메뉴 건너뛰기




Volumn 12, Issue 13, 1998, Pages 499-506

A toy model for understanding the conceptual framework of protein folding: Rubik's magic snake model

(1)  Iguchi, Kazumoto a  

a NONE   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords


EID: 0009540604     PISSN: 02179849     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1142/S0217984998000603     Document Type: Article
Times cited : (3)

References (35)
  • 1
    • 0003932766 scopus 로고
    • Freeman, New York
    • T. E. Creighton, Proteins (Freeman, New York, 1993). G. E. Schulz and R. H. Schirmer, Principles of Protein Structure (Springer-Verlag, New York, 1979).
    • (1993) Proteins
    • Creighton, T.E.1
  • 5
    • 1842699725 scopus 로고
    • Physics from proteins
    • ed. L. Peliti Plenum Press, New York
    • H. Frauenfelder et al., "Physics from proteins" in Biologically Inspired Physics, ed. L. Peliti (Plenum Press, New York, 1991).
    • (1991) Biologically Inspired Physics
    • Frauenfelder, H.1
  • 6
    • 0022423920 scopus 로고
    • K. A. Dill, Biochemistry 24, 1501 (1985); ibid. 29, 7133 (1990); H. S. Chan and K. A. Dill, Physics Today (Feb.), 24 (1993); and references therein.
    • (1985) Biochemistry , vol.24 , pp. 1501
    • Dill, K.A.1
  • 7
    • 0025370815 scopus 로고
    • K. A. Dill, Biochemistry 24, 1501 (1985); ibid. 29, 7133 (1990); H. S. Chan and K. A. Dill, Physics Today (Feb.), 24 (1993); and references therein.
    • (1990) Biochemistry , vol.29 , pp. 7133
  • 8
    • 0022423920 scopus 로고
    • Feb. and references therein
    • K. A. Dill, Biochemistry 24, 1501 (1985); ibid. 29, 7133 (1990); H. S. Chan and K. A. Dill, Physics Today (Feb.), 24 (1993); and references therein.
    • (1993) Physics Today , pp. 24
    • Chan, H.S.1    Dill, K.A.2
  • 9
    • 0009475489 scopus 로고    scopus 로고
    • S. Takahashi et al., Nature Str. Biol. 4, 45 (1997); S.-R. Yeh et al., Nature Str. Biol. 4, 51 (1997); and references therein.
    • (1997) Nature Str. Biol. , vol.4 , pp. 45
    • Takahashi, S.1
  • 10
    • 0031027088 scopus 로고    scopus 로고
    • and references therein
    • S. Takahashi et al., Nature Str. Biol. 4, 45 (1997); S.-R. Yeh et al., Nature Str. Biol. 4, 51 (1997); and references therein.
    • (1997) Nature Str. Biol. , vol.4 , pp. 51
    • Yeh, S.-R.1
  • 11
    • 0017309766 scopus 로고
    • M. Levitt and C. Chothia, Nature 261, 552 (1976); J. U. Bowie et al., Science 253, 164 (1991); C. Chothia, Nature 357, 543 (1992); J. U. Bowie and D. Eisenberg, Curr. Opin. Struc. Biol. 3, 437 (1993); M. Wilmanns and D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1379 (1993).
    • (1976) Nature , vol.261 , pp. 552
    • Levitt, M.1    Chothia, C.2
  • 12
    • 0025830469 scopus 로고
    • M. Levitt and C. Chothia, Nature 261, 552 (1976); J. U. Bowie et al., Science 253, 164 (1991); C. Chothia, Nature 357, 543 (1992); J. U. Bowie and D. Eisenberg, Curr. Opin. Struc. Biol. 3, 437 (1993); M. Wilmanns and D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1379 (1993).
    • (1991) Science , vol.253 , pp. 164
    • Bowie, J.U.1
  • 13
    • 0027122748 scopus 로고
    • M. Levitt and C. Chothia, Nature 261, 552 (1976); J. U. Bowie et al., Science 253, 164 (1991); C. Chothia, Nature 357, 543 (1992); J. U. Bowie and D. Eisenberg, Curr. Opin. Struc. Biol. 3, 437 (1993); M. Wilmanns and D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1379 (1993).
    • (1992) Nature , vol.357 , pp. 543
    • Chothia, C.1
  • 14
    • 0027255322 scopus 로고
    • M. Levitt and C. Chothia, Nature 261, 552 (1976); J. U. Bowie et al., Science 253, 164 (1991); C. Chothia, Nature 357, 543 (1992); J. U. Bowie and D. Eisenberg, Curr. Opin. Struc. Biol. 3, 437 (1993); M. Wilmanns and D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1379 (1993).
    • (1993) Curr. Opin. Struc. Biol. , vol.3 , pp. 437
    • Bowie, J.U.1    Eisenberg, D.2
  • 15
    • 0027458885 scopus 로고
    • M. Levitt and C. Chothia, Nature 261, 552 (1976); J. U. Bowie et al., Science 253, 164 (1991); C. Chothia, Nature 357, 543 (1992); J. U. Bowie and D. Eisenberg, Curr. Opin. Struc. Biol. 3, 437 (1993); M. Wilmanns and D. Eisenberg, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1379 (1993).
