Ab initio investigation of the structural and electronic differences between active-site models of [NiFe] and [NiFeSe] hydrogenases

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 73, Issue 2, 1999, Pages 187-195

  De Gioia, L ^a,c   Fantucci, P ^a   Guigliarelli, B ^b   Bertrand, P ^b  

^a CNR   (Italy)

^b AIX MARSEILLE UNIVERSITÉ   (France)

^c UNIVERSITY OF MILAN   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001217115     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1999)73:2<187::AID-QUA12>3.0.CO;2-X     Document Type: Article

References (44)

1. Albracht, S. P. J. Biochim Biophys Acta 1994, 1188, 167.
2. Adams, M. W. W. Biochim Biophys Acta 1990, 1020, 115.
3. Volbeda, A.; Charon, M.-H.; Pirs, C.; Hatchikian, E. C.; Frey, M.; Fontecilla-Camps, J. C. Nature 1995, 373, 580.
4. Happe, R. P.; Roseboom, W.; Bagley, K. A.; Pierik, A. J.; Albracht, S. P. J. Nature 1997, 385, 126.
5. Rousset, M.; Montet, Y.; Guigliarelli, B.; Forget, N.; Asso, M.; Bertrand, P.; Fontecilla-Camps, J.; Hatchikian, E. C. Proc Natl Acad Sci USA 1998, 95, 21625.
6. Albracht, S. P. J.; Kalkman, M. L.; Slater, E. C. Biochim Biophys Acta 1983, 724, 309; LeGall, J.; Ljungdahl, P. O.; Moura, I.; Peck, H. D., Jr.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G.; Teixeira, M.; Huynh, B. H.; DerVartanian, D. V. Biochim Biophys Res Commun 1982, 106, 610; Guigliarelli, B.; More, C.; Fournel, A.; Asso, M.; Hatchikian, E. C.; Williams, R.; Cammack, R.; Bertrand, P. Biochemistry 1995, 34, 4781.
7. Albracht, S. P. J.; Kalkman, M. L.; Slater, E. C. Biochim Biophys Acta 1983, 724, 309; LeGall, J.; Ljungdahl, P. O.; Moura, I.; Peck, H. D., Jr.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G.; Teixeira, M.; Huynh, B. H.; DerVartanian, D. V. Biochim Biophys Res Commun 1982, 106, 610; Guigliarelli, B.; More, C.; Fournel, A.; Asso, M.; Hatchikian, E. C.; Williams, R.; Cammack, R.; Bertrand, P. Biochemistry 1995, 34, 4781.
8. Albracht, S. P. J.; Kalkman, M. L.; Slater, E. C. Biochim Biophys Acta 1983, 724, 309; LeGall, J.; Ljungdahl, P. O.; Moura, I.; Peck, H. D., Jr.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G.; Teixeira, M.; Huynh, B. H.; DerVartanian, D. V. Biochim Biophys Res Commun 1982, 106, 610; Guigliarelli, B.; More, C.; Fournel, A.; Asso, M.; Hatchikian, E. C.; Williams, R.; Cammack, R.; Bertrand, P. Biochemistry 1995, 34, 4781.
9. Cammack, R.; Patil, D. S.; Hatchikian, E. C.; Fernandez, V. M. Biochim Biophys Acta 1987, 912, 98; Teixeira, M.; Moura, I.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G.; LeGall, J.; DerVartanian, D. V.; Peck, H. D.; Huyhn, B. H. J Biol Chem 1989, 264, 16435.
10. Cammack, R.; Patil, D. S.; Hatchikian, E. C.; Fernandez, V. M. Biochim Biophys Acta 1987, 912, 98; Teixeira, M.; Moura, I.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G.; LeGall, J.; DerVartanian, D. V.; Peck, H. D.; Huyhn, B. H. J Biol Chem 1989, 264, 16435.
11. Fontecilla-Camps, J. C. J Biol Inorg Chem 1996, 1, 91.
12. Choudhury, S. B.; Pressler, M. A.; Mirza, S. A.; Day, R. O.; Maroney, M. J. Inorg Chem 1994, 33, 4831.
13. Dole, F.; Fournel, A.; Magro, V.; Hatchikian, E. C.; Bertrand, P.; Guigliarelli, B. Biochemistry 1997, 36, 7847.
14. Huyett, J. E.; Carepo, M.; Pamplona, A.; Franco, R.; Moura, J.; Moura, J. J. G.; Hoffman, B. M. J Am Chem Soc 1997, 119, 9291.
15. De Gioia, L.; Fantucci, P.; Guigliarelli, B.; Bertrand, P. submitted for publication.
16. Gu, Z.; Dong, J.; Allan, C. B.; Choudhury, S. B.; Franco, R.; Moura, J. J. G.; LeGall, J.; Przybyla, A. E.; Roseboom, W.; Albracht, S. P. J.; Axley, M. J.; Scott, R. A.; Maroney, M. J. J Am Chem Soc 1996, 118, 11155.
17. Bagyinka, C.; Whitehead, J. P.; Maroney, M. J. J Am Chem Soc 1993, 115, 3576.
