 132-181.
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(1986)
Methods Enzymol.
, vol.130
, pp. 132-181
-
-
Brenowitz, M.1
Senear, D.F.2
Shea, M.A.3
Ackers, G.K.4
-
40
-
-
0345706517
-
-
De Mesmaeker, A.; Häner, R.; Martin, P.; Moser, H. E. Acc. Chem. Res. 1995, 28, 366-374.
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(1995)
Acc. Chem. Res.
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, pp. 366-374
-
-
De Mesmaeker, A.1
Häner, R.2
Martin, P.3
Moser, H.E.4
-
41
-
-
0021769970
-
-
(a) Lee, J. S.; Woodsworth, M. L.; Latimer, L. J. P.; Morgan, A. R. Nucleic Acids Res. 1984, 12, 6603-6614.
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(1984)
Nucleic Acids Res.
, vol.12
, pp. 6603-6614
-
-
Lee, J.S.1
Woodsworth, M.L.2
Latimer, L.J.P.3
Morgan, A.R.4
-
43
-
-
0025997454
-
-
(c) Xodo, L. E.; Manzini, G.; Quadrifoglio, F.; van der Marel, G. A.; van Boom, J. H. Nucleic Acids Res. 1991, 19, 5625-5631.
-
(1991)
Nucleic Acids Res.
, vol.19
, pp. 5625-5631
-
-
Xodo, L.E.1
Manzini, G.2
Quadrifoglio, F.3
Van Der Marel, G.A.4
Van Boom, J.H.5
-
44
-
-
0025604606
-
-
(d) Plum, G. E.; Park, Y.-W.; Singleton, S. F.; Dervan, P. B.; Breslauer, K. J. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1990, 87, 9436-9440.
-
(1990)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA.
, vol.87
, pp. 9436-9440
-
-
Plum, G.E.1
Park, Y.-W.2
Singleton, S.F.3
Dervan, P.B.4
Breslauer, K.J.5
-
45
-
-
0026590969
-
-
Shimizu, M.; Konishi, A.; Shimada, Y.; Inoue, H.; Ohtsuka, E. FEBS Lett. 1992, 302, 155-158.
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(1992)
FEBS Lett.
, vol.302
, pp. 155-158
-
-
Shimizu, M.1
Konishi, A.2
Shimada, Y.3
Inoue, H.4
Ohtsuka, E.5
-
46
-
-
1842276593
-
-
note
-
7 (25) Although there exists a possibility to escape the steric repulsion by propeller twisting of the base pair this would most probably not be tolerated due to steric clash with the base pairs above and below in the stack.
-
-
-
-
48
-
-
0030795715
-
-
Marfurt, J.; Parel, S. P.; Leumann, C. Nucleic Acids Res. 1997, 25, 1875-1882.
-
(1997)
Nucleic Acids Res.
, vol.25
, pp. 1875-1882
-
-
Marfurt, J.1
Parel, S.P.2
Leumann, C.3
|