    • (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.90 , pp. 1379
    • Wilmanns, M.1    Eisenberg, D.2
  • 16
    • 0019860994 scopus 로고
    • M. Gō, Nature 290, 90 (1981); Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1964 (1983); M. Gō and M. Nosaka, Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 52, 915 (1987); C. Titiger et al., Nature 361, 470 (1993).
    • (1981) Nature , vol.290 , pp. 90
    • Go, M.1
  • 17
    • 0020742670 scopus 로고
    • M. Gō, Nature 290, 90 (1981); Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1964 (1983); M. Gō and M. Nosaka, Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 52, 915 (1987); C. Titiger et al., Nature 361, 470 (1993).
    • (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA , vol.80 , pp. 1964
  • 18
    • 0023468863 scopus 로고
    • M. Gō, Nature 290, 90 (1981); Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1964 (1983); M. Gō and M. Nosaka, Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 52, 915 (1987); C. Titiger et al., Nature 361, 470 (1993).
    • (1987) Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. , vol.52 , pp. 915
    • Go, M.1    Nosaka, M.2
  • 19
    • 0027413320 scopus 로고
    • M. Gō, Nature 290, 90 (1981); Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 1964 (1983); M. Gō and M. Nosaka, Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 52, 915 (1987); C. Titiger et al., Nature 361, 470 (1993).
    • (1993) Nature , vol.361 , pp. 470
    • Titiger, C.1
  • 20
    • 0028174310 scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1994) Nature , vol.369 , pp. 248
    • Sali, A.1
  • 21
    • 4243392673 scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1994) Phys. Rev. Lett. , vol.72 , pp. 3907
    • Shaknovich, E.I.1
  • 22
    • 0028924552 scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1995) Science , vol.267 , pp. 1619
    • Wolynes, P.G.1
  • 23
    • 0001209011 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1996) Phys. Rev. Lett. , vol.76 , pp. 4861
    • Wang, J.1
  • 24
    • 0037825814 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1996) Phys. Rev. Lett. , vol.77 , pp. 779
    • Lindgård, P.-A.1    Bohr, H.2
  • 25
    • 0029772552 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1996) Science , vol.273 , pp. 666
    • Li, H.1
  • 26
    • 7044220745 scopus 로고    scopus 로고
    • "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083;
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.79 , pp. 765
  • 27
    • 0345973041 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.79 , pp. 3090
    • Haliloglu, T.1
  • 28
    • 0000247635 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.79 , pp. 3530
    • Bussemaker, H.J.1
  • 29
    • 0000329743 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1997) Phys. Rev. Lett. , vol.79 , pp. 3534
    • Nelson, E.D.1
  • 30
    • 0000823682 scopus 로고    scopus 로고
    • A. Sali et al., Nature 369, 248 (1994); E. I. Shaknovich, Phys. Rev. Lett. 72, 3907 (1994); P. G. Wolynes et al., Science 267, 1619 (1995); J. Wang et al., Phys. Rev. Lett. 76, 4861 (1996); P.-A. Lindgård and H. Bohr, Phys. Rev. Lett. 77, 779 (1996); H. Li et al., Science 273, 666 (1996); Phys. Rev. Lett. 79, 765 (1997); "Are protein folds atypical?", cond-mat/9709083; T. Haliloglu et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3090 (1997); H. J. Bussemaker et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3530 (1997); E. D. Nelson et al., Phys. Rev. Lett. 79, 3534 (1997); C. Micheletti et al., Phys. Rev. Lett. 80, 2237 (1998).
    • (1998) Phys. Rev. Lett. , vol.80 , pp. 2237
    • Micheletti, C.1
  • 31
    • 85034462654 scopus 로고    scopus 로고
    • Tsukuda Original, Tokyo
    • This is a toy for kids, which was invented by Rubik who once created the famous Rubik cube. E. Rubik, Magic Snake (Tsukuda Original, Tokyo, 1996).
    • (1996) Magic Snake
    • Rubik, E.1
  • 35
    • 85034481108 scopus 로고    scopus 로고
    • This point will be discussed elsewhere
    • This point will be discussed elsewhere.


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.