Quantum nuclear ab Initio molecular dynamics study of water wires

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 102, Issue 50, 1998, Pages 10446-10458

  Mei, Hsiao S ^a   Tuckerman, Mark E ^b   Sagnella, Diane E ^c   Klein, Michael L ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

^b NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

^c Boston University   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001557630     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp982623t     Document Type: Article

References (75)

1. Copeland, R. A.; Chan, S. I. Annu. Rev. Phys. Chem. 1989, 40, 671.
2. Rawn, J. D. Biochemistry; Neil Patterson Publishers: Burlington, NC, 1989.
3. Nagle, J. F.; Tristram-Nagle, S. J. Member. Biol. 1983, 74, 1.
4. Stowell, M. H. B.; Mcphillips, T. M.; Rees, D. C.; Soltis, S. M.; Abresch, E.; Feher, G. Science 1997, 276, 812.
5. Lancaster, C. R. D.; Michel, H. Photosynth, Res. 1996, 48, 65.
6. Ermler, U.; Fritzsch, G.; Buchanan, S. K.; Michel, H. Structure 1992, 10, 925.
7. Deisenhofer, J.; Epp, O.; Sinning, I.; Michel, H. J. Mol. Biol. 1995, 246, 429.
8. Baciou, L.; Michel, H. Biochemistry 1995, 34, 7967.
9. Hille, B. Ionic Channels of Excitable Membranes; Sinauer: Sunderland, MA, 1984.
10. Martinez, S. E.; Huang, D.; Ponomarev, M.; Cramer, W. A.; Smith, J. L., Protein Sci. 1996, 5, 1081.
11. Papadopoulos, G.; Dencher, N. A. Zaccaï, G.; G. Büldt, J. Mol. Biol. 1990, 214, 15.
12. Akeson, M.; Deamer, D. W. Biophys. J. 1991, 60, 101.
13. Deamer, D. W.; Akeson, M. Adv. Chem. Ser. 1995, 235, 41.
14. Pebay-Peyroula, E.; Rummel, G.; Rosenbusch, J. P.; Landau, E. Science 1997, 277, 1676.
15. Pomès, R.; Roux, B. Chem. Phys. Lett. 1995, 234, 416.
16. Pomès, R.; Roux, B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2519.
17. Drukker, K.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1997, 107, 363.
18. Decomez, H.; Drukker, K.; Hurley, M. M.; Hammes-Schiffer, S. Ber. Bunsen-Ges. Phys. Chem. 1998, 102, 533.
19. Chiu, S.-W.; Subramaniam, S.; Jakobsson, E.; McCammon, J. A. Biophys. J. 1989, 56, 253.
20. Pomès, R.; Roux, B. Biophys. J. 1996, 70, A263.
21. Pomès, R.; Roux, B. Biophys. J. 1996, 71, 19.
22. Sagnella, D. E.; Voth., G. A. Biophys. J. 1996, 70, 2043.
23. Sagnella, D E.; Laasonen, K.; Klein, M. L. Biophys. J. 1996, 71, 1172.
24. Roux, B.; Karplus, M. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1994, 23, 731.
25. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
26. Stillinger, F. H.; David, C. W. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1473
27. Weber, T. A.; Stillinger, F. H. J. Phys. Chem. 1982, 86, 1314.
28. Halley, J. W.; Rustad, J. R.; Rahman, A. J. Chem. Phys. 1993, 98, 4110.
29. Tuckerman, M. E.; Marx, D.; Klein, M. L.; Parrinello, M. Science 1997, 275, 817.
30. Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M.; Car, R. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9081.
31. Sprik, M.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1142.
32. Tuckerman, M.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. 1995, 99, 5749.
33. Tuckerman, M.; Lassonen, K.; Parrinello, M. J Chem. Phys. 1995, 103, 150.
34. Soper, A. K.; Bruni, F.; Ricci, M. A. J. Chem. Phys. 1997, 106, 247.
35. Soper, A. K. Chem. Phys 1986, 107, 47.
36. Meibroom, S. J. Chem. Phys. 1961, 34, 375.
37. Feynman, R. P. Statistical Mechanics; Benjamin: Reading, MA, 1972.
38. Feynman, R. P.; Hibbs, A. R. Quantum Mechanics and Path Integrals: McGraw-Hill: New York, 1965.
39. Marx, D.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1996, 104, 4077.
40. Tuckerman, M. E.; Marx, D.; Klein, M. L.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1996, 104, 5579.
41. Tuckerman, M. E.; Ungar, P. J.; von Rosenvinge, T.; Klein, M. L. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11878.
42. von Rosenvinge, T.; Tuckerman, M. E.; Klein, M. L. J. Chem. Soc., Faraday Disscuss. 1997, 106, 279.
43. Benoit, M.; Marx, D.; parrinello, M. Comp. Mater. Sci. 1998, 10, 88.
44. Benoit, M.; Marx, D.; Parrinello, M. Nature 1998, 392, 258.
45. Rousseau, R.; Marx, D. Phys. Rev. Lett. 1988, 80, 2574.
46. Marx, D.; Parrinello, M. Nature (London) 1995, 375, 216.
47. Marx, D.; Parrinello, M. Science 1996, 271, 179.
48. Hohenberg, P.; Kohn, W. Phys. Rev. B 1964, 136, 864.
49. Kohn, W.; Sham, L. J. Phys. Rev. B 1965, 140, 1133.
50. Stich, I.; Car, R.; Parrinello, M.; Baroni, S. Phys. Rev. B 1989, 39, 4997.
51. Galli, G.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1992, 24, 3547.
52. Mauri, F.; Galli, G. Phys. Rev. B 1994, 50, 4316.
53. Tuckerman, M. E.; Patrinello, M. J. Chem. Phys. 1994, 101, 1302, 1316.
54. Martyna, G. J.; Klein, M. L. Submitted to J. Chem. Phys.
55. Martyna, G. J.; Klein, M. L. Submitted to J. Chem. Phys.
56. Sprink, M. J. Chem. Phys. 1991, 95, 2283.
57. Blöchl, P. E.; Parrinello, M. Phys. Rev. B 1992, 45, 9413.
58. Marx, D.; Parrinello, M. Phys. Rev. B (Rapid Note) 1994, 95, 413.
59. Parrinello, M.; Rahman, A. J. Chem. Phys. 1984, 80, 860.
60. de Raedt, B.; Sprink, M.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1985, 80, 5719.
61. Hall, R. W.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3641.
62. Tuckerman, M. E.; Berne, B. J.; Martyna, G. J.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2635.
63. Pollock, E. L.; Ceperley, D. M. Phys. Rev. B 1984, 30, 2555.
64. Sprik, M.; Klein, M.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1985, 83, 3942.
65. Sprik, M.; Klein, M.; Chandler, D. Phys Rev. B 1985, 31, 4234.
66. Coker, D. F.; Thirumalai, D.; Berne, B. J. J. Chem. Phys. 1987, 86, 5689.
67. Barnett, R. N.; Landman, U. Phys. Rev. B 1993, 48, 2081.
68. Kohn, W.; Becke, A. D.; Parr, G. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12974.
69. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
70. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
71. Xie, Y.; Remington, R. B.; Schaefer, H. F., III. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4878.
72. Troullier, N.; Martins, J. L. Phys. Rev. B 1991, 43, 1993.
73. Sagnella, D. E.; Tuckerman, M. E. J. Chem. Phys. 1998, 108, 2073.
74. Warshel, A.; Weiss, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 6218.
75. Flyvbjerg, H.; Petersen, H. G. J. Chem. Phys. 1989, 91, 461.