18. Fauque, G.; Peck, H. D., Jr.; Moura, J. J. G.; Huyhn, B. H.; Berlier, Y.; Der Vartanian, D. V.; Teixeira, M.; Przybyla, A. E.; Lespinat, P. A.; Moura, I.; LeGall, J. FEMS Microbiol Rev 1988, 4, 299.
19. Teixeira, M.; Fauque, G.; Moura, I.; Lespinat, P. A.; Berlier, Y.; Prickril, B.; Peck, H. D., Jr.; Xavier, A. V.; LeGall, J.; Moura, J. J. Eur J Biochem 1987, 167, 47.
20. Teixeira, M.; Moura, I.; Fauque, G.; Czechowski, M.; Berlier, Y.; Lespinat, P. A.; LeGall, J.; Xavier, A. V.; Moura, J. J. G. Biochimie 1986, 68, 75.
21. Yamazaki, S. J Biol Chem 1982, 257, 7926.
22. Sorgenfrei, O.; Linder, D.; Karas, M.; Klein, A. Eur J Biochem 1993, 213, 1355.
23. (a) He, S. H.; Teixeira, M.; LeGall, J.; Patil, D. S.; Moura, I.; Moura, J. J. G.; DerVarranian, D. V.; Huynh, B. H.; Peck, H. D. J Biol Chem 1989, 264, 2678;
24. b) Sorgenfrei, O.; Klein, A.; Albracht, S. P. J. FEBS Lett 1993, 332, 291; Sorgenfrei, O.; Duin, E. C.; Klein, A.; Albracht, S. P. J. Eur J Biochem 1997, 247, 681.
25. b) Sorgenfrei, O.; Klein, A.; Albracht, S. P. J. FEBS Lett 1993, 332, 291; Sorgenfrei, O.; Duin, E. C.; Klein, A.; Albracht, S. P. J. Eur J Biochem 1997, 247, 681.
26. Voordouw, G. Adv Inorg Chem 1992, 38, 397.
27. Teixeira, M.; Moura, I.; Fauque, G.; Dervartanian, D. V.; Legall, J.; Peck, H. D.; Moura, J. J. G.; Huynh, B. H. Eur J Biochem 1990, 189, 381.
28. Pavlov, M.; Siegbahn, P. E. M.; Blomberg, M. R. A.; Crabtree, R. H. J Am Chem Soc 1998, 120, 548.
29. Roberts, L. M.; Lindahl, P. A. Biochemistry 1994, 33, 14339; de Lacey, A. L.; Hatchikian, E. C.; Volbeda, A.; Frey, M.; Fontecilla-Camps, J. C.; Fernandez, V. M. J Am Chem Soc 1997, 119, 7181.
30. Roberts, L. M.; Lindahl, P. A. Biochemistry 1994, 33, 14339; de Lacey, A. L.; Hatchikian, E. C.; Volbeda, A.; Frey, M.; Fontecilla-Camps, J. C.; Fernandez, V. M. J Am Chem Soc 1997, 119, 7181.
31. Noodleman, L.; Case, D. A. Adv Inorg Chem 1992, 38, 423.
32. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Keith, T. A.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. A.; Raghavachari, K.; Al-Laham, M. A.; Zakrzewski, V. G.; Ortiz, J. V.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Peng, C. Y.; Ayala, P. Y.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Replogle, E. S.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Binkley, J. S.; Defrees, D. J.; Baker, J.; Stewart, J. P.; Head-Gordon, M.; Gonzales, C.; Pople, J. A. Gaussian 94; Gaussian; Pittsburgh, PA, 1995.
33. Dunning, T. H., Jr.; Hay, P. J. In Modern Theoretical Chemistry; H F Schaefer III, Ed.; Plenum: New York, 1976; pp 1-28.
34. Hay, P. J.; Wadt, W. R. J Chem Phys 1985, 82, 270.
35. Lee, C; Yang, W.; Parr, R. G. Phys Rev B 1988, 37, 785; Becke, A. D. Phys Rev A 1988, 38, 3098.
36. Lee, C; Yang, W.; Parr, R. G. Phys Rev B 1988, 37, 785; Becke, A. D. Phys Rev A 1988, 38, 3098.
37. Garcin, E. Ph.D. thesis, Grenoble, France, 1998.
38. Marganian, C. A.; Vazir, H.; Baidya, N.; Olmstead, M. M.; Mascharak, P. K. J Am Chem Soc 1995, 117, 1584.
39. Reed, A. E.; Weinstock, R. B.; Weinhold, F. J. J Chem Phys 1985, 83, 735.
40. Vignais, P. M.; Dimon, B.; Zorin, N. A.; Colbeau, A.; Elsen, S. J Bacteriol 1997, 179, 290.
41. Gessner, C. Chem Phys Lett 1996, 256, 518-524.
42. Van der Zwann, J. W.; Coremans, J. M. C. C.; Bouwens, E. C. M.; Albracht, S. P. J. Biochim Biophys Acta 1990, 1041, 101; Medina, M.; Hatchikian, E. C.; Cammack, R. Biochim Biophys Acta 1996, 1275, 227.
43. Van der Zwann, J. W.; Coremans, J. M. C. C.; Bouwens, E. C. M.; Albracht, S. P. J. Biochim Biophys Acta 1990, 1041, 101; Medina, M.; Hatchikian, E. C.; Cammack, R. Biochim Biophys Acta 1996, 1275, 227.
44. Dole, F.; Medina, M.; More, C.; Cammack, R.; Bertrand, P.; Guigliarelli, B. Biochemistry 1996, 35, 36399.